قد تعاني طيور الإيمو من [[تطفل|الطفيليات]] الداخلية والخارجية، لكن عندما تربّى هذه الطيور في المزارع، فإن حدّة مشكلة الطفيليات تكون أقل مما هو لدى [[نعامة|النعام]]. تشمل الطفيليات الخارجية أنواع [[قمليات|القمل]] المختلفة و[[لبوديات الشكل]]، و[[سوس (قراديات)|القراديات]] و[[ذوات الجناحين]]. تعاني الفراخ أحياناًأحيانًا من التهابات الأمعاء التي تسببها [[أكريات|الأكريات]] وهي [[أولي (كائن)|كائنات أولية]]، كما تصيب الديدان الخيطية الإيمو وطيور أخرى عديدة، وتسبب لها [[إسهال|الإسهال]]. وجدت [[ديدان أسطوانية]] في القصبة الهوائية والشعب الهوائية للطير؛ أما [[معترسة رغامية|المعترسة الرغامية]] فتسبب لها [[التهاب القصبة الهوائية]] النزفي وورم المثانة الحلقي، ما يسبب مشاكل في الجهاز التنفسي قد تكون خطيرة لدى الفراخ.<ref>{{Cite journal|مؤلف1=Nemejc, Karel |مؤلف2=Lukešová, Daniela |سنة=2012 |عنوان=The parasite fauna of ostriches, emu and rheas |صحيفة=Agricultura Tropica et Subtropica |المجلد=54 |العدد=1 |صفحات=45–50 |doi=10.2478/v10295-012-0007-6 }}</ref>
