مستخدم:Wallamt 1986/ملعب

نزع الأميد في البروتينات والببتيدات

نزع الأميد , تفاعل كيميائي يتم فيه إزالة الأميد في السلسلة الجانبية للأحماض الأمينية مثل الأسبارجين أو الجلوتامين وتحويلها الى مجموعة وظيفية اخرى . عادة يتم تحويل الأسبارجين الى حمض الاسبارتيك أو حمض الأيزواسبارتيك . الجلوتامين يتم تحويله الى حمض الجلوتاميك او حمض حمض بيروجلوتاميك في البروتين او الببتيد . هذه التفاعلات مهمة لأنها قد تغير هيكلها او استقرارها او وظيفتها وقد تؤدي إلى تدهور البروتين .

--Wallamt 1986 (نقاش) 13:15، 26 ديسمبر 2017 (ت ع م)

الية نزع الأميد

يتم نزع الأميد بطريقتين

الأولى في الوسط المتعادل

التعادل غير الأنزيمي من الأسبارجين وبقايا الأسبارتات في درجة الحموضة الفسيولوجية يحدث في المقام الأول من خلال إعادة ترتيب داخل الجزيئات  بخطوتين : 

الخطوة الأولى الرابطة الببتيدية (ايون الهيدروجين ) يهاجم مجموعة الكربونيل في السلسلة الجانبية للأسبارجين أو الاسبارتيت لتشكيل حلقة خماسية الشكل تعود لحمض السكسيناميد أو حلقة الأميد الخطوة الثانية يتحلل السكسيناميد بسرعة إما في مجموعة ألفا أو بيتا كاربونيل لإنتاج أيزو-أسبارتيت (بيتا - أسبارتيت )والأسبارتيت بنسبة 3:1

الثانية في الوسط الحمضي

عند درجة الحموضة المنخفضة (< 2) يؤدي التحلل المائي المباشر للسلسلة الجانبية من الأميد إلى توليد الأسبارتيت كمنتج وحيد

شروط نزع الأميد

اعلى تردد في البروتينات التي تحتوي سلسلة Gly-Asu , بالنسبة للبروتينات التي يتم فيها نزع الاميد يكون الجلايسين بعيدا عن البقايا المجاورة الأكثر شيوعا , البروتينات متوسطةالتردد يتبعها حمض اميني قطبي مع سلسلة جانبية صغيرة نسبيا (Asp ,Thr , Ser ) والبروتينات منخفضة التردد يتبعها حمض أميني محب للدهون مع سلسلة جانبية كبيرة

كيفية تحديد مواقع نزع الاميد

فصل البروتين الناتج باستحدام الكروماتوغرافي التحلل اللوني

اذا كان معدل الأميد منخفض جدا وبالتالي يصعب الكشف عنه , يمكن وضع عينات البروتين في وسط قاعدي (20mM , فسفات الصوديوم PH=8) او برفع درجة حرارة التفاعل 37 درجة مئوية لتسريع معدل التفاعل لنزع الأميد في البروتين

التبادل الأيوني

التبادل الايوني اللوني هو الاكثر شيوعا على نطاق واسع في نزع الأميد من البروتين

الايجابيات : انتقائي اذا تغيرت الشحنة, وبالتالي الامثل لفصل Asu والبروتينات منزوعة الأميد Asp , Iso-Asp [1] السلبيات : تكوين اي من سكسيناميد من Asu او Iso-Asp من Asp لن يؤدي الى تغيير في صافي الشحنة ويقلل من كفاءة التبادل الأيوني

كروماتوغرافيا التفاعلات المائية

تستند الية الانتقائية الى الخصائص اللامائية للبروتين كما هو الحال في الطور العكسي ولكن بمقدار قليل جدا بسبب عدم وجود مادة عضوية في الطور المتحرك واقل كثافة واستخدام طور ثابت ذو خصائص غير قطبية تاثير نزع الاميد على النشاط البيلوجي : لا يوجد حتى الان اي تاثير لنزع الاميد على البروتين اي عدد كبير من البروتينات منزوعة الاميد لا تؤثر في نشاطها البيلوجي بينما يتاثر البعض الاخر سلبا [2]