موسوعة عناصر الحمض النووى (ترميز): الفرق بين النسختين

'''موسوعة عناصر الحمض النووي''' ('''ENCODE''') هو اتحاد البحوث العامة<ref>{{cite journal|العنوان=ENCODE: The human encyclopaedia | journal = Nature | المؤلف = Maher B | السنة = 2012 | volume = 489 | issue = 7414 | الصفحات =46–48 | doi = 10.1038/489046a}}</ref> التي أطلقها [[المعهد الوطني لبحوث الجينوم البشري]] (NHGRI) ب[[الولايات المتحدة الأمريكية|الولايات المتحدة]] في سبتمبر 2003.<ref name="Raney2011">{{Cite journal| المؤلف = Raney BJ, Cline MS, Rosenbloom KR, Dreszer TR, Learned K, Barber GP, Meyer LR, Sloan CA, Malladi VS, Roskin KM, Suh BB, Hinrichs AS, Clawson H, Zweig AS, Kirkup V, Fujita PA, Rhead B, Smith KE, Pohl A, Kuhn RM, Karolchik D, Haussler D, [[جيم كينت]] | العنوان = ENCODE whole-genome data in the UCSC genome browser (2011 update) | journal = [[Nucleic Acids Research|Nucleic Acids Res.]] | volume = 39 | issue = Database issue | الصفحات = D871–5 | السنة = 2011 | الشهر = January | pmid = 21037257 | pmc = 3013645 | doi = 10.1093/nar/gkq1017}}</ref><ref>{{Cite journal| المحرر = Becker PB | المؤلف = ENCODE Project Consortium | العنوان = A User's Guide to the Encyclopedia of DNA Elements (ENCODE) | doi = 10.1371/journal.pbio.1001046 | journal = PLoS Biology | volume = 9 | issue = 4 | الصفحات = e1001046 | السنة = 2011 | pmid = 21526222 | pmc = 3079585}}</ref><ref name="birney">{{cite pmid|17571346}}</ref><ref>{{cite pmid|16925836}}</ref> الهدف هو العثور على جميع العناصر الوظيفية في [[الجينوم]] البشرى ، واحدة من أهم المشاريع التي أفرزها NHGRI بعد أن أكملت بنجاح [[مشروع الجينوم البشري]]. وسيتم الإفراج عن جميع البيانات التي تم إنشاؤها في سياق المشروع بسرعة إلى قواعد البيانات العامة.

 

== الخلفيات ==

 

 

[[ملف:gradient.png|تصغير|500بك]]

المشروع التجريبي للترميز ENCODE أصدر بسرعة كافة البيانات الخاصة به في قواعد البيانات العامة.<ref name="urlENCODE Project at UCSC">{{مرجع ويب|المسار = http://genome.ucsc.edu/ENCODE/ |العنوان = ENCODE Project at UCSC | المؤلف = |الناشر=University of California at Santa Cruz |تاريخ الوصول=2011-08-05| مسار الأرشيف = https://web.archive.org/web/20190407081143/http://genome.ucsc.edu/ENCODE/ | تاريخ الأرشيف = 7 أبريل 2019 }}</ref> تم الانتهاء من المرحلة التجريبية بنجاح ونشرت النتائج في يونيو 2007 في الطبيعة<ref name="birney"/> وفي عدد خاص من مجلة'' بحوث الجينوم''.<ref>{{Cite journal| المؤلف =Weinstock GM | العنوان = ENCODE: More genomic empowerment | doi = 10.1101/gr.6534207 | journal = Genome Research | volume = 17 | issue = 6 | الصفحات = 667–668 | السنة = 2007 | pmid = 17567987 | pmc =}}</ref> استاذ علوم الكومبيوتر في MIT مانوليس Kellis هو واحد من مئات العلماء المشاركين في المشروع ENCODE، وأوضح أن المشروع يزيح الستر تماما عن الاختلافات بين النوكليوتيدات التي تجعلنا متفردين بشر.

 

 

ENCODE يقوم بمسح جميع 3.2 بليون نوكليوتيدات مجتمعة A، C، G T والتي تشكل الجينات وأقسامها التنظيمية. وقد أآحالت بعض المقاطع الأحفورية المثيرة للاهتمام - وبعض آثار DNA من تاريخنا التطوري—ويقترح أن بعض هذه "الجينات الكاذبة" ليست نائمة بعد كل شيء، ولكن لا تزال نشطة ولكن RNAغير مرمزة. أجرى الباحثون فيما بعد أكثر من 400 بحثا تمخضت عن 1600 تجربة شملت 150 نوعا من الأنسجة البشرية خلال السنوات الخمس الماضية لاستجلاء كل هذا النشاط. إذا تم تقديم ترميز في شكل رسوم بيانية، فإن البيانات التي ولدت حتى الآن تملأ ملصقا طوله 30 كيلومترا وارتفاع 16 مترا، وفقا للأسوشيتد برس.

الجانب الأكثر إثارة للاهتمام في الدراسة يبدو أنه الوظيفة القوية جدا للتنظيم الجينى. المتغيرات في الحمض النووي لدينا التي يمكن أن تسبب المرض. لا تتبع دائما الجينات نفسهاوالتي هي مثيرة للاهتمام من وجهة نظر العلاج الجيني. بدلا من ذلك، كانت غالبا ما ترتبط بكونها قطع DNA التي تنظم تلك الجينات. في بعض الأحيان القطع التنظيمية هي قريبة من تلك التي يجري تنظيمها، ولكن في بعض الأحيان انهم بعيدا جدا - على الأقل من وجهة النظر الخطية.

 

 

 

وكانت بيوميد المركزية تنشر مجلات يراجعها الخبراء على مدى 12 عاما , والآن لديها مجموعة من 270 من المجلات في العلوم والطب. فإن جميع المواد . فإن جميع مواد ENCODE الثلاثون يكون الوصول إليها مفتوحا - يعني أن هذه المواد سوف تكون متاحة على الانترنت حيث يمكن الوصول إليها بحرية للجميع وسوف تكون متاحة on the micro-site ENCODE explorer والتي يتم استضافتها من قبل الطبيعة وأيضا من خلال تطبيق آيباد.