أطلس التعبير

**Expression Atlas**
المحتويات
الوصف	Gene expression across species and conditions
نوع البيانات	Microarray Data and other Gene Expression
الكائنات	Human, Mouse, Rat, Fruit-fly, Chicken, Roundworm, Wild boar, Zebrafish, Cow and others.
العناوين
مركز الأبحاث	معهد المعلوماتية الحيوية الأوروبي
الاستشهاد الأولى	31665515
تاريخ الإطلاق	March 2020
الوصول
الموقع	www.ebi.ac.uk/gxa/home
الأدوات
ويب	Advanced search, bulk retrieval/download
متنوعات
تكرار إطلاق البيانات	3 to 4 times a year
Curation policy	Manual curation of every study.

أطلس التعبير Expression Atlas هي قاعدة بيانات يحتفظ بها المعهد الأوروبي للمعلومات الحيوية التي توفر معلومات عن أنماط التعبير الجيني من دراسات RNA-Seq وMicroarray ، وتعبير البروتين من دراسات Proteomics . ^[1] يسمح أطلس التعبير بالبحث عن الجين أو متغير لصق أو سمة البروتين أو المرض أو العلاج أو جزء كائن حي (أنواع الخلايا / الأنسجة). يمكن البحث عن الجينات الفردية أو مجموعات الجينات. يتم تنظيم البيانات الوصفية يدويًا لجميع مجموعات البيانات في أطلس التعبير وتحليل بياناتها من خلال خطوط شبكة التحليل الموحدة. هناك مكونان لأطلس التعبير ، الأطلس الأساسي والأطلس التفاضلي:

أطلس الأساس عدل

يوفر أطلس خط الأساس معلومات حول المنتجات الجينية الموجودة (وبأي وفرة) في ظل الظروف "العادية". يتكون هذا المكون من أطلس التعبير من تجارب RNA-seq من مستودعات ArrayExpress. وهو يهدف إلى الإجابة على أسئلة مثل:

ما هي الجينات التي يتم التعبير عنها تحديدًا في الكلى؟
ما هو نمط التعبير عن الجين SAA4 في الأنسجة الطبيعية؟

أطلس تفاضلي عدل

يسمح الأطلس التفاضلي للمستخدمين بتحديد الجينات التي يتم تنظيمها لأعلى أو لأسفل في ظروف تجريبية مختلفة.

أنظر أيضا عدل

المراجع عدل

^ "Expression Atlas update: from tissues to single cells". Nucleic Acids Research. ج. 48 ع. D1: D77–D83. يناير 2020. DOI:10.1093/nar/gkz947. PMC:7145605. PMID:31665515. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط |إظهار المؤلفين=6 غير صالح (مساعدة)

للقراءة المتعمقة عدل

روابط خارجية عدل

"About Expression Atlas". European Molecular Biology Laboratory - European Bioinformatics Institute (EMBL-EBI). مؤرشف من الأصل في 2023-03-07.

[1] "Expression Atlas update: from tissues to single cells". Nucleic Acids Research. ج. 48 ع. D1: D77–D83. يناير 2020. DOI:10.1093/nar/gkz947. PMC:7145605. PMID:31665515. {{استشهاد بدورية محكمة}}: الوسيط |إظهار المؤلفين=6 غير صالح (مساعدة)

[1]