قاعدة الطرف الأميني
قاعدة الطرف الأميني أو قاعدة الطرف (بالإنجليزية: N-End Rule ) تصف تأثير الطرف الأميني لبروتين على سرعة تحلله Proteolyse .
الخاصية عدل
يؤثر الطرف N الموجود في حمض أميني علي تحلله وتحلل البروتين. بتكوين البروتين تنشأ بروتينات جميع حقيقيات النوى أو البكتيريا القديمة Archaeen من ميثيونين كحمض أميني ابتدائي وبالتالي من فورميلميثيونين في البكتيريا. البروتينات الأخرى التي لها طرف أميني مختلف عن الميثيونين يمكنها التكون إما عن طريق التحلل البروتيني أو عن طريق نزع الميثيونين بواسطة محلل حمض أميني على أن يكون الحمض الأميني التالي: فالين، أو جليسين، أو برولين أو ألانين أو سيرين أو ثريونين أو سيستئين.[1] من بين تلك السبعة أحماض أمينية نجد السيستئين هو الذي يسبب تحللا سريعا للبروتين.[1]
اكتشاف القاعدة عدل
اكتشفت قاعدة الطرف الأميني من العالم «ألكسندر فارشافيكي» وفريق الباحثين العاملين معه في عام 1986.[2] والقاعدة تقول: أن الطرف اليميني لحمض أميني في بروتين يحدد عمر النصف (أي المعدل الزمني لتحلل نصف كمية بروتين معين). وتنطبق القاعدة على بروتينات البكتيريا القديمة وحقيقيات النوى، ولكن بسرعات مختلفة.[3] ومع ذلك فهي تحدد بطريقة تقريبية نصف عمر البروتين، حيث أن الطرف N في أنواع مختلفة من الأحماض الأمينية تتسبب في تغييرات وحالات شاذة أحيانا، بينما قد يتغير تأثير حمض أميني من كائن حي إلى آخر.
عمر النصف لأحماض أمينية ذات طرف أميني عدل
يعتمد عمر النصف على نوع الحمض الأميني وعلى الطرف N فيه. القائمة التالية تعطي بعض تلك أنصاف الأعمار لبروتينات تنتجها بكتيريا إشريكية قولونية وفطريات الخميرة.
معلم بالأخضر α-حمض أميني L-Lysin و معلمة بالأزرق بقية سلسلة البروتين حتى الطرف C .
معلم أخضر α-حمض أميني ذو طرف أميني L-Phenylalanin ومعلمة بالأزرق بقية سلسلة البروتين (يمين).
| الفصيلة | أحماض أمينية | عمر النصف | ||
| إشريكية قولونية إشريكية قولونية[4] |
|
| ||
| فطريات الخميرة (فطريات الخميرة)[4] |
|
| ||
| الثدييات[5] |
|
| ||
المراجع عدل
- ^ أ ب S. M. Sriram, R. Banerjee, R. S. Kane, Y. T. Kwon: Multivalency-assisted control of intracellular signaling pathways: application for ubiquitin- dependent N-end rule pathway. In: Chem Biol. (2009), Band 16(2), S. 121–131. دُوِي:10.1016/j.chembiol.2009.01.012. ببمد: 19246002; ببمد سنترال 2665046.
- ^ Bachmair A, Finley D, Varshavsky A. (1986). "In vivo half-life of a protein is a function of its amino-terminal residue". Science. ج. 234 ع. 4773: 179–186. DOI:10.1126/science.3018930. PMID:3018930.
- ^ Varshavsky A. (1997). "The N-end rule pathway of protein degradation". Genes to Cells. ج. 2 ع. 1: 13–28. DOI:10.1046/j.1365-2443.1997.1020301.x. PMID:9112437.
- ^ أ ب A. Varshavsky: The N-end rule pathway of protein degradation. In: Genes Cells. (1997), Band 2(1), S. 13–28. ببمد: 9112437. PDF. نسخة محفوظة 05 مارس 2016 على موقع واي باك مشين.
- ^ D. K. Gonda et al.: Universality and Structure of the N-end Rule. In: Journal of Biological Chemistry (1989), Band 264:28, S. 16700–16712, ببمد: 2506181.
