كولاجين4، ألفا1

بروتين في الإنسان العاقل

كولاجين 4، ألفا 1 (بالانجليزية:Collagen, type IV, alpha 1)، ويرمز له بالرمز (COL4A1)، وهو بروتين في البشر يتم ترميزه من قبل جين COL4A1 على الكروموسوم 13.[18][19] ويتم التعبير عنه في كل مكان في العديد من الأنسجة وأنواع الخلايا.[20] ويعد COL4A1 وحدة فرعية من نوع الكولاجين الرابع، ويلعب دورا في توليد الأوعية.[21] وقد تم ربط الطفرات في الجين بأمراض الدماغ، والعضلات، والكلى، والعين، ونظام القلب والأوعية الدموية.[22][23][24][25] يحتوي الجين COL4A1 أيضا على واحد من 27 تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة، المرتبطة بزيادة خطر الإصابة بمرض الشريان التاجي.[26]

التركيب عدل

جين عدل

يقع الجين COL4A1 على الكروموسوم 13 في الرابطة 13q34، ويحتوي على 54 إكسون. كما ينتج هذا الجين 2 أيزوفورم عن طريق الوصل المتبادل.[27]

بروتين عدل

ينتمي COL4A1 إلى الأسرة الرابعة للكولاجين، ويحتوي على 3 ثلاثة نطاقات بروتين: نطاق لنهاية أمينية قصيرة، نطاق 7S طويلة حلزونية ثلاثية في مركزها، ونطاق غير كولاجيني1 في النهاية الكربوكسيلية.[27][28] يحتوي النطاق الثلاثي الحلزوني على تكرارات متقطعة من G-X-Y ، والتي من المحتمل أن يرجع إليها مرونة النطاق.[27] يتكون النطاق الغير كولاجيني1 من اثنين من القلانس المثلوثية، يحتوي كل منها على جزئين ألفا1 وجزء ألفا2، والتي تشكل مروحة سداسية مُرتبة حول نفق محوري. يحدث التفاعل بين هاتين القلنسوتين عبر وُجيهة مسطحة، وتستقر بواسطة رابطة تساهمية بين سلاسل ألفا1 وألفا2 عبر هاتين القلنسوتين.[28]

وظيفة عدل

يعتبر النوع الرابع الكولاجين هو العنصر الهيكلي الرئيسي للأغشية القاعدية، والذي يحتوي على اثنين أو ثلاثة من بروتينات COL4A1؛[22] وبالتالي فإن COL4A1 وفير، ويوجد في جميع أنواع الأغشية القاعدية.[23] يعتبر النطاق الغير كولاجيني1 من COL4A1 هو جزيء مضاد للانبعاث مهم للسيطرة على تشكيل الشعيرات الدموية الجديدة.[29] كما يربط النطاق الغير كولاجيني1 بين α1β1 إنتغرين ويمنع مسارات إشارات إنتغرين المحددة في الخلايا الظهارية للأوعية الدموية. كما ينظم التعبير للعامل المحرض لنقص التأكسج ألفا1 (HIF-1α)، وعامل النمو الوعائي البطاني (VEGF)، ويفترض من خلال تثبيط مسار مابك/إرك (MAPK/ERK pathway). هذه النتائج قد تفسر الوظيفة المانعة لحدوث الورم للنطاق الغير كولاجيني1.[30]

أهمية إكلينيكية عدل

ترتبط الطفرات في COL4A1 إكسون 24 و 25 مع (اعتلال وعائي وراثي سائد، اعتلال الكلية، تمدد الأوعية الدموية، وشد عضلي).[31] كما تم تأكيد أن الطفرات في الجين COL4A1 تحدث في بعض المرضى الذين يعانون من تنخرب الدماغ، وانشقاق الدماغ.[32][33]

في البشر، تم العثور على طفرة جديدة في الترميز الجيني COL4A1 لنوع الكولاجين الرابع وارتباطها مع الساد الخلقي المهيمن في الأسرة الصينية. لم يتم العثور على هذا الطفرة في أفراد الأسرة الغير مصابين، أو في 200 الضوابط غير ذات الصلة. في هذه الدراسة، وأكد تحليل تسلسلي أن بقايا الحمض الأميني جلايكوجين782 محفوظة بكثرة.[24] يعتبر تقرير هذه الطفرة الجديدة في جين COL4A1 هو التقرير الأول للساد الخلقي المهيمن الغير متلازمي الذي يسلط الضوء على دور هام لنوع الكولاجين الرابع في الخصائص الفسيولوجية، والبصرية للعدسة.[24] بالإضافة إلى ذلك، في مجال القلب والأوعية الدموية، تعتبر مناطق COL4A1 و COL4A2 على الكروموسوم 13q34 مكان متماثل للغاية لمرض الشريان التاجي. في الجدار الطبيعي للشرايين، يعمل نوع الكولاجين الرابع لمنع انتشار الخلايا العضلية الملساء. وفقا لذلك، ثبت أن تعبير البروتين لنوع الكولاجين الرابع في خلايا العضلات الملساء الوعائية البشرية ينظمها كل من البروتين SMAD3 و TGFβ بواسطة التحفيز من الحمض النووي الريبوزي الرسول.[25] وإجمالا، تم استنتاج أن التسبب في مرض الشريان التاجي يمكن أن ينظمه جينات COL4A1 و COL4A2.[25]

علامة إكلينيكية عدل

أثبتت دراسة نقاط الخطر الجينية متعددة المواقع استنادا إلى مزيج من 27 موقع، بما في ذلك جين COL4A1 أن الأفراد الذين تم تحديدهم في خطر متزايد للحوادث المتكررة لأمراض الشريان التاجي، فضلا عن تعزيز الفوائد السريرية من العلاج بالإستاتين. واستندت الدراسة إلى دراسة تعرض مجتمعية (دراسة مالمو للحمية والسرطان)، وأربع تجارب إضافية عشوائية ذات شواهد لفئتي الوقاية الأولية (جوبيتر وأسكوت)، وأفواج الوقاية الثانوية (كير أند بروف إيت-تيمي 22).[26]

انظر أيضا عدل

مصادر عدل

  1. ^ أ ب ت ث "InterPro Release 71.0". 8 نوفمبر 2018.
  2. ^ أ ب مذكور في: يونيبروت. الوصول: 18 يوليو 2018. معرف يونيبروت: P02462. لغة العمل أو لغة الاسم: الإنجليزية.
  3. ^ "Novel mutations in three families confirm a major role of COL4A1 in hereditary porencephaly" (بالإنجليزية). Jun 2006. pp. 490–5. Retrieved 2017-10-17.
  4. ^ "Novel COL4A1 mutations associated with HANAC syndrome: a role for the triple helical CB3[IV] domain" (بالإنجليزية). Oct 2010. pp. 2550–5. Retrieved 2017-10-17.
  5. ^ "Novel mutations in three families confirm a major role of COL4A1 in hereditary porencephaly" (بالإنجليزية). Jun 2006. pp. 490–5. Retrieved 2017-10-17.
  6. ^ "GOA". اطلع عليه بتاريخ 2017-10-17.
  7. ^ وولفرام بوده (1 May 2002). "The 1.9-A crystal structure of the noncollagenous (NC1) domain of human placenta collagen IV shows stabilization via a novel type of covalent Met-Lys cross-link" (بالإنجليزية). pp. 6607–6612. Retrieved 2019-04-08.
  8. ^ "GOA". اطلع عليه بتاريخ 2019-04-08.
  9. ^ "GOA". اطلع عليه بتاريخ 2019-04-08.
  10. ^ "GOA". اطلع عليه بتاريخ 2019-04-08.
  11. ^ Athanasios Didangelos (14 Feb 2012). "Proteomics analysis of cardiac extracellular matrix remodeling in a porcine model of ischemia/reperfusion injury" (بالإنجليزية). pp. 789–802. Retrieved 2017-10-17.
  12. ^ "GOA". اطلع عليه بتاريخ 2017-10-17.
  13. ^ Simon Borg-Bartolo (28 Jun 2013). "Comparative proteomic analysis of supportive and unsupportive extracellular matrix substrates for human embryonic stem cell maintenance" (بالإنجليزية). pp. 18716–31. Retrieved 2017-10-17.
  14. ^ Corinne Antignac (27 Dec 2007). "COL4A1 mutations and hereditary angiopathy, nephropathy, aneurysms, and muscle cramps" (بالإنجليزية). pp. 2687–95. Retrieved 2019-04-08.
  15. ^ "GOA". اطلع عليه بتاريخ 2019-04-08.
  16. ^ "Novel COL4A1 mutations associated with HANAC syndrome: a role for the triple helical CB3[IV] domain" (بالإنجليزية). Oct 2010. pp. 2550–5. Retrieved 2019-04-08.
  17. ^ "Open Targets Platform". اطلع عليه بتاريخ 2023-08-14.
  18. ^ Soininen R، Haka-Risku T، Prockop DJ، Tryggvason K (ديسمبر 1987). "Complete primary structure of the alpha 1-chain of human basement membrane (type IV) collagen". FEBS Letters. ج. 225 ع. 1–2: 188–94. DOI:10.1016/0014-5793(87)81155-9. PMID:3691802.
  19. ^ "Entrez Gene: COL4A1 collagen, type IV, alpha 1". مؤرشف من الأصل في 2010-03-07.
  20. ^ "BioGPS - your Gene Portal System". biogps.org. مؤرشف من الأصل في 2019-05-22. اطلع عليه بتاريخ 2016-10-11.
  21. ^ Peng، Guicheng؛ Lin، Maohuan؛ Zhang، Kun؛ Chen، Jie؛ Wang، Yifang؛ Yang، Yu؛ Wang، Jingfeng؛ Huang، Hui (19 يونيو 2013). "Hemoglobin A1c Can Identify More Cardiovascular and Metabolic Risk Profile in OGTT-Negative Chinese Population". International Journal of Medical Sciences. ج. 10 ع. 8: 1028–1034. DOI:10.7150/ijms.5905. ISSN:1449-1907. PMC:3691802. PMID:23801890.
  22. ^ أ ب Peng G، Lin M، Zhang K، Chen J، Wang Y، Yang Y، Wang J، Huang H (19 يونيو 2013). "Hemoglobin A1c can identify more cardiovascular and metabolic risk profile in OGTT-negative Chinese population". International Journal of Medical Sciences. ج. 10 ع. 8: 1028–34. DOI:10.7150/ijms.5905. PMC:3691802. PMID:23801890.
  23. ^ أ ب Peissel B، Geng L، Kalluri R، Kashtan C، Rennke HG، Gallo GR، Yoshioka K، Sun MJ، Hudson BG، Neilson EG (أكتوبر 1995). "Comparative distribution of the alpha 1(IV), alpha 5(IV), and alpha 6(IV) collagen chains in normal human adult and fetal tissues and in kidneys from X-linked Alport syndrome patients". The Journal of Clinical Investigation. ج. 96 ع. 4: 1948–57. DOI:10.1172/JCI118241. PMC:185832. PMID:7560087.
  24. ^ أ ب ت Xia XY، Li N، Cao X، Wu QY، Li TF، Zhang C، Li WW، Cui YX، Li XJ، Xue CY (1 يناير 2014). "A novel COL4A1 gene mutation results in autosomal dominant non-syndromic congenital cataract in a Chinese family". BMC Medical Genetics. ج. 15: 97. DOI:10.1186/s12881-014-0097-2. PMC:4236509. PMID:25124159.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
  25. ^ أ ب ت Turner AW، Nikpay M، Silva A، Lau P، Martinuk A، Linseman TA، Soubeyrand S، McPherson R (أكتوبر 2015). "Functional interaction between COL4A1/COL4A2 and SMAD3 risk loci for coronary artery disease". Atherosclerosis. ج. 242 ع. 2: 543–52. DOI:10.1016/j.atherosclerosis.2015.08.008. PMID:26310581.
  26. ^ أ ب Mega JL، Stitziel NO، Smith JG، Chasman DI، Caulfield MJ، Devlin JJ، Nordio F، Hyde CL، Cannon CP، Sacks FM، Poulter NR، Sever PS، Ridker PM، Braunwald E، Melander O، Kathiresan S، Sabatine MS (يونيو 2015). "Genetic risk, coronary heart disease events, and the clinical benefit of statin therapy: an analysis of primary and secondary prevention trials". Lancet. ج. 385 ع. 9984: 2264–71. DOI:10.1016/S0140-6736(14)61730-X. PMC:4608367. PMID:25748612.
  27. ^ أ ب ت "COL4A1 - Collagen alpha-1(IV) chain precursor - Homo sapiens (Human) - COL4A1 gene & protein". www.uniprot.org. مؤرشف من الأصل في 2018-06-02. اطلع عليه بتاريخ 2016-10-11.
  28. ^ أ ب Than، Manuel E.؛ Henrich، Stefan؛ Huber، Robert؛ Ries، Albert؛ Mann، Karlheinz؛ Kühn، Klaus؛ Timpl، Rupert؛ Bourenkov، Gleb P.؛ Bartunik، Hans D. (14 مايو 2002). "The 1.9-A crystal structure of the noncollagenous (NC1) domain of human placenta collagen IV shows stabilization via a novel type of covalent Met-Lys cross-link". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 99 ع. 10: 6607–6612. DOI:10.1073/pnas.062183499. ISSN:0027-8424. PMC:124450. PMID:12011424.
  29. ^ Maragoudakis ME، Missirlis E، Karakiulakis GD، Sarmonica M، Bastakis M، Tsopanoglou N (يناير 1993). "Basement membrane biosynthesis as a target for developing inhibitors of angiogenesis with anti-tumor properties". Kidney International. ج. 43 ع. 1: 147–50. DOI:10.1038/ki.1993.24. PMID:7679456.
  30. ^ Sudhakar A، Nyberg P، Keshamouni VG، Mannam AP، Li J، Sugimoto H، Cosgrove D، Kalluri R (أكتوبر 2005). "Human alpha1 type IV collagen NC1 domain exhibits distinct antiangiogenic activity mediated by alpha1beta1 integrin". The Journal of Clinical Investigation. ج. 115 ع. 10: 2801–10. DOI:10.1172/JCI24813. PMC:1199529. PMID:16151532.
  31. ^ Plaisier E، Gribouval O، Alamowitch S، Mougenot B، Prost C، Verpont MC، Marro B، Desmettre T، Cohen SY، Roullet E، Dracon M، Fardeau M، Van Agtmael T، Kerjaschki D، Antignac C، Ronco P (ديسمبر 2007). "COL4A1 mutations and hereditary angiopathy, nephropathy, aneurysms, and muscle cramps". The New England Journal of Medicine. ج. 357 ع. 26: 2687–95. DOI:10.1056/NEJMoa071906. PMID:18160688.
  32. ^ Yoneda Y، Haginoya K، Kato M، Osaka H، Yokochi K، Arai H، Kakita A، Yamamoto T، Otsuki Y، Shimizu S، Wada T، Koyama N، Mino Y، Kondo N، Takahashi S، Hirabayashi S، Takanashi J، Okumura A، Kumagai T، Hirai S، Nabetani M، Saitoh S، Hattori A، Yamasaki M، Kumakura A، Sugo Y، Nishiyama K، Miyatake S، Tsurusaki Y، Doi H، Miyake N، Matsumoto N، Saitsu H (يناير 2013). "Phenotypic spectrum of COL4A1 mutations: porencephaly to schizencephaly". Annals of Neurology. ج. 73 ع. 1: 48–57. DOI:10.1002/ana.23736. PMID:23225343.
  33. ^ Smigiel R, Cabala M, Jakubiak A, Kodera H, Sasiadek MJ, Matsumoto N, Sasiadek MM, Saitsu H (Apr 2016). "Novel COL4A1 mutation in an infant with severe dysmorphic syndrome with schizencephaly, periventricular calcifications, and cataract resembling congenital infection". Birth Defects Research. Part A, Clinical and Molecular Teratology (بالإنجليزية). 106 (4): 304–7. DOI:10.1002/bdra.23488. PMID:26879631.

قراءات أخرى عدل

  • Tryggvason K، Soininen R، Hostikka SL، Ganguly A، Huotari M، Prockop DJ (1990). "Structure of the human type IV collagen genes". Annals of the New York Academy of Sciences. ج. 580: 97–111. DOI:10.1111/j.1749-6632.1990.tb17922.x. PMID:2186699.
  • Hinek A (يوليو 1994). "Nature and the multiple functions of the 67-kD elastin-/laminin binding protein". Cell Adhesion and Communication. ج. 2 ع. 3: 185–93. DOI:10.3109/15419069409004436. PMID:7827955.
  • Ständer M، Naumann U، Wick W، Weller M (مايو 1999). "Transforming growth factor-beta and p-21: multiple molecular targets of decorin-mediated suppression of neoplastic growth". Cell and Tissue Research. ج. 296 ع. 2: 221–7. DOI:10.1007/s004410051283. PMID:10382266.
  • Kurpakus Wheater M، Kernacki KA، Hazlett LD (مايو 1999). "Corneal cell proteins and ocular surface pathology". Biotechnic & Histochemistry. ج. 74 ع. 3: 146–59. DOI:10.3109/10520299909047967. PMID:10416788.
  • Ghebrehiwet B، Peerschke EI، Hong Y، Munoz P، Gorevic PD (يونيو 1992). "Short amino acid sequences derived from C1q receptor (C1q-R) show homology with the alpha chains of fibronectin and vitronectin receptors and collagen type IV". Journal of Leukocyte Biology. ج. 51 ع. 6: 546–56. PMID:1377218.
  • Gupta S، Batchu RB، Datta K (أكتوبر 1991). "Purification, partial characterization of rat kidney hyaluronic acid binding protein and its localization on the cell surface". European Journal of Cell Biology. ج. 56 ع. 1: 58–67. PMID:1724753.
  • Paralkar VM، Nandedkar AK، Pointer RH، Kleinman HK، Reddi AH (أكتوبر 1990). "Interaction of osteogenin, a heparin binding bone morphogenetic protein, with type IV collagen". The Journal of Biological Chemistry. ج. 265 ع. 28: 17281–4. PMID:2211625.
  • Hernandez MR، Igoe F، Neufeld AH (أغسطس 1986). "Extracellular matrix of the human optic nerve head". American Journal of Ophthalmology. ج. 102 ع. 2: 139–48. DOI:10.1016/0002-9394(86)90134-0. PMID:2426947.
  • Aumailley M، Wiedemann H، Mann K، Timpl R (سبتمبر 1989). "Binding of nidogen and the laminin-nidogen complex to basement membrane collagen type IV". European Journal of Biochemistry / FEBS. ج. 184 ع. 1: 241–8. DOI:10.1111/j.1432-1033.1989.tb15013.x. PMID:2506015.
  • Pihlajaniemi T، Tryggvason K، Myers JC، Kurkinen M، Lebo R، Cheung MC، Prockop DJ، Boyd CD (يونيو 1985). "cDNA clones coding for the pro-alpha1(IV) chain of human type IV procollagen reveal an unusual homology of amino acid sequences in two halves of the carboxyl-terminal domain". The Journal of Biological Chemistry. ج. 260 ع. 12: 7681–7. PMID:2581969.
  • Brinker JM، Gudas LJ، Loidl HR، Wang SY، Rosenbloom J، Kefalides NA، Myers JC (يونيو 1985). "Restricted homology between human alpha 1 type IV and other procollagen chains". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 82 ع. 11: 3649–53. DOI:10.1073/pnas.82.11.3649. PMC:397843. PMID:2582422.
  • Soininen R، Huotari M، Ganguly A، Prockop DJ، Tryggvason K (أغسطس 1989). "Structural organization of the gene for the alpha 1 chain of human type IV collagen". The Journal of Biological Chemistry. ج. 264 ع. 23: 13565–71. PMID:2701944.
  • Siebold B، Deutzmann R، Kühn K (أكتوبر 1988). "The arrangement of intra- and intermolecular disulfide bonds in the carboxyterminal, non-collagenous aggregation and cross-linking domain of basement-membrane type IV collagen". European Journal of Biochemistry / FEBS. ج. 176 ع. 3: 617–24. DOI:10.1111/j.1432-1033.1988.tb14321.x. PMID:2844531.
  • Pöschl E، Pollner R، Kühn K (سبتمبر 1988). "The genes for the alpha 1(IV) and alpha 2(IV) chains of human basement membrane collagen type IV are arranged head-to-head and separated by a bidirectional promoter of unique structure". The EMBO Journal. ج. 7 ع. 9: 2687–95. PMC:457057. PMID:2846280.
  • Bowcock AM، Hebert JM، Christiano AM، Wijsman E، Cavalli-Sforza LL، Boyd CD (1988). "The pro alpha 1 (IV) collagen gene is linked to the D13S3 locus at the distal end of human chromosome 13q". Cytogenetics and Cell Genetics. ج. 45 ع. 3–4: 234–6. DOI:10.1159/000132460. PMID:2891465.
  • Solomon E، Hiorns LR، Spurr N، Kurkinen M، Barlow D، Hogan BL، Dalgleish R (مايو 1985). "Chromosomal assignments of the genes coding for human types II, III, and IV collagen: a dispersed gene family". Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. ج. 82 ع. 10: 3330–4. DOI:10.1073/pnas.82.10.3330. PMC:397769. PMID:2987919.
  • Soininen R، Huotari M، Hostikka SL، Prockop DJ، Tryggvason K (نوفمبر 1988). "The structural genes for alpha 1 and alpha 2 chains of human type IV collagen are divergently encoded on opposite DNA strands and have an overlapping promoter region". The Journal of Biological Chemistry. ج. 263 ع. 33: 17217–20. PMID:3182844.
  • Brazel D، Oberbäumer I، Dieringer H، Babel W، Glanville RW، Deutzmann R، Kühn K (نوفمبر 1987). "Completion of the amino acid sequence of the alpha 1 chain of human basement membrane collagen (type IV) reveals 21 non-triplet interruptions located within the collagenous domain". European Journal of Biochemistry / FEBS. ج. 168 ع. 3: 529–36. DOI:10.1111/j.1432-1033.1987.tb13450.x. PMID:3311751.

روابط خارجية عدل