حمض نووي ريبوزي: الفرق بين النسختين
[نسخة منشورة] | [نسخة منشورة] |
تم حذف المحتوى تمت إضافة المحتوى
Mr.Ibrahembot (نقاش | مساهمات) ط بوت: تعريب V2.0 |
|||
سطر 1:
{{مراجعة الزملاء|30 مايو 2019}}
[[ملف:Pre-mRNA-1ysv-tubes.png|thumb|220px|left|[[حلقة جذعية]] [[رنا قبل رسول|لرنا رسول أولي]]. [[قاعدة نووية|القواعد النووية]] باللون الأخضر وعمود الريبوز-فوسفات الفقري بالأزرق. وهو سلسلة مفردة متطوية على نفسها [[نيوكليوتيد مكمل|بشكل متكامل]] مكونة لولبا مزدوجا.]]
[[ملف:3IGI v1.png|250px|تصغير|يسار|بنية [[بنية حمض نووي ثالثية|ثالثية]] لجزيء رنا محفز، وهو [[إنترون]] بكتيري من النوع 2 يقص نفسه ذاتيا.<ref>{{
'''الحمض النووي الريبوزي'''{{مر|نجمة|*}} ويُسمى اختصارًا '''رنا RNA'''{{مر|واحد|1}}، هو [[جزيء حيوي]] يتواجد تقريبًا لدى كل [[كائن حي|الكائنات الحية]] وال[[فيروس]]ات، كما يلعب أدوارًا متعددة في [[حمض نووي ريبوزي رسول|نقل]] و[[شيفرة جينية|تشفير]] و[[ترجمة (وراثة)|فك تشفير]] و[[تداخل الحمض النووي الريبوزي|تنظيم]] [[تعبير جيني|التعبير]] عن [[علم الوراثة|المعلومات الوراثية]] وتحفيز العديد من التفاعلات الكيميائية. الرنا وال[[دنا]] (DNA){{مر|اثنين|2}} من أهم [[حمض نووي|الأحماض النووية]] التي تُشكِّل إلى جانب كل من [[بروتين|البروتينات]] وال[[ليبيد]]ات و[[متعدد السكاريد|السكريات المتعددة]] الجزيئات الضخمة الأربعة الضرورية لل[[حياة]].
سطر 24:
[[ملف:Difference_DNA_RNA_AR.svg|تصغير|300px|مقارنة بين ال[[رنا]] (يسار) وال[[دنا]] (يمين)، توضح شكلهما اللولبي والقواعد المتعلقة بكل منهما.]]
البنية الكيميائية للرنا مماثلةٌ جدا لنظيرتها الخاصة بال[[دنا]]، لكن تختلف عنها في ثلاث أمور أساسية:
* على عكس الدنا مزدوج السلاسل، الرنا جزيء ذو سلسلة مفردة<ref>{{
* يحتوي العمود الفقري للدنا المتكون من سكر-فوسفات على ال[[ريبوز منقوص الأكسجين]]، بينما يحتوي عمود الرنا الفقري على ال[[ريبوز]].<ref name="Intro1">{{
* القاعدة المكملة لل[[أدينين]] في الدنا هي ال[[ثايمين]]، لكن في الرنا هي ال[[يوراسيل]] وهي هيئة غير م[[مثيلة]] من الثايمين.<ref name=Biochemistry>{{
مثل الدنا، تملك معظم أنواع الرنا النشطة بما في ذلك [[حمض نووي ريبوزي رسول|الرنا الرسول]]، [[حمض نووي ريبوزي ناقل|الرنا الناقل]]، [[حمض نووي ريبوزي ريبوسومي|الرنا الريبوسومي]]، [[آر أن إيه نووي صغير|الرنا الصغير النووي]]، وغيرها من جزيئات [[حمض نووي ريبوزي غير مشفر|الرنا غيرِ المشفِّرة]] تسلسلاتٍ ذاتيةً مكملةً تسمح لأجزاءٍ منها بالتطوي<ref>{{
== البنية ==
[[ملف:Ribonucleic acid chemical structure ar.svg|220px|تصغير|يسار|البنية الكيميائية للرنا]]
{{مفصلة|بنية الحمض النووي}}
الرنا [[حمض نووي]] وذلك يعني أنه مكون من سلسلة من ال[[نوكليوتيد]]ات، يتكون كل نوكليوتيد في الرنا من سكر [[ريبوز]] ذرات الكربون فيه [[الاتجاهية (علم الأحياء الجزيئي)#ترقيم الذرات|مرقمة من 1' إلى 5']]، [[قاعدة نووية]] (نيتروجينية) ومجموعة [[فوسفات]]. ترتبط القواعد النووية بالريبوز عبر [[رابطة غليكوسيدية]] بين ذرة الكربون 1' وذرة [[نيتروجين]] وهذه القواعد هي: [[أدينين]] [A]، [[ثايمين]] [T]، [[غوانين]] [G]، [[يوراسيل]] [U]، حيث أن الأدينين والغوانين [[بيورين]]ات والسايتوسين واليوراسيل [[بيريميدين]]ات. ترتبط مجموعة الفوسفور بالوضعية 3' في الريبوز الأول وبالوضعية 5' في الريبوز الثاني عبر [[رابطة فوسفات ثنائي الأستر|روابط فوسفات ثنائية الإستر]]، لدى مجموعات الفوسفات شحنات سالبة وهذا يجعل الرنا جزيئا مشحونا ([[كهرل|عديد الأنيون]]). تشكل القواعد [[روابط هيدروجينية]] بين السايتوسين والغوانين وبين الأدينين واليوراسيل.<ref name="pmid15561141"/> استُبدِل الثايمين الخاص بالدنا باليوراسيل في الرنا،<ref name="Lodish">{{ouvrage| nom1 =Lodish| prénom1 =H.| nom2 =Berk| prénom2 =A.| nom3 =Matsudaira| prénom3 =P.| nom4 =Kaiser| prénom4 =C.A.| nom5 =Krieger| prénom5 =M.| nom6 =Scott| prénom6 =M.P.| nom7 =Zipursky| prénom7 =L.| nom8 =Darnell| prénom8 =J.| titre = Biologie moléculaire de la cellule| numéro d'édition =3| éditeur =de Boeck| lieu =Bruxelles| année =2005| isbn =978-2804148027}}</ref> والفرق بين هاتين القاعدتين هو استبدال مجموعة الميثيل في الوضعية الخامسة للثايمين بذرة هيدروجين في اليوراسيل، هذا التعديل في البنية لا يؤثر على خصائص الارتباط مع الأدنين.<ref>{{ouvrage|langue=en|prénom1=Wolfram|nom1=Saenger|titre=Principles of nucleic acid structure|éditeur=Springer|année=1984|isbn=0-387-90762-9}}</ref><ref>{{ouvrage|langue=en|prénom1=Jan|nom1=Barciszewski|prénom2=Brian Frederic Carl|nom2=Clark|titre=RNA biochemistry and biotechnology|éditeur=Springer|année=1999|pages=73–87|oclc=52403776|isbn=0-7923-5862-7}}</ref> توجد تآثرت أخرى بين القواعد مثل ترابط مجموعة من قواعد الأدينين مع بعضها في انتباج،<ref>{{
=== الكيمياء الفراغية للريبوز ===
[[ملف:RNA 2'-endo.svg|200px|تصغير|يمين|'''شكل''' 2: هيئة المصاوغ C'2-[[تصاوغ إندو-إكسو|إندو]] الملاحظة في لوالب الدنا من [[دنا ب|النوع ب]].]]
[[ملف:RNA 3'-endo.svg|200px|تصغير|يسار|'''شكل''' 1: هيئة المصاوغ C'3-[[تصاوغ إندو-إكسو|إندو]] الملاحظة في لوالب الدنا من [[دنا أ|النوع أ]] ولوالب الرنا المزدوجة.]]
من الناحية التصاوغية، يؤثر تواجد ذرة أكسجين في الوضعية 2' في الريبوز على [[تصاوغ شكلي|تصاوغ]] [[مركب حلقي|حلقة]] ال[[فورانوز]] الخاصة بالريبوز. هذه الحلقة [[مركب حلقي غير متجانس|المغايرة]] المكونة من خمس ذرات ليست ذات مستوٍ واحد، ويوجد لها مصاوغات فراغية عديدة منها [[تصاوغ شكلي|مصاوغين]] أساسيين هما: C'2-[[تصاوغ إندو-إكسو|إندو]] وC'3-[[تصاوغ إندو-إكسو|إندو]]. المصاوغ C'3-إندو تكون فيه الذرة رقم 3 في نفس الجانب الذي تتواجد فيه القاعدة النيتروجينية والذرة 5' لسكر الريبوز وتكون المسافة فيه بين مجموعتي الفوسفات هي الأقصر 5.9 أنغستروم (شكل1)، أما المصاوغ C'2-إندو فتكون فيه ذرة الكربون 2 في نفس جانب القاعدة النيتروجينية والذرة 5' لسكر الريبوز ومسافة مجموعتي الفوسفات فيها هي 7 أنغستروم (شكل2).<ref>[http://fbio.uh.cu/sites/genmol/adic/na_arch.htm Nucleic Acid Architecture-Conformational considerations-Ribose ring pucker] {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20180517212501/http://fbio.uh.cu:80/sites/genmol/adic/na_arch.htm |date=17 مايو 2018}}</ref><ref>[https://x3dna.org/highlights/sugar-pucker-correlates-with-phosphorus-base-distance Sugar pucker correlates with phosphorus-base distance] {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20180801100113/http://x3dna.org:80/highlights/sugar-pucker-correlates-with-phosphorus-base-distance |date=01 أغسطس 2018}}</ref> في الرنا الذي يحتوي على ذرة أكسجين بالوضعية 2' يكون المصاوغ C'3-إندو مفضلا<ref>{{Article|langue=en|prénom1=M.|nom1=Sudaralingam|lien auteur1=|titre=Stereochemistry of nucleic acids and their constituents. IV. Allowed and preferred conformations of nucleosides, nucleoside mono-, di-, tri-, tetraphosphates, nucleic acids and polynucleotides|périodique=Biopolymers|lien périodique=|jour=|mois=|année=1969|volume=7|numéro=6|pages=821-860|issn=|url texte=http://www3.interscience.wiley.com/journal/107584763/abstract?CRETRY=1&SRETRY=0|consulté le=}}</ref> ما يعني أن لوالب الرنا المزدوجة تكون من [[دنا أ|النوع أ]] وهي مختلفة عن لوالب الدنا المزدوجة الشائعة والتي تكون أغلبها من [[دنا ب|النوع ب]] الذي يكون فيها الريبوز منقوص الأكسجين على هيئة المصاوغ C'2-إندو.<ref>{{Article|langue=en|prénom1=R.|nom1=Langridge|lien auteur1=|prénom2=P.J.|nom2=Gomatos|lien auteur2=|titre=The Structure of RNA. Reovirus RNA and transfer RNA have similar three-dimensional structures, which differ from DNA.|périodique=[[
=== النوكليوتيدات المعدلة ===
يُنسخ الرنا بأربع قواعد فقط (أدينين، سايتوسين، غوانين واليوراسيل)<ref>{{
يوجد أزيد من 100 نوكليوسيد معدل يظهر طبيعيا.<ref name="Intro2">{{
<ref name="Intro3">{{
=== الرنا مزدوج السلاسل ولولب الرنا المزدوج ===
[[ملف:ABhelices ar.jpg|250px|تصغير|يسار|مقارنة بين بنيتي لولب الدنا ب المزدوج<ref>{{Article|langue=en|prénom1=H.R.|nom1=Drew|prénom2=R.M.|nom2=Wing|prénom3=T.|nom3=Tanako|prénom4=C|nom4=Broka|prénom5=S|nom5=Tanaka|prénom6=K|nom6=Itakura|prénom7=R.E.|nom7=Dickerson|titre=Structure of a B-DNA dodecamer: conformation and dynamics.|périodique=Proc. Natl. Acad. Sci. USA|lien périodique=Proc. Natl. Acad. Sci. USA|jour=|mois=avril|année=1981|volume=78|numéro=4|pages=2179-2183|pmid=6941276|url texte=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC319307/?tool=pubmed|consulté le=}}</ref> ولولب الرنا أ.<ref>{{Article|langue=en|prénom1=Peter S.|nom1=Klosterman|prénom2=Sapan A.| nom2=Shah| prénom3=Thomas A.| nom3=Steitz
|titre=Crystal structures of two plasmid copy control related RNA duplexes: An 18 base pair duplex at 1.20 A resolution and a 19 base pair duplex at 1.55 A resolution.|périodique=Biochemistry|lien périodique=Biochemistry|année=1999|volume=38|numéro=45|pages=14784-14792|pmid= 10555960|DOI=10.1021/bi9912793|url texte=http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/bi9912793|consulté le=}}</ref> الثلم الكبير متغير بشكل كبير.]]
الرنا مزدوج السلاسل (dsRNA) هو رنا له سلسلتين متكاملتين، وهو مشابه للدنا الموجود في الخلايا لكن مع استبدال الثايمين باليوراسيل. يشكل الرنا مزدوج السلاسل المادة الجينية لبعض الفيروسات ([[فيروس رنا مزدوج السلاسل|فيروسات الرنا مزدوجة السلاسل]]). ويمكن لأنواع منه مثل الرنا الفيروسي أو [[حمض نووي ريبوزي متداخل صغير|الرنا الصغير المتداخل]] (siRNA) إثارة [[تداخل الحمض النووي الريبوزي|تداخل الرنا]] لدى [[حقيقيات النوى]] وكذلك استجابة [[إنترفيرون]] لدى ال[[فقاريات]].<ref>{{
اللولب المزدوج من النوع أ الذي يتخذه الرنا له خصائص هندسية مختلفة عن النوع ب الشائع في الدنا، فعدد أزواج القواعد لكل دورة هو 11 بدل عشرة لدى النوع ب. مستوى الزوج القاعدي ليس عموديا على محور اللولب المزدوج بل يشكل زاوية 75° درجة معه.<ref>{{article| langue=en| prénom1=J.M.| nom1=Rosenberg| prénom2=N.C.| nom2=Seeman| prénom3=J.J.| nom3=Kim| prénom4=F.L.| nom4=Suddath | prénom5=H.B.| nom5= Nicholas | prénom6=A.| nom6= Rich| titre=Double helix at atomic resolution.| périodique =Nature| lien périodique =Nature (revue)| jour=| mois=| année=1973| volume=243| numéro=5403| pages=150-154| pmid=4706285| url texte=http://www.nature.com/nature/journal/v243/n5403/abs/243150a0.html| consulté le=6 novembre 2009}}</ref><ref>{{article| langue=en| prénom1=R.O.| nom1=Day| prénom2=N.C.| nom2=Seeman| prénom3=J.M.| nom3=Rosenberg| prénom4=A.| nom4=Rich| titre=A Crystalline Fragment of the Double Helix: The Structure of the Dinucleoside Phosphate Guanylyl-3',5'-Cytidine.| périodique =Proc. Natl. Acad. Sci. USA| lien périodique =Proc. Natl. Acad. Sci. USA| jour=| mois=Mars| année=1973| volume=70| numéro=3| pages=849-853| pmid=4514996| url texte=https://www.jstor.org/stable/62373| consulté le=6 novembre 2009}}</ref> ونتيجة لذلك ينزاح محور الولب ويصبح غير مارٍ عبر مركز الزوج القاعدي بل داخل الثلم الكبير، وهذا يزيد قطر اللولب من 20 أنغستروم لدى النوع ب إلى 26 أنغستروم في النوع أ.<ref>{{article| langue=en| prénom1=Alexander| nom1=Rich| prénom2=David R.| nom2= Davies| titre=A new two stranded helical structure: Polyadenylic acid and polyuridylic acid| périodique =[[Journal of the American Chemical Society|J. Am. Chem. Soc.]]| année=1956| volume=78| numéro=14| pages=3548-3549| DOI=10.1021/ja01595a086| url texte=http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ja01595a086| consulté le=6 novembre 2009}}</ref> هندسة الثلمين تتغير كذلك بشكل كبير: الثلم الصغير يصبح قابلا للوصول بينما يصبح الثلم الكبير أكثر عمقا وحدة. وهذا له تأثير على كيفية تآثر لولب الرنا المزدوج مع البروتينات لأن حدة الثلم الكبير تصبح حاجزا أمام وصول [[ربيطة (كيمياء حيوية)|الربائط]] البروتينية.<ref>{{article| langue=en| prénom1=D.E.| nom1=Draper| titre=Protein-RNA recognition| périodique =Annu. Rev. Biochem.| lien périodique =| jour=| mois=| année=1995| volume=64| numéro=| pages=593-620| pmid=7574494| url texte=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/7574494| consulté le=6 novembre 2009}}</ref>
سطر 84:
== التخليق ==
{{مفصلة|نسخ (وراثة)|بوليميراز الحمض النووي الريبوزي}}
يُحفَّز تخليق الرنا عادة بواسطة إنزيم [[بوليميراز الرنا]] باستخدام الدنا كقالب، وهي عملية تعرف [[نسخ (وراثة)|بالنسخ]]. الشروع في النسخ يبدأ بارتباط الإنزيم بتسلسل [[محفز (علم الوراثة)|محفز]] في الدنا (يتواجد عادة "عكس التيار" في الجين المستهدف). يتم فك لولبة اللولب المزدوج بواسطة إنزيم ال[[هيليكاز]]، ثم يمضي البوليميراز على طول السلسلة القالب في الاتجاه 3' إلى 5' مخلقًا جزيء رنا مكمل تكون فيه الاستطالة في الاتجاه [[الاتجاهية (علم الأحياء الجزيئي)#5' إلى 3'|5' إلى 3']]. يحدد تسلسل الدنا كذلك مكان الانتهاء من الترجمة.<ref>{{
يوجد كذلك العديد من [[بوليميراز الرنا المعتمدة على الرنا|بوليميرازات الرنا المعتمدة على الرنا]] التي تستخدم الرنا كقالب لها لتخليق سلاسل جديدة من الرنا، فمثلا: عدد من فيروسات الرنا (مثل [[فيروسة سنجابية|الفيروسة السنجابية]]) تستخدم هذا النوع من الإنزيم لمضاعفة معلوماتها الجينية.<ref>{{
=== البدء والاستطالة ===
[[ملف:Transcription label en.jpg|250px|تصغير|يسار|صورة بالمجهر الإلكتروني "لأشجار عيد الميلاد" أو "أشجار ميلر" الناتجة عبر نسخ جين نشط.<ref>{{article|langue=en|titre= Electronmicroscopy of genetic activity|périodique=Annu. Rev. Biochem.|année=1973|volume=42|pages=376-396|pmid= 4581229|nom1=Hamkalo|prénom1=B.A.|nom2=Miller|prénom2=O.L.}}</ref> جذع الشجرة مكون من الدنا والتفرعات هي جزيئات مختلفة من الرنا في طور التخليق. هذه الجزيئات قصيرة في مكان بداية النسخ وطويلة عند نهايته.]]
سطر 114:
{{مفصلة|قائمة بأنواع الرنا}}
[[ملف:Rnapol.png|250px|تصغير|يمين|بوليميراز الرنا 2 في مركب مع الدنا (أخضر) لتخليق رنا رسول (أصفر).]]
يقوم الرنا الرسول بنقل المعلومة من الدنا إلى ال[[ريبوسوم]] وهو موقع تخليق البروتين ([[ترجمة (وراثة)|الترجمة]]) في الخلية، ويحدد تشفير تسلسله تسلسل [[حمض أميني|الأحماض الأمينية]] في البروتين الناتج.<ref name=The_Cell>{{
=== الرنا الرسول ===
لا تُستخدم المعلومة الوراثية الموجودة في الدنا من طرف الخلية مباشرة لتخليق البروتينات، بل تُستخدم نسخٌ مؤقتة منها تسمى [[الرنا الرسول]].<ref name="Intro11">{{article|langue=en | titre=An unstable intermediate carrying information from genes to ribosomes for protein synthesis. | périodique=[[
يتكون الرنا الرسول الناضج من ثلاث مناطق مميزة: [[منطقة 5' غير مترجمة]] (5′-UTR) تقع عكس التيار في السيسترون الذي يحملها، منطقة مشفرة، و[[منطقة 3' غير مترجمة]] (3′-UTR).<ref name="Lodish" /> تحتوى المنطقة 5' غير المترجمة على إشارات الترجمة التي تسمح بتوظيف الريبوسوم على السيسترون، يساهم [[الرنا الناقل]] في عملية الترجمة بنقل وإحضار الأحماض الأمينية الضرورية [[اصطناع حيوي للبروتين|للتخليق الحيوي للبروتين]]. داخل الريبوسوم تقوم جزيئات الرنا الناقل باستخدام [[ضد الكودون]] الخاص بها للارتباط بثلاث قواعد -أو [[كودون]]ات- من تسلسل الرنا الرسول، وحين يكون الارتباط كودون-ضد الكودون صحيحا يضيف الريبوسوم الحمض الأميني المحمول بواسطة الرنا الناقل إلى سلسلة البروتين التي في طور التخليق. العلاقة بين الكودونات والأحماض الأمينية تشكل [[شيفرة جينية|الشيفرة الجينية]].<ref>{{article| langue=en |titre=Establishing the triplet nature of the genetic code. |année=2007|périodique=[[Cell (revue scientifique)|Cell]] |volume = 128 | pages = 815-818| nom1=Yanofsky|prénom1=C.|pmid= 17350564}}</ref>
سطر 131:
=== الرنا الناقل ===
الرنا الناقل هو أحد أنواع الرنا القصير ويتراوح طوله بين 70 و100 [[نوكليوتيد]] ويقوم بنقل الأحماض الأمينية إلى الريبوسوم أثناء الترجمة.<ref name="Intro12">{{article|langue=en | titre=A soluble ribonucleic acid intermediate in protein synthesis| périodique=[[J. Biol. Chem.]] | année=1958 | volume=231 | pages=241-257 | pmid= 13538965 | nom1=Hoagland|prénom1=M.B.|nom2=Stephenson|prénom2=M.L|nom3=Scott|prénom3=J.F. |nom4=Hecht|prénom4=H.I.|nom5=Zamecnik|prénom5=P.C.}}</ref> بنيته ثلاثية الأبعاد على شكل [[نفل|ورقة النفل]] وتتكون من أربع [[حلقة جذعية|حلقات جذعية]]، تحتوي إحدى هذه الحلقات على [[مقابلة الرامزة|الكودون المضاد]] وهو ثلاث نوكليوتيدات ترتبط ب[[كودون]]ٍ أثناء ترجمة الرنا الرسول في الريبوسوم.<ref name="Holley">{{article|langue=en | titre=Structure of a ribonucleic acid| périodique=Science |lien périodique= Science (revue)| année=1965| volume=147 | pages=1462-1465 | pmid= 14263761 | nom1=Holley|prénom1=R.W.|nom2=Apgar|prénom2=J.|nom3=Everett|prénom3=G.A. |nom4=Madison|prénom4=J.T.|nom5=Marquisee|prénom5=M.
|nom6=Merrill|prénom6=S.H.|nom7=Penswick|prénom7=J.R.|nom8=Zamir|prénom8=A.}}</ref> الطرف المقابل لحلقة ضد الكودون يحمل الحمض الأميني الموافق للكودون ويكون مرتبطا بالرنا عبر رابطة إستر في النهاية {{ي|3′-OH}}. يُحفَّز تكوين رابطة الإستر هذه بواسطة إنزيمات خاصة تسمى [[مخلقة أمينوسيل الرنا الناقل|مخلقات أمينوسيل الرنا الناقل]]. بمنظور ثلاثي الأبعاد، تتطوى بنية ورقة النفل الخاصة بالرنا الناقل على شكل حرف L يكون ضد الكودون في أحد الأطراف والحمض الأميني المؤستر في الطرف الآخر.<ref name="KlugRich">{{article|langue=en | périodique=[[
|nom6=Clark|prénom6=B.F.|nom7=Klug|prénom7=A.| titre=Structure of yeast phenylalanine tRNA at 3 A resolution. | année=1974 | volume=250 | pmid=4602655 | pages=546–551}}, {{article|langue=en | périodique=[[
|nom1=Kim|prénom1=S.H.|nom2=Suddath|prénom2=F.L.|nom3=Quigley|prénom3=G.J.|nom4=McPherson|prénom4=A.|nom5=Sussman|prénom5=J.L.
|nom6=Wang|prénom6=A.H.|nom7=Seeman|prénom7=N.C.|nom8=Rich|prénom8=A.| titre=Three-dimensional tertiary structure of yeast phenylalanine transfer RNA. | année=1974 | volume=250 | pmid= 4601792 | pages=546–551}}</ref>
سطر 138:
جميع الخلايا الحية تمتلك مجموعة من جزيئات الرنا الناقل المختلفة التي تحمل عدة أحماض أمينية وقادرة على قراءة عدة كودونات. تعتبر جزيئات الرنا "[[موائم|موائمات]]" بين التسلسل الجيني والبروتيني، وكان [[فرنسيس كريك]] هو من اقترح وجود مثل هذه الموائمات قبل اكتشافها سنة 1958.<ref>{{article|langue=en | titre=On protein synthesis| périodique=Symp. Soc. Exp. Biol. | année=58| volume=12 | pages=138-163 | pmid= 13580867 | nom1=Crick|prénom1=Francis H.|lire en ligne= http://profiles.nlm.nih.gov/SC/B/B/Z/Y/_/scbbzy.pdf }}</ref>
=== الرنا الرسول الناقل ===
[[رنا رسول ناقل|الرنا الرسول الناقل]] (tmRNA) يتواجد لدى العديد من البكتيريا [[صانعة|والبلاستيدات]]، ويقوم بوسم البروتينات المشفرة بواسطة جزيئات الرنا الرسول التي لاتملك [[كودون ختامي|كودون توقف]] ليتم تفكيكها ومنع الريبوسوم من التوقف عن العمل.<ref>{{
=== الرنا الريبوسومي ===
[[الرنا الريبوسومي]] هو المكون الذي يقوم بالتحفيز في الريبوسومات. تحتوي ريبوسومات حقيقيات النوى على أربع جزيئات رنا ريبوسومي مختلفة وهي: 18S و 5.8S و28S و5S، ثلاثة منها تُخلََّق في النواة والرابعة تخلق في مكان آخر. يرتبط الرنا الريبوسومي بالبروتين في السيتوبلازم لتشكيل بروتين نووي يسمى ال[[ريبوسوم]]، يرتبط الريبوسوم بالرنا الرسول ويقوم بعملية تخليق البروتين. يمكن للعديد من الريبوسومات الارتباط برنا واحد في أي وقت.<ref name=The_Cell/> الرنا الريبوسومي سائد في معظم أنواع الخلايا ويشكل حوالي 80% من الرنا الخلوي.
سطر 150:
بعد هذه اكتشافات الأولية تم اكتشاف العديد من الريبوزيمات الطبيعية:
* الرنا الخاص [[فيروسي الشكل|بالفيرويدات]] أو ال[[فيروس]]ات الصغيرة ([[فيروسويد]]ات) القادرة على قص نفسها.<ref>{{article|langue=en | titre=Characterization of self-cleavage of viroid and virusoid RNAs. | périodique=[[Methods in Enzymology|Methods Enzymol.]] | année=1990 | volume=181 | pages=583-607 | pmid= 2199768 | nom1=Forster|prénom1=A.C.|nom2=Davies|prénom3=C.|nom4=Hutchins|prénom4=C.J.|nom5=Symons|prénom5= R.H.}}</ref>
* توجد اليوم حجج قوية مبنية على صور ثلاثية الأبعاد تؤكد أن الريبوسوم في حد ذاته عبارة عن ريبوزيم.<ref>{{article|langue=en | titre=Structural biology. The ribosome is a ribozyme. | périodique=[[
* [[جسيم التضفير]] الذي يحفز قص الإنترونات ووصل الإكسونات في الرنا الرسول لدى حقيقيات النوى من الممكن كذلك أن يكون ريبوزيما.<ref name="splice"/>
* بعض ال[[ريبوسويتش]]ات -وهي مناطق تنظيمية في الرنا الرسول- تملك نشاطا إنزيميا في القص عند تواجد [[ربيطة (كيمياء حيوية)|ربيطة]].<ref>{{article|langue=en | nom1=Barrick|prénom1=J.E.|nom2=Corbino|prénom2=K.A.|nom3=Winkler|prénom3=W.C.|nom4=Nahvi|prénom4=A.|nom5=Mandal|prénom5=M.
سطر 156:
|nom11=Wickiser|prénom11=J.K.|nom12=Breaker|prénom12=R.R.| titre=New RNA motifs suggest an expanded scope for riboswitches in bacterial genetic control.| périodique=[[Proc. Natl. Acad. Sci. USA]] | année=2004| volume=101| pages=6421-6426| pmid= 15096624}}</ref>
* توجد كذلك ريبوزيمات مصنعة، والتي يتم تصنيعها في المختبر بواسطة تقنيات مثل [[تطور منظومي للربائط بواسطة الاغناء المطرد|سيليكس]].<ref name="Szostak">{{article
|lang=en | titre= In vitro selection of RNA molecules that bind specific ligands. | périodique=[[
|lang=en | titre= Systematic evolution of ligands by exponential enrichment: RNA ligands to bacteriophage T4 DNA polymerase. | périodique=[[
بشكل عام، التطوي الخاص لهذه الريبوزيمات إلى بنى محددة هو ما يسمح لها بالتعرف على ركائزها وتحفيز تفاعلاتها، كما هو الحال عند الإنزيمات البروتينية.
سطر 166:
* '''[[آر أن إيه نويي صغير|الرنا النويي الصغير]]''': (snoRNA) وهي جزيئات رنا قصيرة (60-300 نوكليوتيد) تتواجد داخل [[نوية (خلية)|أنوية]] و[[جسيم كاخال|جسيمات كاخال]] خلايا حقيقيات النوى وتقوم بتنظيم التعديلات على الرنا الريبوسومي، وبشكل خاص مثيلة أكسجين الذرة 2 بواسطة الرنا النويي C/D و[[سودويوريدين|تعديل اليوريدين]] بواسطة الرنا النويي H/ACA56. تسمح هذه الآلية بالتعديل المحدد لعدة مناطق في الرنا الريبوسومي بواسطة إنزيم واحد فقط باستخدام العديد من جزيئات الرنا النويي كموجهات. في الغالب يتم تشفير سلالسل الرنا النووي بواسطة تسلسلات ال[[إنترون]]ات.<ref>{{article|langue=en | titre=Novel intron-encoded small nucleolar RNAs.| périodique=[[Cell (revue scientifique)|Cell]]| année=1993 | volume=75 | pages=403-405 | pmid= 8221882 |nom1=Liu|prénom1=J.}}</ref>
* '''[[رنا طويل غير مشفر|الرنا الطويل غير المشفر]]''': (lncRNA) هو رنا يزيد طوله عن 200 نوكليوتيدة ولا تتم ترجمته إلى بروتين.<ref name=":1">John L. Rinn and Howard Y. Chang. (2012) “Genome regulation by long noncoding RNAs” ''Annu. Rev. Biochem'' '''81''':1–25. {{doi|10.1146/annurev-biochem-051410-092902}}</ref> دوره في البداية كان غامضا وكان يُعرف بأن [[Xist]] وجزيئات رنا طويلة غير مشفرة أخرى مسؤولة عن [[تعطيل الصبغي X]]، ثم أظهرت جيني لي وآخرون أنه يقوم بتثبيط كتل من الكروماتين عبر توظيف مركب [[عديد الأقماع]] لكي لا يتم نسخ الرنا الرسول منها.<ref>J Zhao, BK Sun, JA Erwin, JJ Song, and JT Lee. (2008) “Polycomb proteins targeted by a short repeat RNA to the mouse X chromosome.” ''Science'' '''322''':750–56. [PubMed: 18974356],</ref> تساهم جزيئات رنا طويلة أخرى في تنظيم [[قوة نفاذية الخلية#تعدد قدرات|تعدد قدرات]] [[الخلية الجذعية]] و[[انقسام خلوي|انقسام الخلية]].<ref name=":1" /> يسمح طول الرنا الكبير باتخاذ بنى ثلاثية الأبعاد معقدة تسمح له بالتآثر مع مختلف العوامل المرافقة مثل [[hnRNP-K]] و[[PRC2]] (وهما مثبطان للنسخ) يتم توجيه هذه المركبات بفضل الرنا الطويل نحو تسلسلات التنظيم الخاصة بالجينات ليتم تثبيط التعبير عنها. علاقة الرنا الطويل مع الدنا تستلزم ترابطا قاعديا بينهما وهذا يعني تشكل لولب ثلاثي دنا-دنا-رنا.<ref>{{article|langue=en | titre=A Large Intergenic Noncoding RNA Induced by p53 Mediates Global Gene Repression in the p53 Response| périodique=[[Cell (revue scientifique)|Cell]]| année=2010 | volume=142 | pages=409-419 | pmid= 20673990 |nom1=Huarte|prénom1=M.|nom2=Jacks|prénom2=T.|nom3=Rinn|prénom3=J.L.}}</ref>.
* '''الرنا المكون للتيلوميراز''': (TERC ) وحدة الرنا الفرعية الخاصة بال[[تيلوميراز]] تحتوي على رنا له علاقة [[منتسخة عكسية|بالنسخ العكسي]] الذي يُخلِّق [[قسيم طرفي|القسيمات الطرفية]] في نهاية الصبغيات. يحتوي هذا الرنا على تسلسل يعمل كركيزة للتيلوميراز ليخلق دنا متكامل التسلسل.<ref>{{article|langue=en | titre=Functional evidence for an RNA template in telomerase.| périodique=[[
* '''[[رنا معزز]]''': لم يتضح بعد إن كان الرنا المُعزِّز فئة مستقلة من الرنا ذات أطوال مختلفة أم فئة خاصة من الرنا الطويل. في كلا الحالتين فإن نسخه يتم من تسلسل ال[[معزز]] وهي تسلسلات تنظيمية في الدنا بالقرب من الجينات التي تنظمها.<ref name=":1" /><ref>RJ Taft, CD Kaplan., C Simons, and JS Mattick, (2009). Evolution, biogenesis and function of promoter- associated RNAs. ''Cell Cycle'' '''8''', 2332–38.</ref> تقوم هذه الجزيئات بتنظيم نسخ الجين بزيادته عند الحاجة وذلك تحت رقابة المعزز الذي تم نسخها منه.<ref name=":1" /><ref>UA Orom, T Derrien, M Beringer, K Gumireddy, A. Gardini, et al.(2010) ‘Long noncoding RNAs with enhancer-like function in human cells.” ''Cell'' '''143''':46–58. [PubMed: 20887892]</ref>
==== رنا منظم لدى بدائيات النوى ====
سطر 175:
الرنا الدائري ويرمز له (circRNA) هو أحد أنواع الرنا منفردة السلاسل والتي تشكل -على عكس الرنا الخطي الشائع- حلقة تساهمية مغلقة تكون فيها النهايتان 3' و5' مترابطتان مع بعظهما. تمنح هذه الميزة العديد من الخصائص للرنا الدائري، والعديد من هذه الخصائص لم يتم اكتشافها إلا حديثا.
تنشأ جزيئات الرنا الدائرية من جينات مشفرة للبروتين، وقد صنفت على أنها رنا غير مشفر لكن ظهر حديثا أنها تشفِّر البروتينات.<ref>{{
لأن الرنا الدائري لا يملك النهايتين 5' و3' فهو مقاوم للتفكك بواسطة [[نوكلياز خارجية|النوكلياز الخارجي]]، ويفترض أنه أكثر استقرار من معظم الرنا الخطي المتواجد في الخلايا.<ref>{{citejournal|last1=Jeck|first1=WR|last2=Sorrentino|first2=JA|last3=Wang|first3=K|last4=Slevin|first4=MK |last5=Burd|first5=CE|last6=Liu|first6=J|last7=Marzluff|first7=WF|last8=Sharpless|first8=NE|display-authors=3|title=Circular RNAs are abundant, conserved, and associated with ALU repeats.|journal=RNA|date=فبراير 2013|volume=19|issue=2|pages=141–57|pmid=23249747|doi=10.1261/rna.035667.112|pmc=3543092}}</ref>
سطر 182:
== جينومات الرنا ==
[[ملف:Poliovirus life cycle ar.jpg|300px|تصغير|يسار|طريقة تضاعف فيروس شلل الأطفال. (في وصف الصورة على كومنز).]]
مثل الدنا يمكن للرنا حمل وتخزين المعلومة الوراثية، [[فيروس حمض نووي ريبوزي|فيروسات الرنا]] لها جينومات مكونة حصريا من الرنا مثل فيروس ال[[إنفلونزا]]، [[فيروس العوز المناعي البشري]]، فيروس [[التهاب الكبد C]]، [[فيروسة سنجابية|فيروس شلل الأطفال]] و[[فيروس إيبولا]] وتقوم بتشفير بعض البروتينات. يتضاعف الجينوم الفيروسي بواسطة بعض هذه البروتينات في حين تقوم البروتينات الأخرى بحماية الفيروس أثناء انتقاله إلى خلايا مضيفة أخرى. ال[[فيرويد]]ات هي نوع آخر من الممرضات، وتتكون من الرنا فقط ولا تشفر أية بروتينات وتتضاعف بواسطة بوليميراز خلية النبات المضيفة.<ref>{{
تنقسم فيروسات الرنا حسب طريقة تضاعفها إلى ثلاث أنواع:
* '''الرنا مزدوج السلاسل''': ويحتوي من واحد إلى عدة أنواع من جزيئات الرنا، كل واحد منها يشفر بروتينا أو عدة بروتينات.<ref name=Gibrat2013>{{
* '''رنا أحادي السلسلة موجب الاتجاه''': يستخدم جينومه مباشرة كرنا رسول، تترجمه ريبوسومات المضيف إلى بروتين وحيد يتم تعديله بواسطة بروتينات المضيف والفيروس لتشكيل مختلف البروتينات المطلوبة للتضاعف. أحد هذه البروتينات هو [[بوليميراز الرنا المعتمدة على الرنا|بوليميراز الرنا المعتمد على الرنا]] (منتسخة الرنا)، الذي ينسخ الرنا الفيروسي لتشكيل نسخة مزدوجة السلاسل. بدورها توجِّه هذه النسخة المزدوجة تكوين جزيئات رنا جديدة.<ref>{{
* '''رنا أحادي السلسلة سالب الاتجاه''': يتطلب نسخ جينومه بواسطة منتسخة الرنا لتشكيل رنا موجب الاتجاه، وهذا يعني أن على الفيروس إحضار إنزيم نسخ الرنا معه. بعدها يعمل جزيء الرنا موجب الاتجاه كرنا رسول ويترجم إلى بروتينات بواسطة الريبوسوم.<ref name=v2015>Li CX, Shi M, Tian JH, Lin XD, Kang YJ, Chen LJ, Qin XC, Xu J, Holmes EC, Zhang YZ (2015) Unprecedented genomic diversity of RNA viruses in arthropods reveals the ancestry of negative-sense RNA viruses. Elife 4. doi: 10.7554/eLife.05378.</ref>
لدى [[فيروس راجع|الفيروسات الراجعة]] جينوم ذو سلسلة رنا أحادية لكنها لا تعتبر من فيروسات الرنا لأنها تستخدم دنا وسيط للتضاعف. يحوِّل إنزيم [[منتسخة عكسية|النسخ العكسي]] الفيروسي -الذي يأتي من الفيروس نفسه بعد أن يزيل كسائه البروتيني- الرنا الفيروسي إلى سلسلة دنا مكملة والتي تُنسخ بدورها لتكوين جزيئة دنا فيروسية مزدوجة السلاسل. بعد ذلك يقوم [[إنزيم مدمج|إنزيم الدمج]] بدمج سلسلة الدنا المزدوجة هذه في جينوم المضيف، التعبير عن الجينات الفيروسية المدمجة قد يقود إلى نشوء فيروسات جديدة.<ref name="Intro14">{{
== فرضية عالم الرنا وأصل الحياة ==
{{مفصلة|فرضية عالم الحمض النووي الريبوزي}}
[[فرضية عالم الرنا]] هي مرحلة افتراضية قديمة لتاريخ الحياة في الأرض تميزت بجزيئات رنا ذاتية التضاعف والتحفيز قبل تطور ال[[دنا]] وال[[بروتين]].<ref name="NYT-20140925-CZ">{{
* {{
* {{harvnb|Robertson|Joyce|2012}}: "There is now strong evidence indicating that an RNA World did indeed exist before DNA- and protein-based life."
* {{harvnb|Neveu|Kim|Benner|2013}}: "[The RNA world's existence] has broad support within the community today."</ref><ref name="NYT-20150504">{{
من الأسلاف المحتملة لتطور [[تخليق البروتين]] نشوء آلية لتخليق [[عامل مرافق (كيمياء حيوية)|عوامل مرافقة]] ببتيدية قصيرة أو آلية لتضاعف الرنا. من المرجح أن الريبوسوم السلف كان مكونا بالكامل من الرنا، ثم تولت البروتينات القيام ببعض وظائفه. من الأسئلة الكبيرة المتبقية في هذا الموضوع هي تحديد القوة الانتقائية التي أدت إلى تطور الريبوسوم وكيفية نشوء [[شيفرة جينية|الشيفرة الجينية]] على هيئتها الحالية.<ref name="Noller2012">{{
== استعمالات علاجية ==
=== الرنا الرسول ===
اقتٌرِح استخدام جزيئات رنا رسول كاملة الطول منذ بداية حقبة [[تقانة حيوية|التقانة الحيوية]]، لكنها لم تلق اهتماما حتى العقد 2010، حين أُسِست شركة "مودرنا ثريبيوتيكا" وتمكنت من جمع مليار دولار تقريبا لتمويل المشروع خلال الأعوام الثلاثة الأولى.<ref name=Xconomy2012>{{
=== الرنا الصغير المتدخل ===
يُستخدم الرنا اليوم في العديد من التطبيقات في علم الأحياء الجزيئي، وبشكل خاص عبر عملية [[تداخل الرنا]] والتي يتم فيها إدراج جزيئات رنا قصيرة مزدوجة السلاسل تسمى [[حمض نووي ريبوزي متداخل صغير|الرنا الصغير المتدخل]] (siRNA) داخل خلايا حقيقيات النوى. تُستخدم جزيئات الرنا هذه التي طولها حوالي 20 زوج قاعدي بواسطة آلية خلوية قادرة على تفكيك الرنا بشكل محدد. لا يتم تفكيك سوى جزيئات الرنا الرسول التي تحوي تسلسلا مماثلا للرنا المتدخل، وهذا يتيح إمكانية تخفيض التعبير عن البروتينات بشكل محدد.<ref>{{article|langue=en|périodique=[[
== التاريخ ==
[[ملف:R Holley.jpg|250px|تصغير|يسار|[[روبرت هولي]] يسارا، مع فريقه البحثي.]]
قاد البحث في الرنا إلى العديد من الاكتشافات البيولوجية والعديد من جوائز نوبل. اكُتشفت [[حمض نووي|الأحماض النووية]] سنة 1868 بواسطة
[[فريدريك ميسشر]] الذي أسماها "نوكليين" لأنه وجدها في النواة.<ref>{{
حدد [[روبرت هولي]] تسلسل نوكليوتدات الرنا الناقل الخاص بالخميرة والتي عددها 77 سنة 1965،<ref>{{
في نفس الوقت تقريبا، وُجد أن لجزيئات رنا طولها 22 نوكليوتيد -تعرف حاليا باسم الرنا الميكروي- دور في تطور [[ربداء رشيقة|الربداء الرشيقة]].<ref>{{
==ملاحظات==
|