ينتسب الرئيس جعفر نميري إلى قبيلة الدناقلة وهي من القبائل النوبية في شمال السودان. درس النميري بمدرسة الهجرة [[أم درمان|بأم درمان]] والوسطى الابتدائي بمدرسة ود مدني الأميرية ثم مدرسة حنتوب وبعد ذلك تقدم ل[[جامعة الخرطوم|كلية الخرطوم الجامعية]] ولكنه آثر الالتحاق [[الكلية الحربية السودانية|بالكلية الحربية السودانية]] لأسباب مادية <ref>http://www.sudanway.sd/charact_nomeiri.htm</ref> عام 1950م. تخرج في [[الكلية الحربية السودانية|الكلية الحربية]] ب[[أم درمان]] عام 1952، وحصل على الماجستير في العلوم العسكرية من [[:en:Fort Leavenworth|فورت ليفنورث]] بأركنساس الولايات المتحدة الأميركية سنة 1966.
تنقل النميري في عدة مواقع عمل في [[الجيش السوداني]] شمالاً وجنوباً. واتهم عام 1955 بتدبير انقلاب عسكري على النظام الديمقراطي القائم في البلاد في ذلك الوقت، غير أنه «تبين للقيادة بعد التحقيق معه أن الأمر ليس أكثر من وشاية، وبعدما تبين لها ذلك حُفظ التحقيق».
