سلسلة الرنا: الفرق بين النسختين

[نسخة منشورة][نسخة منشورة]
تم حذف المحتوى تمت إضافة المحتوى
JarBot (نقاش | مساهمات)
ط بوت:الإبلاغ عن رابط معطوب أو مؤرشف V3.5
ط إملاء
سطر 4:
تُستخدم سَلسَلة الرنا في دراسة التغير المستمر لل[[نسخوم]] الخلوي. وبشكل خاص، تسهِّل سَلسَلة الرنا القدرة على تحديد نُسَخِ الجين المضفرة [[وصل متبادل|بالتضفير البديل]]، [[معالجة الحمض النووي الريبوزي|تعديلات ما بعد النسخ]]، [[اندماج الجين]]، الطفرات/ [[تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة]] والتغيرات في التعبير الجيني مع مرور الوقت، أو الاختلافات في التعبير الجيني في مجموعات أو علاجات مختلفة.<ref name="maher2009">{{cite journal | vauthors = Maher CA, Kumar-Sinha C, Cao X, Kalyana-Sundaram S, Han B, Jing X, Sam L, Barrette T, Palanisamy N, Chinnaiyan AM | title = Transcriptome sequencing to detect gene fusions in cancer | journal = Nature | volume = 458 | issue = 7234 | pages = 97–101 | date = March 2009 | pmid = 19136943 | pmc = 2725402 | doi = 10.1038/nature07638 | bibcode = 2009Natur.458...97M }}</ref> فضلا عن نسخ [[الرنا الرسول]]، يمكن لسَلسَلة الرنا البحث في مختلف أنواع الرنا بما في ذلك الرنا الصغير مثل [[الرنا الميكروي]] و[[الرنا الناقل]] و[[الرنا الريبوسومي]].<ref>{{cite journal | vauthors = Ingolia NT, Brar GA, Rouskin S, McGeachy AM, Weissman JS | title = The ribosome profiling strategy for monitoring translation in vivo by deep sequencing of ribosome-protected mRNA fragments | journal = Nature Protocols | volume = 7 | issue = 8 | pages = 1534–50 | date = July 2012 | pmid = 22836135 | pmc = 3535016 | doi = 10.1038/nprot.2012.086 }}</ref> يمكن كذلك استخدام سَلسَلة الرنا لتحديد الحدود بين ال[[إكسون]]ات وال[[إنترون]]ات والتأكد من وتعديل حدود [[نهاية 5'|النهاية 5']] و[[النهاية 3']] الموضوعة سابقا للجينات. التقدمات الحديثة في سَلسَلة الرنا تشمل {{ill|نسخوميات خلية مفردة|lt=سَلسَلة خلية مفردة|en|Single-cell transcriptomics}} والسَلسَلة الموضعية لنسيج مثبت.<ref>{{cite journal | vauthors = Lee JH, Daugharthy ER, Scheiman J, Kalhor R, Yang JL, Ferrante TC, Terry R, Jeanty SS, Li C, Amamoto R, Peters DT, Turczyk BM, Marblestone AH, Inverso SA, Bernard A, Mali P, Rios X, Aach J, Church GM | display-authors = 6 | title = Highly multiplexed subcellular RNA sequencing in situ | journal = Science | volume = 343 | issue = 6177 | pages = 1360–3 | date = March 2014 | pmid = 24578530 | pmc = 4140943 | doi = 10.1126/science.1250212 | bibcode = 2014Sci...343.1360L }}</ref>
 
قبل تطوير سَلسَلة الرنا، كانت دراسات التعبير الجيني تتم بواسطة التهجين المبني على [[مصفوفة دي إن إيه دقيقة|المصفوفات الدقيقة]]، ومن مشاكل المصفوفات الدقيقة: أخطاء التهجين التصالبي (cross-hybridization artifacts)، التكميم (تحديد الكمية) الضعيف للجينات المعبر عنها بقلة أو بكثرة، والحاجة إلى معرفة التسلسل [[بداهة واستدلال|مسبقا]].<ref>{{cite journal | vauthors = Kukurba KR, Montgomery SB | title = RNA Sequencing and Analysis | journal = Cold Spring Harbor Protocols | volume = 2015 | issue = 11 | pages = 951–69 | date = April 2015 | pmid = 25870306 | pmc = 4863231 | doi = 10.1101/pdb.top084970 }}</ref> وبسبب هذه المشاكل التقنية، انتقلت النسخوميات إلى الطرق المبنية على تحديد التسلسل. وتطورت هذه الأخيرالأخيرة من [[سلسلة سانغر|سَلسَلة سانغر]] لمكتبات [[تسلسل وسم معبر عنه|تسلسل الوسم المعبر عنه]] إلى طرق مبنية على وسوم كيميائية (مثل: التحليل التسلسلي للتعبير الجيني) وأخيرا إلى التقانة الحالية: سَلسَلة الجيل التالي أو السَلسَلة عالية الإنتاج للدنا المتمم (وبشكل أخص سَلسَلة الرنا).
 
== مراجع ==
{{مراجع|2}}