حمض نووي ريبوزي: الفرق بين النسختين

[نسخة منشورة][نسخة منشورة]
تم حذف المحتوى تمت إضافة المحتوى
سطر 34:
الرنا [[حمض نووي]] وذلك يعني أنه مكون من سلسلة من ال[[نوكليوتيد]]ات، يتكون كل نوكليوتيد في الرنا من سكر [[ريبوز]] ذرات الكربون فيه [[الاتجاهية (علم الأحياء الجزيئي)#ترقيم الذرات|مرقمة من 1' إلى 5']]، [[قاعدة نووية]] (نيتروجينية) ومجموعة [[فوسفات]]. ترتبط القواعد النووية بالريبوز عبر [[رابطة غليكوسيدية]] بين ذرة الكربون 1' وذرة [[نيتروجين]] وهذه القواعد هي: [[أدينين]] [A]، [[ثايمين]] [T]، [[غوانين]] [G]، [[يوراسيل]] [U]، حيث أن الأدينين والغوانين [[بيورين]]ات والسايتوسين واليوراسيل [[بيريميدين]]ات. ترتبط مجموعة الفوسفور بالوضعية 3' في الريبوز الأول وبالوضعية 5' في الريبوز الثاني عبر [[رابطة فوسفات ثنائي الأستر|روابط فوسفات ثنائية الإستر]]، لدى مجموعات الفوسفات شحنات سالبة وهذا يجعل الرنا جزيئا مشحونا ([[كهرل|عديد الأنيون]]). تشكل القواعد [[روابط هيدروجينية]] بين السايتوسين والغوانين وبين الأدينين واليوراسيل.<ref name="pmid15561141"/> استُبدِل الثايمين الخاص بالدنا باليوراسيل في الرنا،<ref name="Lodish">{{ouvrage| nom1 =Lodish| prénom1 =H.| nom2 =Berk| prénom2 =A.| nom3 =Matsudaira| prénom3 =P.| nom4 =Kaiser| prénom4 =C.A.| nom5 =Krieger| prénom5 =M.| nom6 =Scott| prénom6 =M.P.| nom7 =Zipursky| prénom7 =L.| nom8 =Darnell| prénom8 =J.| titre = Biologie moléculaire de la cellule| numéro d'édition =3| éditeur =de Boeck| lieu =Bruxelles| année =2005| isbn =978-2804148027}}</ref> والفرق بين هاتين القاعدتين هو استبدال مجموعة الميثيل في الوضعية الخامسة للثايمين بذرة هيدروجين في اليوراسيل، هذا التعديل في البنية لا يؤثر على خصائص الارتباط مع الأدنين.<ref>{{ouvrage|langue=en|prénom1=Wolfram|nom1=Saenger|titre=Principles of nucleic acid structure|éditeur=Springer|année=1984|isbn=0-387-90762-9}}</ref><ref>{{ouvrage|langue=en|prénom1=Jan|nom1=Barciszewski|prénom2=Brian Frederic Carl|nom2=Clark|titre=RNA biochemistry and biotechnology|éditeur=Springer|année=1999|pages=73–87|oclc=52403776|isbn=0-7923-5862-7}}</ref> توجد تآثرت أخرى بين القواعد مثل ترابط مجموعة من قواعد الأدينين مع بعضها في انتباج،<ref>{{cite book|title=RNA biochemistry and biotechnology| vauthors= Barciszewski J, Frederic B, Clark C | date = 1999 | pages = 73–87 | publisher = Springer | isbn = 978-0-7923-5862-6 | oclc = 52403776 }}</ref> أو [[حلقة رباعية|الحلقة الرباعية]] GNRA التي يوجد فيها الزوج القاعدي غوانين-أدينين.<ref name="pmid15561141">{{cite journal | vauthors = Lee JC, Gutell RR | title = Diversity of base-pair conformations and their occurrence in rRNA structure and RNA structural motifs | journal = Journal of Molecular Biology | volume = 344 | issue = 5 | pages = 1225–49 |date = ديسمبر 2004 | pmid = 15561141 | doi = 10.1016/j.jmb.2004.09.072 }}</ref>
=== الكيمياء الفراغية للريبوز ===
[[ملف:RNA 2'-endo.svg|200px|تصغير|يمين|'''شكل''' 12: الهيئةهيئة المصاوغ C'2-[[تصاوغ إندو-إكسو|إندو]] الملاحظة في لوالب الدنا من [[دنا ب|النوع ب]].]]
[[ملف:RNA 3'-endo.svg|200px|تصغير|يسار|'''شكل''' 21: الهيئةهيئة المصاوغ C'3-[[تصاوغ إندو-إكسو|إندو]] الملاحظة في لوالب الدنا من [[دنا أ|النوع أ]] ولوالب الرنا المزدوجة.]]
 
من الناحية التصاوغية، يؤثر تواجد ذرة أكسجين في الوضعية 2' في الريبوز على [[تصاوغ شكلي|تصاوغ]] [[مركب حلقي|حلقة]] ال[[فورانوز]] الخاصة بالريبوز. هذه الحلقة [[مركب حلقي غير متجانس|المغايرة]] المكونة من خمس ذرات ليست ذات مستوٍ واحد، ويوجد لها مصاوغات فراغية عديدة منها [[تصاوغ شكلي|مصاوغين]] أساسيين هما: C'2-[[تصاوغ إندو-إكسو|إندو]] وC'3-[[تصاوغ إندو-إكسو|إندو]]. المصاوغ C'3-إندو تكون فيه الذرة رقم 3 في نفس الجانب الذي تتواجد فيه القاعدة النيتروجينية والذرة 5' لسكر الريبوز وتكون المسافة فيه بين مجموعتي الفوسفات هي الأقصر 5.9 أنغستروم (شكل2شكل1)، أما المصاوغ C'2-إندو فتكون فيه ذرة الكربون 2 في نفس جانب القاعدة النيتروجينية والذرة 5' لسكر الريبوز ومسافة مجموعتي الفوسفات فيها هي 7 أنغستروم (شكل1شكل2).<ref>[http://fbio.uh.cu/sites/genmol/adic/na_arch.htm Nucleic Acid Architecture-Conformational considerations-Ribose ring pucker] {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20180517212501/http://fbio.uh.cu:80/sites/genmol/adic/na_arch.htm |date=17 مايو 2018}}</ref><ref>[https://x3dna.org/highlights/sugar-pucker-correlates-with-phosphorus-base-distance Sugar pucker correlates with phosphorus-base distance] {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20180801100113/http://x3dna.org:80/highlights/sugar-pucker-correlates-with-phosphorus-base-distance |date=01 أغسطس 2018}}</ref> في الرنا الذي يحتوي على ذرة أكسجين بالوضعية 2' يكون المصاوغ C'3-إندو مفضلا<ref>{{Article|langue=en|prénom1=M.|nom1=Sudaralingam|lien auteur1=|titre=Stereochemistry of nucleic acids and their constituents. IV. Allowed and preferred conformations of nucleosides, nucleoside mono-, di-, tri-, tetraphosphates, nucleic acids and polynucleotides|périodique=Biopolymers|lien périodique=|jour=|mois=|année=1969|volume=7|numéro=6|pages=821-860|issn=|url texte=http://www3.interscience.wiley.com/journal/107584763/abstract?CRETRY=1&SRETRY=0|consulté le=}}</ref> ما يعني أن لوالب الرنا المزدوجة تكون من [[دنا أ|النوع أ]] وهي مختلفة عن لوالب الدنا المزدوجة الشائعة والتي تكون أغلبها من [[دنا ب|النوع ب]] الذي يكون فيها الريبوز منقوص الأكسجين على هيئة المصاوغ C'2-إندو.<ref>{{Article|langue=en|prénom1=R.|nom1=Langridge|lien auteur1=|prénom2=P.J.|nom2=Gomatos|lien auteur2=|titre=The Structure of RNA. Reovirus RNA and transfer RNA have similar three-dimensional structures, which differ from DNA.|périodique=[[Science (revue)|Science]]|lien périodique=|jour=|mois=|année=1963|volume=141|numéro=4|pages=694-698|pmid= 13928677|url texte=|consulté le=}}</ref>
 
=== النوكليوتيدات المعدلة ===