تي-كوفي T-coffee (بالإنجليزية: Tree-based Consistency Objective Function For alignment Evaluation) هو مجموعة من الأدوات للحوسبة تتيح مقارنة عدة سلاسل بيولوجية؛ مثل: (بروتينات,DNA,RNA). يتم استخدامه لتحديد الاماكن المهمة في السلسلة و مناطق المحاذاة, و لإيجاد الاحماض الامينية التي لا تسمح بحدوث الطفرات, لديه ميزات متقدمة لتقييم نوعية المقارنة و القدرة على تحديد حدوث (motifs(Mocca,و كل ذلك يتم بتحديد السلسلة اولا من برمجية FASTA و هي الأكثر استخداماً. وهناك خاصية هامة يوفرها و هي قدرته على الجمع بين أساليب مختلفة وأنواع البيانات المختلفة. له العديد من التطبيقات : Expresso and 3D-Coffee, R-Coffee , M-coffee, Pro-coffee و غيرها.

تي-كوفي
معلومات عامة
نوع
نظام التشغيل
جنو/لينكس  [لغات أخرى] [1]ماك أوس[1]الاطلاع ومراجعة البيانات على ويكي داتا
مواقع الويب
معلومات تقنية
المطورون
Cédric Notredame, Centro de Regulacio Genomica (CRG) - Barcelona
لغة البرمجة
إصدار تجريبي
11.00.d27cadf
المستودع
الرخصة

كيفية الاستخدامعدل

نقوم بفتح البرنامج و اختيار نوع التطبيق المطلوب و بعدها نقوم بوضع السلاسل البيولوجية التي نود مقارنتها.

كيفية معاينة النتيجة

النتيجة ستظهر السلاسل البيولوجية بألوان تحدد مناطق المحاذاة, شدة التطابق بينها يتم معيانتها حسب الالوان

BAD : بنفسجي-اخضر

AVG : اصفر

GOOD : احمر

المرجععدل

  1. ^ http://www.tcoffee.org/Projects/tcoffee/ — تاريخ الاطلاع: 17 نوفمبر 2017
  2. ^ https://github.com/cbcrg/tcoffee — تاريخ الاطلاع: 18 سبتمبر 2019

http://www.tcoffee.org/

 
هذه بذرة مقالة عن برمجيات الحاسوب بحاجة للتوسيع. شارك في تحريرها.