بعد فترة طويلة من المرض قد يتعرض المصاب إلى قلة العظم في العمود الفقري وتخلخله مما يؤدي إلى كسور نتيجة الضغط وتحدّب في الظهر، من العلامات الأساسية لإلتهاب الفقار المقسط المتقدم هي تكون ناتئ عظميّ رباطي يمكن رؤيته في صور الأشعة السينية (X-ray) ونمو غير طبيعي للعظم يؤثر في العمود الفقريّ يظهر كالنابتة العظمية والمَذَل التهاب الأنسجة المحيطة بالأعصاب.
عدا عن العمود الفقريّ المحوري و المفاصلوالمفاصل الأخرى، من أهم الأعضاء المتأثرة بإلتهاب الفقار المقسط هو القلب، الرئتين، القولون، العيون و الكليتين،والكليتين، ومن المضاعفات الأخرى للمرض هي قَلَسُ الأَبْهَرِيّ (أو قصوره)، إلتهابالتهاب وتر أخيلس أو العرقوب ،العرقوب، إحصار القلب و الداء النشوانيّ.<ref name="Alpert">{{مرجع كتاب |عنوان=The AHA Clinical Cardiac Consult |الأخير=Alpert |الأول=Joseph S. |سنة=2006 |ناشر=Lippincott Williams & Wilkins |الرقم المعياري=0-7817-6490-4 }}</ref> قد تظهر صورة الأشعة السينية للصدر تليّف قميّ يعود إلى تليّف الرئة، ومع اختبار وظيفة الرئة قد يظهر ذلك عيب مقيِّد في الرئة، وبعض المضاعفات النادرة التي قد تتعلق بالأعصاب مثل متلازمة ذنب الفرس .<ref name="Alpert" /><ref>{{cite journal | vauthors = Ahn NU, Ahn UM, Nallamshetty L, Springer BD, Buchowski JM, Funches L, Garrett ES, Kostuik JP, Kebaish KM, Sponseller PD | العنوان = Cauda Equina Syndrome in AS (The CES-AS Syndrome): Meta-analysis of outcomes after medical and surgical treatments | journal = J of Spinal Disorders | volume = 14 | issue = 5 | الصفحات = 427–433 | السنة = 2001 | pmid = 11586143 | doi = 10.1097/00002517-200110000-00009 }}</ref>
