TDP1

TDP1
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	1JY1, 1MU7, 1MU9, 1NOP, 1QZQ, 1RFF, 1RFI, 1RG1, 1RG2, 1RGT, 1RGU, 1RH0
معرفات
أسماء بديلة	TDP1, tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 607198 MGI: MGI:1920036 HomoloGene: 5424 GeneCards: 55775
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية	• phosphoric diester hydrolase activity; • single-stranded DNA binding; • nuclease activity; • double-stranded DNA binding; • 3'-tyrosyl-DNA phosphodiesterase activity; • exonuclease activity; • ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني; • نشاط هيدرولاز;
مكونات خلوية	• سيتوبلازم; • غشاء خلوي; • intracellular membrane-bounded organelle; • نواة;
عمليات حيوية	• single strand break repair; • double-strand break repair; • ‏GO:0100026 ترميم الدنا; • nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis; • cellular response to DNA damage stimulus;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
	Q9NUW8
	Q8BJ37
	‏NM_001008744، ‏NM_018319، ‏XM_005267847، ‏XM_005267848، ‏XM_006720197، ‏XM_006720198، ‏XM_006720199، ‏XM_011536942، ‏XM_011536943، ‏XM_011536944، ‏XM_017021439، ‏XM_017021440، ‏XM_017021441، ‏XM_017021442، ‏XM_017021443، ‏XM_017021444، ‏XM_017021445، ‏XM_017021446، ‏XR_001750427، ‏NM_001330205 XR_943492، ‏NM_001008744، ‏NM_018319، ‏XM_005267847، ‏XM_005267848، ‏XM_006720197، ‏XM_006720198، ‏XM_006720199، ‏XM_011536942، ‏XM_011536943، ‏XM_011536944، ‏XM_017021439، ‏XM_017021440، ‏XM_017021441، ‏XM_017021442، ‏XM_017021443، ‏XM_017021444، ‏XM_017021445، ‏XM_017021446، ‏XR_001750427، ‏NM_001330205
	‏XM_006515364، ‏XM_030246506، ‏XM_030246507 NM_028354، ‏XM_006515364، ‏XM_030246506، ‏XM_030246507
	‏NP_001317134، ‏NP_060789، ‏XP_005267905، ‏XP_006720260، ‏XP_011535244، ‏XP_011535246، ‏XP_016876928، ‏XP_016876929، ‏XP_024305417، ‏XP_024305418، ‏XP_024305419، ‏XP_024305420، ‏XP_024305421، ‏XP_024305422، ‏XP_024305423، ‏XP_024305424، ‏XP_024305425، ‏XP_024305426، ‏XP_024305427 NP_001008744، ‏NP_001317134، ‏NP_060789، ‏XP_005267905، ‏XP_006720260، ‏XP_011535244، ‏XP_011535246، ‏XP_016876928، ‏XP_016876929، ‏XP_024305417، ‏XP_024305418، ‏XP_024305419، ‏XP_024305420، ‏XP_024305421، ‏XP_024305422، ‏XP_024305423، ‏XP_024305424، ‏XP_024305425، ‏XP_024305426، ‏XP_024305427
	n/a
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

TDP1‏ (Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين TDP1 في الإنسان.^[1]^[2]^[3]

الوظيفة عدل

الأهمية السريرية عدل

المراجع عدل

^ "Entrez Gene: TDP1 tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1". مؤرشف من الأصل في 2010-03-07.
^ Takashima H، Boerkoel CF، John J، Saifi GM، Salih MA، Armstrong D، Mao Y، Quiocho FA، Roa BB، Nakagawa M، Stockton DW، Lupski JR (سبتمبر 2002). "Mutation of TDP1, encoding a topoisomerase I-dependent DNA damage repair enzyme, in spinocerebellar ataxia with محور عصبي اعتلال الأعصاب المحيطية". Nat Genet. ج. 32 ع. 2: 267–72. DOI:10.1038/ng987. PMID:12244316.
^ Davies DR، Interthal H، Champoux JJ، Hol WG (فبراير 2002). "The crystal structure of human tyrosyl-DNA phosphodiesterase, Tdp1". Structure. ج. 10 ع. 2: 237–48. DOI:10.1016/S0969-2126(02)00707-4. PMID:11839309.

قراءة متعمقة عدل

El-Khamisy SF، Caldecott KW (2007). "TDP1-dependent DNA single-strand break repair and neurodegeneration". Mutagenesis. ج. 21 ع. 4: 219–24. DOI:10.1093/mutage/gel024. PMID:16775218.
Bonaldo MF، Lennon G، Soares MB (1997). "Normalization and subtraction: two approaches to facilitate gene discovery". Genome Res. ج. 6 ع. 9: 791–806. DOI:10.1101/gr.6.9.791. PMID:8889548.
Pouliot JJ، Yao KC، Robertson CA، Nash HA (1999). "Yeast gene for a Tyr-DNA phosphodiesterase that repairs topoisomerase I complexes". Science. ج. 286 ع. 5439: 552–5. DOI:10.1126/science.286.5439.552. PMID:10521354.
Interthal H، Pouliot JJ، Champoux JJ (2001). "The tyrosyl-DNA phosphodiesterase Tdp1 is a member of the phospholipase D superfamily". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 98 ع. 21: 12009–14. DOI:10.1073/pnas.211429198. PMC:59758. PMID:11572945.
Inamdar KV، Pouliot JJ، Zhou T، وآخرون (2002). "Conversion of phosphoglycolate to phosphate termini on 3' overhangs of DNA double strand breaks by the human tyrosyl-DNA phosphodiesterase hTdp1". J. Biol. Chem. ج. 277 ع. 30: 27162–8. DOI:10.1074/jbc.M204688200. PMID:12023295.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Davies DR، Interthal H، Champoux JJ، Hol WG (2003). "Insights into substrate binding and catalytic mechanism of human tyrosyl-DNA phosphodiesterase (Tdp1) from vanadate and tungstate-inhibited structures". J. Mol. Biol. ج. 324 ع. 5: 917–32. DOI:10.1016/S0022-2836(02)01154-3. PMID:12470949.
Strausberg RL، Feingold EA، Grouse LH، وآخرون (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 26: 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC:139241. PMID:12477932.
Heilig R، Eckenberg R، Petit JL، وآخرون (2003). "The DNA sequence and analysis of human chromosome 14". Nature. ج. 421 ع. 6923: 601–7. DOI:10.1038/nature01348. PMID:12508121.
Davies DR، Interthal H، Champoux JJ، Hol WG (2003). "Crystal structure of a transition state mimic for Tdp1 assembled from vanadate, DNA, and a topoisomerase I-derived peptide". Chem. Biol. ج. 10 ع. 2: 139–47. DOI:10.1016/S1074-5521(03)00021-8. PMID:12618186.
Ota T، Suzuki Y، Nishikawa T، وآخرون (2004). "Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs". Nat. Genet. ج. 36 ع. 1: 40–5. DOI:10.1038/ng1285. PMID:14702039.
Davies DR، Interthal H، Champoux JJ، Hol WG (2004). "Explorations of peptide and oligonucleotide binding sites of tyrosyl-DNA phosphodiesterase using vanadate complexes". J. Med. Chem. ج. 47 ع. 4: 829–37. DOI:10.1021/jm030487x. PMID:14761185.
Raymond AC، Rideout MC، Staker B، وآخرون (2004). "Analysis of human tyrosyl-DNA phosphodiesterase I catalytic residues". J. Mol. Biol. ج. 338 ع. 5: 895–906. DOI:10.1016/j.jmb.2004.03.013. PMID:15111055.
Yang M، Kirley TL (2004). "Site-directed mutagenesis of human soluble calcium-activated nucleotidase 1 (hSCAN-1): identification of residues essential for enzyme activity and the Ca(2+)-induced conformational change". Biochemistry. ج. 43 ع. 28: 9185–94. DOI:10.1021/bi049565o. PMID:15248776.
Gerhard DS، Wagner L، Feingold EA، وآخرون (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. ج. 14 ع. 10B: 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMC:528928. PMID:15489334.
Barthelmes HU، Habermeyer M، Christensen MO، وآخرون (2005). "TDP1 overexpression in human cells counteracts DNA damage mediated by topoisomerases I and II". J. Biol. Chem. ج. 279 ع. 53: 55618–25. DOI:10.1074/jbc.M405042200. PMID:15494395.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Zhou T، Lee JW، Tatavarthi H، وآخرون (2005). "Deficiency in 3'-phosphoglycolate processing in human cells with a hereditary mutation in tyrosyl-DNA phosphodiesterase (TDP1)". Nucleic Acids Res. ج. 33 ع. 1: 289–97. DOI:10.1093/nar/gki170. PMC:546157. PMID:15647511.
El-Khamisy SF، Saifi GM، Weinfeld M، وآخرون (2005). "Defective DNA single-strand break repair in spinocerebellar ataxia with axonal neuropathy-1". Nature. ج. 434 ع. 7029: 108–13. DOI:10.1038/nature03314. PMID:15744309.
Raymond AC، Staker BL، Burgin AB (2005). "Substrate specificity of tyrosyl-DNA phosphodiesterase I (Tdp1)". J. Biol. Chem. ج. 280 ع. 23: 22029–35. DOI:10.1074/jbc.M502148200. PMID:15811850.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)

هذه بذرة مقالة عن بروتين بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

[1] "Entrez Gene: TDP1 tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1". مؤرشف من الأصل في 2010-03-07.

[2] Takashima H، Boerkoel CF، John J، Saifi GM، Salih MA، Armstrong D، Mao Y، Quiocho FA، Roa BB، Nakagawa M، Stockton DW، Lupski JR (سبتمبر 2002). "Mutation of TDP1, encoding a topoisomerase I-dependent DNA damage repair enzyme, in spinocerebellar ataxia with محور عصبي اعتلال الأعصاب المحيطية". Nat Genet. ج. 32 ع. 2: 267–72. DOI:10.1038/ng987. PMID:12244316.

[3] Davies DR، Interthal H، Champoux JJ، Hol WG (فبراير 2002). "The crystal structure of human tyrosyl-DNA phosphodiesterase, Tdp1". Structure. ج. 10 ع. 2: 237–48. DOI:10.1016/S0969-2126(02)00707-4. PMID:11839309.

[1]

[2]

[3]