الاتجاهية (علم الأحياء الجزيئي): الفرق بين النسختين

[نسخة منشورة][نسخة منشورة]
تم حذف المحتوى تمت إضافة المحتوى
JarBot (نقاش | مساهمات)
ط بوت:صيانة V3، أضاف وسم مصدر وحيد
JarBot (نقاش | مساهمات)
ط بوت:الإبلاغ عن رابط معطوب أو مؤرشف V4.2 (تجريبي)
سطر 1:
{{مصدر وحيد|تاريخ=ديسمبر 2018}}
[[ملف:DNA chemical structure ar.svg|تصغير|يسار|سلسلة دنا موضح عليها النهايات 5' و3'.]]
'''الإتجاهية''' {{إنج|Directionality}} في [[علم الأحياء الجزيئي]] وفي [[كيمياء حيوية|الكيمياء الحيوية]] هي تحديد الاتجاه بين نهايتي سلسلة واحدة ل[[حمض نووي]]؛ الذي يتم فيه [[نسخ (وراثة)|نسخ]] و[[اصطناع حيوي|اصطناع]] الأحماض النووية والبروتينات.
 
== ترقيم الذرات ==
يتكون الحمض النووي من تكرار لوحدات تسمى [[نوكليوتيد|نوكليوتيدات]] وهذه الوحدات تتكون من [[قاعدة نيتروجينية]] مرتبطة بسكر خماسي ([[ريبوز]] بالنسبة لل[[حمض نووي ريبوزي|رنا]] و[[ريبوز منقوص الأكسجين]] بالنسبة لل[[حمض نووي ريبوزي منقوص الأكسجين|دنا]]) مرتبط بدوره بمجموعة فوسفات.
 
للتفريق بين ذرات ال[[كربون]] الموجودة في السكر وفي القاعدة لنيوكليوتيد معين؛ تم الاتفاق على ترقيم ذرات السكر بأرقام تحتوي على فتحة (') لتمييزها عن ذرات القواعد التي يتم ترقيمها بأرقام لا تحتوي فتحة <ref>[https://www.chemguide.co.uk/organicprops/aminoacids/dna1.html DNA - STRUCTURE] {{Webarchive|url=httphttps://web.archive.org/web/20171016102930/http://www.chemguide.co.uk:80/organicprops/aminoacids/dna1.html |date=16 أكتوبر 2017}}</ref> حيث يتم:
* ترقيم ذرات الكربون [[فورانوز|لحلقة السكر]] إبتداء من الذرة المرتبطة بذرة الأكسجين من جهة وبالقاعدة الآزوتية من جهة أخرى بالأرقام 1' حتى 5'.
* ترقيم القاعدة الآزوتية من نوع [[بيريميدين]] ابتداء من ذرة الآزوت بالاتجاه الأقصر نحو ذرة الآزوت الثانية بالأرقام 1 حتى 6.
سطر 19:
النهاية 5' (تنطق النهاية خمسة فتحة) تعني نهاية سلسلة دنا أو رنا تكون فيها ذرة الكربون الخامسة في حلقة ال[[ريبوز]] أو ال[[ريبوز منقوص الأكسجين]] هي الذرة النهائية. يسمح ارتباط مجموعة فوسفات بالنهاية 5' [[ليغاز الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين|بترابط]] نيوكليوتيدين وذلك بواسطة [[رابطة تساهمية|الترابط التساهمي]] بين مجموعة فوسفات النهاية 5' وهيدروكسيل النهاية 3' لنيوكليوتيد آخر لتشكيل [[رابطة فوسفات ثنائي الأستر]]. إزالة فوسفات النهاية 5' يمنع ترابط النيوكليوتيدات لمنع تشكل أي حمض نووي غير مرغوب فيه ( مثال الربط الذاتي [[ناقل (أحياء جزيئية)|لناقل]] [[بلازميد]] في [[تنسيل جزيئي|التنسيل الجزيئي]])، عادة ما يستخدم علماء البيولوجيا الجزيئية ال[[فوسفاتاز]] لإزالة مجموعة الفوسفات من النهاية 5'.
 
النهاية 5' ل[[حمض نووي ريبوزي رسول|رنا رسول]] حديث التكوين هي المكان الذي يحدث فيه [[قبعة 5'|تقبيع]] ما بعد الترجمة، وهي عملية أساسية لإنتاج رنا رسول ناضج إذ يزيد التقبيع من استقرار جزيء الرنا الرسول أثناء عملية [[ترجمة (وراثة)|الترجمة]] بمنحه مقاومة لعوامل التحلل التي تسببها إنزيمات [[نوكلياز خارجية|النوكلياز الخارجية]] {{بحاجة لمصدر}}. والتقبيع عبارة عن نوكليوتيدة تمت [[مثيلة|مثيلتها]] ([[7-ميثيل غوانوسين|ميثيل غوانوسين]]) مترابطة مع الرنا الرسول برابطة فوسفات ثلاثية 5' - 5' نادرة.
 
[[منطقة جناحية 5'|المنطقة الجناحية 5']] ل[[جين]] يقصد بها عادة منطقة دنا لا يتم ترجمتها إلى رنا وتحتوي هذه المنطقة على [[محفز (علم الوراثة)|المحفز الجيني]] ويمكن أن تحوي كذلك على [[معزز|المعززات]] ومواقع ارتباط بروتين أخرى.
 
[[منطقة 5' غير مترجمة|المنطقة 5' غير المترجمة]] {{ي|(5′-UTR)}} هي منطقة من الجين يتم نسخها إلى رنا رسول وتقع في النهاية 5' لذلك الرنا الرسول، هذه المنطقة من الرنا الرسول قد تتم أو لا تتم ترجمتها إلى بروتين لكن لديها دور في ضبط الترجمة. المنطقة 5' غير المترجمة هي قطعة من الدنا تبدأ من مكان القبعة وتمتد حتى القاعدة التي تسبق AUG [[شيفرة جينية|رامزة]] (كودون) بدء الترجمة [[مسلسلةتسلسل دناحمض نووي|للتسلسل]] الرئيسي، يمكن لهذه المنطقة أن تحوي تسلسلات مثل أماكن ارتباط [[ريبوسوم|الريبوزوم]] و [[تسلسل كوزاك|تسلسلات كوزاك]] التي تحدد نجاعة ترجمة الرنا الرسول أو تؤثر في مدى استقراره.
 
== نهاية 3' ==
سُميت النهاية 3' لسلسلة دنا أو رنا كذلك لأنها تنتهي بمجموعة [[مجموعة هيدروكسيل|هيدروكسيل]] الذرة الثالثة ل[[فورانوز|حلقة السكر]]؛ وتعرف أيضا بنهاية الذيل. هيدروكسيل النهاية 3' ضروري لاصطناع جزيئات أحماض نووية جديد وذلك لأنها [[ليغاز الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين|ترتبط]] بفوسفات النهاية 5' لنكليوتيد آخر ما يسمح بإنشاء سلاسل من نيوكليتيدات مرتبطة ببعضها. يستخدم علماء البيولوجيا الجزيئية نيوكليوتيدات لا تحتوي هيدروكسيل 3' ([[ديوكسي ريبونوكليوتيد]]) لمقاطعة تضاعف الدنا، تسمى هذه التقنية طريقة إنهاء السلسلة بإنقاص الهيدروكسيل أو
[[طريقة سانغر]] وتستخدم في معرفة ترتيب [[تسلسل الحمض النووي|تسلسل النيوكليوتيدات في الدنا]].
 
النهاية 3' ل[[حمض نووي ريبوزي رسول|رنا رسول]] ناشئ هي المكان الذي يحدث فيه [[تذييل بعديد الأدينيلات |تذييل ما بعد الترجمة بعديد الأدينيلات]] والذي يتم فيه ربط سلسلة من 50 إلى 250 جزيء [[أدينوزين]] لإنتاج رنا رسول ناضخ، تساعد هذه السلسلة في تحديد مدى بقاء الرنا الرسول في الخلية وهو مايؤثر على كمية البروتين المنتجة منه.
 
المنطقة الجناحية 3' هي منطقة من الدنا لا يتم نسخها إلى رنا رسول ناضج وهي مجاورة للنهاية 3' للجين المراد نسخه، كان يعتقد في البداية أن هذه المنطقة لا يتم نسخها إطلاقا لكن اكتُشِف بعد ذلك أنه يتم نسخها لرنا ثم تتم إزالتها بسرعة أثناء معالجة [[رناحمض نووي ريبوزي قبل رسول|النسخة الأولية]] لتشكيل الرنا الناضج، المنطقة الجناحية 3' تعتوي عادة على تسلسلات لها تأثير على تشكل النهاية 3' للرنا الرسول ويمكن أن تحوي كذلك معزرات ومواقع أخرى ترتبط بها البروتينات.
 
[[منطقة 3' غير مترجمة|المنطقة 3' غير المترجمة]] {{ي|(3′-UTR)}} هي منطقة من الدنا يتم نسخها إلى رنا رسول وتقع في النهاية 3' لذلك الرنا ولا تحتوي على تسلسلات [[شيفرة جينية|رامزات]] بروتين. يعتبر كل ما هو بين رامزة التوقف وذيل عَدِيْدِ الأدينيلات المنطقة 3' غير المترجمة. يمكن لهذه المنطقة التأثير في نجاعة ترجمة الرنا الرسول أو استقراره كما تحوي تسلسلات مطلوبة لإضافة ذيل عديد الأدينيلات للرنا الرسول، بما في ذلك [[عديد النوكليوتيد]] السداسي AAUAAA.