افتح القائمة الرئيسية

قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات

SCOP
قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات
Scop logo small.gif
معلومات عامة
عنوان الموقع
نوع الموقع
تاريخ الإطلاق
1994
الوضع الحالي
الإصدار الحالي 1.75 (حزيران 2009)
المنظومة الاقتصادية
المقر الرئيسي

قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات (بالإنجليزية: Structural Classification of Proteins database) (مختصرها سكوب أو SCOP) هو دليل تصنيفي إلى حد كبير في المجالات الهيكلية للبروتين على أساس تشابه هياكلها وتسلسل الأحماض الأمينية. الدافع وراء هذا التصنيف هو تحديد العلاقة التطورية بين البروتينات. توضع البروتينات التي تتصف بأشكال متشابهة ولكنها تتصف بوجود القليل من التشابه في التسلسل أو الوظيفة في عوائل رئيسية مختلفة، لكن توضع فرضية أن السلف المشترك بعيد جداً، كما توضع البروتينات التي لها نفس الشكل وبعض التشابه في التسلسل أو الوظيفة في الأسر ذاتها، ويفترض أن يكون لها سلف مشترك أوثق.

قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات يمكن الوصول إليها بحرية على شبكة الانترنت. أنشئت قاعدة البيانات في عام 1994.[1] يصونها أليكسي مورزين وزملاؤه في مختبر علم الأحياء الجزيئي [الإنجليزية] في كامبريدج في إنجلترا.[2][3][4]

في آب 2013، كان الإصدار الحالي من قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات هو 1.75 (والذي صدر حزيران 2009). نسخة من الإصدار التالي من قاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات، وهو ما يسمى بري-سكوب (pre-SCOP)، يمكن الوصول إليها من الصفحة الرئيسية لقاعدة بيانات التصنيف الهيكلي للبروتينات.

بري-سكوب (pre-SCOP) يقصد بها نظرة عامة أو معاينة لقاعدة البيانات وأصلها من كلمة (preview) الإنجليزية.

المصادرعدل

  1. ^ PMID 18000004 (ببمد 18000004)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
  2. ^ Hubbard، T. J.؛ Ailey، B.؛ Brenner، S. E.؛ Murzin، A. G.؛ Chothia، C. (1999). "SCOP: A Structural Classification of Proteins database". Nucleic Acids Research. 27 (1): 254–256. PMC 148149 . PMID 9847194. doi:10.1093/nar/27.1.254. 
  3. ^ Lo Conte، L.؛ Ailey، B.؛ Hubbard، T. J.؛ Brenner، S. E.؛ Murzin، A. G.؛ Chothia، C. (2000). "SCOP: A Structural Classification of Proteins database". Nucleic Acids Research. 28 (1): 257–259. PMC 102479 . PMID 10592240. doi:10.1093/nar/28.1.257. 
  4. ^ PMID 14681400 (ببمد 14681400)
    Citation will be completed automatically in a few minutes. Jump the queue or expand by hand
 
هذه بذرة مقالة بحاجة للتوسيع. شارك في تحريرها.