قالب قراءة مفتوح: الفرق بين النسختين

من احد استخدامات قوالب القراءة المفتوحة - كما تشير بعض الأبحاث - هو تنظيم [[تنبوء بالمورثات|استقراء المورثات]]. تستخدم قوالب قراءة مفتوحة طويلة بغرض التعرف الاولي على مناطق مشفرة للبروتين على [[الدنا]] . <ref name=deonier2005p25>{{cite book |last = Deonier |first = Richard |author2=[[Simon Tavaré]] |author3=Michael Waterman |title = Computational Genome Analysis: an introduction |publisher = [[Springer-Verlag]] |year = 2005 |isbn = 0-387-98785-1 |page=25}}</ref> ووجود قالب قراءة مفتوح لا يعني باستمرار أنه يوم بالترجمة. وعلي سبيل المثال، في دنا ذو تتابعات من نسب متساوية من النوكليتيدات ، فقد يتوقع وجود [[كودون ختامي]] كل 21 [[كودون]]. <ref name=deonier2005p25 /> وعينة لصيغة [[تنبؤ بالمورثات]] خاصة ب[[حقيقيات النوى]] قد يوجد فيها كودون بدء ويتلوه قالب قراءة مفتوح يكون طويلا بحيث يشيفر بروتين بينما استخدام الكودونات في تلك المنطقة يتوافق مع مناطق تشفير مطابقة لكائن معين. قد

For example, in a randomly generated DNA sequence with an equal percentage of each [[nucleotide]], a [[stop-codon]] would be expected once every 21 [[codon]]s.<ref name=deonier2005p25 /> A simple [[gene prediction]] algorithm for [[prokaryotes]] might look for a [[start codon]] followed by an open reading frame that is long enough to encode a typical protein, where the [[Codon usage bias|codon usage]] of that region matches the frequency characteristic for the given organism's coding regions.<ref name=deonier2005p25 /> By itself even a long open reading frame is not conclusive evidence for the presence of a [[gene]].<ref name=deonier2005p25 /> On the other hand, it has been proven that some short ORFs (sORFs) that lack the classical hallmarks of protein-coding genes (both from ncRNAs and mRNAs) can produce functional peptides.<ref name="ZanetBenrabah2015">{{cite journal|last1=Zanet|first1=J.|last2=Benrabah|first2=E.|last3=Li|first3=T.|last4=Pelissier-Monier|first4=A.|last5=Chanut-Delalande|first5=H.|last6=Ronsin|first6=B.|last7=Bellen|first7=H. J.|last8=Payre|first8=F.|last9=Plaza|first9=S.|title=Pri sORF peptides induce selective proteasome-mediated protein processing|journal=Science|volume=349|issue=6254|year=2015|pages=1356–1358|issn=0036-8075|doi=10.1126/science.aac5677}}</ref>