منذ بدأ الاحتلال، عمل اليهود على تقسيم المسجد الإبراهيمي والاستئثار بمساحات متعددة وتخصيصها لصلاة اليهود، وقد بدأ ذلك يوم [[12 يناير]] [[1972]] حيثُ تم الاستيلاء على الحضرة الإبراهيمية واعتبراها [[كنيس|كنيسًا يهوديًا]] حيث كان اليهود يصلّون فيها بشكل متقطع منذ عام [[1969]]، وفي يوم [[31 أكتوبر]] 1972 قرر الحاكم العسكري ضمّ اليعقوبية لتكونَ مكانًا للصلاة بالإضافة للإبراهيمية، كما سَقَف صحن المسجد وهو الساحة الواقعة بين الإبراهيمية واليعقوبية، ووضع أثاثًا في هذين المكانين، ورافق ذلك منع الزائرين من دخول هذه الأماكن أثناء تواجد [[اليهود]] فيها، كما قرر بالسماح لليهود باستخدام جميع أجزاء المسجد في أعياد اليهود الرسمية، وسمح لهم بدخول المسجد أيام الجُمَع من الساعة 4 - 5.<ref name="صراع2"/>
وكان لتقرير لجنة التحقيق الإسرائيلية "شمغار" الأثر الأكبر على أوضاع مدينة [[الخليل]] عامّة، وعلى أوضاع المسجد الإبراهيمي خاصّة،<ref name=دستور-مجزرة>{{مرجع ويب|العنوان=قرار تهويد الحرم الإبراهيمي نقلة نوعية في المجزرة المفتوحة|المسار=http://www.addustour.com/15679/قرار%20تهويد%20الحرم%20الابراهيمي%20نقلة%20نوعية%20في%20المجزرة%20المفتوحة.html|الناشر=جريدة الدستور|تاريخ الوصول=25 أغسطس 2014|التاريخ=28 فبراير 2010| مسار الأرشيف = https://web.archive.org/web/20160310174647/http://addustour.com/15679/قرار تهويد الحرم الابراهيمي نقلة نوعية في المجزرة المفتوحة%D9%82%D8%B1%D8%A7%D8%B1%20%D8%AA%D9%87%D9%88%D9%8A%D8%AF%20%D8%A7%D9%84%D8%AD%D8%B1%D9%85%20%D8%A7%D9%84%D8%A7%D8%A8%D8%B1%D8%A7%D9%87%D9%8A%D9%85%D9%8A%20%D9%86%D9%82%D9%84%D8%A9%20%D9%86%D9%88%D8%B9%D9%8A%D8%A9%20%D9%81%D9%8A%20%D8%A7%D9%84%D9%85%D8%AC%D8%B2%D8%B1%D8%A9%20%D8%A7%D9%84%D9%85%D9%81%D8%AA%D9%88%D8%AD%D8%A9.html| تاريخ الأرشيف = 10 مارس 2016 | وصلة مكسورة = yes }}</ref> فقد خَرَجت لجنة "شمغار" بتوصيات عديدة عقب أحداث [[مذبحة الحرم الإبراهيمي]] تبنّتها [[مجلس وزراء إسرائيل|الحكومة الإسرائيلية]]، كان أهمّها وأخطرها هو تقسيم الحرم الإبراهيمي بين [[المسلمين]] و[[اليهود]]،<ref name="شمغار">{{مرجع ويب|العنوان=تقرير لجنة التحقيق في مجزرة الحرم الإبراهيمي في الخليل|المسار=http://www.mfa.gov.il/mfa/aboutisrael/state/law/pages/commission%20of%20inquiry-%20massacre%20at%20the%20tomb%20of%20the.aspx|الناشر=وزارة الخارجية الإسرائيلية|تاريخ الوصول=25 أغسطس 2014|المؤلف=لجنة شمغار|اللغة=الإنجليزية|التاريخ=26 يونيو 1994| مسار الأرشيف = https://web.archive.org/web/20190226050057/http://mfa.gov.il/MFA/AboutIsrael/State/Law/Pages/COMMISSION OF INQUIRY%20OF%20INQUIRY- MASSACRE AT THE TOMB OF THE%20MASSACRE%20AT%20THE%20TOMB%20OF%20THE.aspx| تاريخ الأرشيف = 26 فبراير 2019 }}</ref> وطبّقت ذلك في [[29 أغسطس]] من العام نفسه حيث تمّ تقسيم المسجد الإبراهيمي وتحويل جزءٍ منه إلى [[كنيس|كنيس يهودي]] بشكل رسميّ لأوّل مرة في تاريخه، فأصبح 60% من مساحته لليهود، وهي الحضرة اليعقوبية والإبراهيمية واليوسفية، وهو الجزء الذي يضم قبر [[إبراهيم]] وزوجته [[سارة]] وقبر [[يعقوب]] وزوجته [[رفقة]]، وقبر [[يوسف]]، إضافةً إلى صحن المسجد وهي المنطقة المكشوفة فيه. وأمّا باقي المسجد فبقي للمسلمين، وهي القاعة الإسحاقية وهو الجزء الذي يضم قبر [[إسحاق]] وزوجتة [[ليئة]]، كما بقي للمسلمين مصلى الجاولية. وقاموا بفصل هذين الجزئين بحواجز وبوابات حديدية مُحكمة ووضعوا فيها ثكنات عسكرية للإشراف والمراقبة.<ref name="عربية-تقسيم">{{مرجع كتاب|العنوان=الخليل عربيّة إسلاميّة|الناشر=مطابع دار الأيتام الإسلاميّة|الصفحات=296-297|المؤلف=محمد ذياب أبو صالح|الإصدار=2000}}</ref> كما سُمح لليهود باستخدام كامل المسجد 10 أيام في السنة هي أيام أعيادهم، وكذلك 10 أيام في السنة للمسلمين. كما قامت [[إسرائيل]] بتركيب بوابات حديدية ضخمة وأجهزة تفتيش وأغلقت معظم الطرق المؤدية إليه، ووضعت كاميرات مراقبة داخل المسجد لمنع حدوث أي اتصال بين [[المسلمين]] و[[اليهود]].<ref name="الرافد">{{مرجع ويب|العنوان=الحرم الإبراهيمي في الخليل تاريخ من الصمود عبر العصور|المسار=http://www.arrafid.ae/arrafid/p31_12-2011.html|الناشر=مجلة الرافد|تاريخ الوصول=25 أغسطس 2014|المؤلف=أحمد أبو زيد| مسار الأرشيف = https://web.archive.org/web/20170706221208/http://www.arrafid.ae:80/arrafid/p31_12-2011.html | تاريخ الأرشيف = 6 يوليو 2017 | وصلة مكسورة = yes }}</ref><ref>{{مرجع ويب|العنوان=اليوم.. الذكرى الـ20 لمجزرة الحرم|المسار=http://palestine-msc.com/?p=2382|الناشر=مركز الإعلام والدراسات الفلسطينية|تاريخ الوصول=25 أغسطس 2014|التاريخ=25 فبراير 2014| مسار الأرشيف = https://web.archive.org/web/20140908133159/http://palestine-msc.com/?p=2382 | تاريخ الأرشيف = 8 سبتمبر 2014 }}</ref>
