ALYREF

ALYREF
التراكيب المتوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	3ULH
المعرفات
الأسماء المستعارة	ALYREF, ALY, ALY/REF, BEF, REF, THOC4, Aly/REF export factor
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 604171 HomoloGene: 134554 GeneCards: 10189
علم الوجود الجيني
الوظيفة الجزيئية	• ‏GO:0001948، ‏GO:0016582 ربط بروتيني; • ربط حمض نووي; • RNA binding;
المكونات الخلوية	• سيتوبلازم; • عصارة خلوية; • nuclear speck; • catalytic step 2 spliceosome; • غشاء; • transcription export complex; • exon-exon junction complex; • spliceosomal complex; • حويصلة خارج خلوية; • نواة; • بلازم نووي;
العمليات الحيوية	• regulation of DNA recombination; • mRNA splicing, via spliceosome; • termination of RNA polymerase II transcription; • mRNA transport; • mRNA processing; • viral mRNA export from host cell nucleus; • mRNA export from nucleus; • positive regulation of DNA-templated transcription, elongation; • osteoblast differentiation; • replication fork processing; • ‏GO:0022415 viral process; • mRNA 3'-end processing; • تضفير الآر أن إيه; • RNA export from nucleus; • ‏GO:0015915 نقل;
	المصادر:Amigo / QuickGO
أورثولوج
	Q86V81
	D3ZXH7
	‏NR_158770 NM_005782، ‏NR_158770
	‏XM_006247925 NM_001109602، ‏XM_006247925
	NP_005773
	‏XP_006247987، ‏XP_038942805، ‏NP_001381323 NP_001103072، ‏XP_006247987، ‏XP_038942805، ‏NP_001381323
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

ALYREF‏ (Aly/REF export factor) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين ALYREF في الإنسان.^[1]^[2]^[3]

الوظيفة عدل

الأهمية السريرية عدل

المراجع عدل

^ Muravenko OV، Gizatullin RZ، Al-Amin AN، Protopopov AI، Kashuba VI، Zelenin AV، Zabarovsky ER (يناير 2001). "Human ALY/BEF gene Map position 17q25.3". Chromosome Res. ج. 8 ع. 6: 562. DOI:10.1023/A:1009236126053. PMID:11032328.
^ "Entrez Gene: ALYREF Aly/REF export factor". مؤرشف من الأصل في 2010-03-07.
^ "Entrez Gene: THOC4 THO complex 4". مؤرشف من الأصل في 2010-03-07.

قراءة متعمقة عدل

Bruhn L، Munnerlyn A، Grosschedl R (1997). "ALY, a context-dependent coactivator of LEF-1 and AML-1, is required for TCRalpha enhancer function". Genes Dev. ج. 11 ع. 5: 640–53. DOI:10.1101/gad.11.5.640. PMID:9119228.
Neubauer G، King A، Rappsilber J، وآخرون (1998). "Mass spectrometry and EST-database searching allows characterization of the multi-protein spliceosome complex". Nat. Genet. ج. 20 ع. 1: 46–50. DOI:10.1038/1700. PMID:9731529.
Wichmann I، Garcia-Lozano JR، Respaldiza N، وآخرون (1999). "Autoantibodies to transcriptional regulation proteins DEK and ALY in a patient with systemic lupus erythematosus". Hum. Immunol. ج. 60 ع. 1: 57–62. DOI:10.1016/S0198-8859(98)00085-8. PMID:9952027.
Virbasius CM، Wagner S، Green MR (1999). "A human nuclear-localized chaperone that regulates dimerization, DNA binding, and transcriptional activity of bZIP proteins". Mol. Cell. ج. 4 ع. 2: 219–28. DOI:10.1016/S1097-2765(00)80369-X. PMID:10488337.
Le Hir H، Izaurralde E، Maquat LE، Moore MJ (2001). "The spliceosome deposits multiple proteins 20-24 nucleotides upstream of mRNA exon-exon junctions". EMBO J. ج. 19 ع. 24: 6860–9. DOI:10.1093/emboj/19.24.6860. PMC:305905. PMID:11118221.
Kim VN، Kataoka N، Dreyfuss G (2001). "Role of the nonsense-mediated decay factor hUpf3 in the splicing-dependent exon-exon junction complex". Science. ج. 293 ع. 5536: 1832–6. DOI:10.1126/science.1062829. PMID:11546873.
Luo ML، Zhou Z، Magni K، وآخرون (2001). "Pre-mRNA splicing and mRNA export linked by direct interactions between UAP56 and Aly". Nature. ج. 413 ع. 6856: 644–7. DOI:10.1038/35098106. PMID:11675789.
Kataoka N، Diem MD، Kim VN، وآخرون (2002). "Magoh, a human homolog of Drosophila mago nashi protein, is a component of the splicing-dependent exon-exon junction complex". EMBO J. ج. 20 ع. 22: 6424–33. DOI:10.1093/emboj/20.22.6424. PMC:125744. PMID:11707413.
Strässer K، Masuda S، Mason P، وآخرون (2002). "TREX is a conserved complex coupling transcription with messenger RNA export". Nature. ج. 417 ع. 6886: 304–8. DOI:10.1038/nature746. PMID:11979277.
Jurica MS، Licklider LJ، Gygi SR، وآخرون (2002). "Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis". RNA. ج. 8 ع. 4: 426–39. DOI:10.1017/S1355838202021088. PMC:1370266. PMID:11991638.
Rappsilber J، Ryder U، Lamond AI، Mann M (2002). "Large-scale proteomic analysis of the human spliceosome". Genome Res. ج. 12 ع. 8: 1231–45. DOI:10.1101/gr.473902. PMC:186633. PMID:12176931.
Chen IH، Sciabica KS، Sandri-Goldin RM (2002). "ICP27 interacts with the RNA export factor Aly/REF to direct herpes simplex virus type 1 intronless mRNAs to the TAP export pathway". J. Virol. ج. 76 ع. 24: 12877–89. DOI:10.1128/JVI.76.24.12877-12889.2002. PMC:136725. PMID:12438613.
Strausberg RL، Feingold EA، Grouse LH، وآخرون (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 26: 16899–903. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC:139241. PMID:12477932.
McCracken S، Longman D، Johnstone IL، وآخرون (2004). "An evolutionarily conserved role for SRm160 in 3'-end processing that functions independently of exon junction complex formation". J. Biol. Chem. ج. 278 ع. 45: 44153–60. DOI:10.1074/jbc.M306856200. PMID:12944400.
Pryor A، Tung L، Yang Z، وآخرون (2004). "Growth-regulated expression and G0-specific turnover of the mRNA that encodes URH49, a mammalian DExH/D box protein that is highly related to the mRNA export protein UAP56". Nucleic Acids Res. ج. 32 ع. 6: 1857–65. DOI:10.1093/nar/gkh347. PMC:390356. PMID:15047853.
Gerhard DS، Wagner L، Feingold EA، وآخرون (2004). "The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC)". Genome Res. ج. 14 ع. 10B: 2121–7. DOI:10.1101/gr.2596504. PMC:528928. PMID:15489334.
Ong SE، Mittler G، Mann M (2005). "Identifying and quantifying in vivo methylation sites by heavy methyl SILAC". Nat. Methods. ج. 1 ع. 2: 119–26. DOI:10.1038/nmeth715. PMID:15782174.
Masuda S، Das R، Cheng H، وآخرون (2005). "Recruitment of the human TREX complex to mRNA during splicing". Genes Dev. ج. 19 ع. 13: 1512–7. DOI:10.1101/gad.1302205. PMC:1172058. PMID:15998806.
Mertz JA، Kobayashi R، Dudley JP (2007). "ALY is a common coactivator of RUNX1 and c-Myb on the type B leukemogenic virus enhancer". J. Virol. ج. 81 ع. 7: 3503–13. DOI:10.1128/JVI.02253-06. PMC:1866045. PMID:17229714.
Quaresma AJ، Sievert R، Nickerson JA (2013). "Regulation of mRNA export by the PI3 kinase/AKT signal transduction pathway". Mol. Biol. Cell. ج. 24 ع. 8: 1208–21. DOI:10.1091/mbc.E12-06-0450. PMC:3623641. PMID:23427269.

هذه بذرة مقالة عن بروتين بحاجة للتوسيع. فضلًا شارك في تحريرها.

[pmid11032328-1] Muravenko OV، Gizatullin RZ، Al-Amin AN، Protopopov AI، Kashuba VI، Zelenin AV، Zabarovsky ER (يناير 2001). "Human ALY/BEF gene Map position 17q25.3". Chromosome Res. ج. 8 ع. 6: 562. DOI:10.1023/A:1009236126053. PMID:11032328.

[entrez-2] "Entrez Gene: ALYREF Aly/REF export factor". مؤرشف من الأصل في 2010-03-07.

[entrez2-3] "Entrez Gene: THOC4 THO complex 4". مؤرشف من الأصل في 2010-03-07.

[1]

[2]

[3]