حمض نووي ريبوزي: الفرق بين النسختين

[نسخة منشورة][نسخة منشورة]
تم حذف المحتوى تمت إضافة المحتوى
ط بوت:إزالة قالب:وصلة إنترويكي من وصلة زرقاء
وسم: تعديل المحمول المتقدم
سطر 220:
[[ملف:Gelelektrophorese.png|250px|تصغير|يمين|مجموع الرنا لخلية حقيقية النوى بواسطة [[الرحلان الكهربائي باستخدام جيل الأغاروز|الرحلان بهلام الأغاروس]]: a- الدنا الجينومي، b- الرنا الريبوسومي 28S،{{فاصل}} c- الرنا الريبوسومي 18S،{{فاصل}} d- الرنا الريبوسومي والناقل. أنواع الرنا الأخرى بتراكيز منخفضة لا يمكن ملاحظتها.]]
 
دراسة الرنا مماثلة لدراسة الدنا في العديد من النواحي، ف[[استخلاص الرنا]] يتم بتحطيم الخلية وتمزيق غشائها، و[[إفساد (كيمياء حيوية)|تمسيخ]] البروتينات بواسطة مركبات كيميائية، وعكس استخلاص الدنا الذي يمكن فيه تثبيط الإنزيمات القاصة للدنا ([[ديوكسي ريبو نوكلياز|دناز]]) بمجرد [[استخلاب|الارتباط]] بالأيونات ثنائية التكافؤ، يجب عند استخلاص الرنا إبقاء الإنزيمات القاصة للرنا (رناز) غير نشطة بالتبريد أو عبر عوامل تمسيخ شديدة الفعالية مثل {{وصلة إنترويكي|[[كلوريد الغوانيدينيوم|Guanidinium chloride}}]]. حاليا أكثر الطرق شيوعا في استخلاص الرنا تستخدم [[استخلاص فينول-كلوروفورم]] بوجود كلوريد الغوانيدينيوم.<ref name="Chomczynski-2006">{{cite journal | last1 = Chomczynski | first1 = P. | last2 = Sacchi | first2 = N. | title = The single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction: twenty-something years on. | journal = Nat Protoc | volume = 1 | issue = 2 | pages = 581-5 | date = 2006 | doi = 10.1038/nprot.2006.83 | pmid = 17406285}}</ref> بشكل عام، ال[[ريبونوكلياز]]ات مشكل كبير في دراسة الرنا بسبب قدرتها على تحمل [[موصدة|الحرارة]] وإعادة التشكل و[[تطوي البروتين|التطوي]] عند التمسخ.
 
عند استخلاص مجموع الرنا الخلوي، حوالي 98% من العينة عبارة عن رنا ريبوسومي وهذا يعقد دراسة الأنواع الأقل تواترا. يمكن تفكيك الرنا الريبوسومي المتواجد بكثرة إنزيميا أو عبر استخدام طرق أخرى.<ref>{{cite journal | last1 = Peano | first1 = Clelia | title = An efficient rRNA removal method for RNA sequencing in GC-rich bacteria | journal = Microbial Informatics and Experimentation | volume = 3 | issue = 1 | date = 2013-01-01 | pages = 1 | doi = 10.1186/2042-5783-3-1 | spoluautoři=Pietrelli, Alessandro; Consolandi, Clarissa; Rossi, Elio; Petiti, Luca; Tagliabue, Letizia; De Bellis, Gianluca; Landini, Paolo}}</ref> أكثر الطرق المستخدمة في استخلاص أنواع الرنا الأقل تواترا هي استخلاص الرنا الرسول الخاص بحقيقيات النوى باستخدام مُشرِّع قليل ال[[ثيميدين]] (oligo(dt) primer) لتهجين [[تذييل بعديد الأدينيلات|ذيل عديد الأدينيلات]] الخاص بالرنا الرسول، وهذا يسمح باستخلاص جميع جزيئات الرنا الرسول وكذلك الأنواع الأخرى التي تحتوي على ذيل عديد الأدينين (مثل [[رنا غير مشفر طويل|الرنا غير المشفر الطويل]]). من الطرق الأخرى لاستخلاص جزيئات الرنا المستهدفة من خلائطها: [[منبذة فائقة|الطرد المركزي الفائق]] لفصل الرنا أو البروتينات النووية الريبوزية حسب كثافة الطفو وحسب [[استشراب انجذابي|الاستشراب بالألفة]] أو عبر [[ترسيب مناعي|الترسيب المناعي]] للمكون البروتيني الخاص بالبروتين النووي الريبوزي واستخلاص المكون الرنوي المتبقي.