'''المستعمرة''' {{إنج|Colony}} في [[علم الأحياء]] هو مصطلح يشير إلى عدة متعضيات من نفس [[نوع (تصنيف)|النوع]] تعيش معاً وجنباً إلى جنب.<ref>{{citeاستشهاد bookبكتاب | display-authors=1 | first1الأول1=Michael | last1الأخير1=Begon | first2الأول2=Robert W. | last2الأخير2=Howarth | first3الأول3=Colin R. | last3الأخير3=Townsend | titleعنوان=Essentials of Ecology | editionإصدار=4th | publisherناشر=Wiley | yearسنة=2014 | isbn=0-470-90913-7}}</ref><ref>{{cite journal | title = Quietly Conserving Nature | last = Grove | first = Noel | journal = [[ناشونال جيوغرافيك (مجلة)]] | date = December 1988 | volume = 174 | issue = 6 | page = 822}}</ref><ref>{{cite journal|doi=10.1093/beheco/14.3.417|title= When to bee social: interactions among environmental constraints, incentives, guarding, and relatedness in a facultatively social carpenter bee|year=2003|last1=Dunn|first1=T.|last2=Richards|first2=M.H.|journal=Behavioral Ecology|volume=14|issue=3|pages=417–424}}</ref> ويكون هذا العيش المشترك بهدف المنفعة المتبادلة، كتشكيل جبهة دفاع أقوى أو القدرة على مهاجمة فريسة أكبر كبعض [[حشرة|الحشرات]] مثل [[النمل]] و[[النحل]] لا تعيش إلا في مستعمرات.
المستعمرات [[جرثومة|الجرثومية]] (أو مستعمرات الأحياء الدقيقة) هي عبارة عن تجمع من جراثيم تنمو على سطح أو بين [[مستنبت|مستنبتات]] صلبة، وغالباً ما تنشأ من [[خلية]] واحدة. وباعتبار أن جميع المتعضيات تنحدر من خلية أم مفردة فتكون كل هذه المتعضيات ضمن المستعمرة الواحدة مميزة من الناحية [[جين|الجينية]] (باستثناء [[طفرة|الطفرات]] التي يمكن أن تحدث بنسبة منخفضة وغير قابلة للتحكم). وبالتالي يمكن الاستفادة من المستعمرة بعزل عترات متماثلة جينياً من خليط من الخلايا.
