[[ملف:Megalodon skeleton.jpg|تصغير|يمين|هيكل عظمي لميجالودون معاد بناءه في متحف كاڤرت البحري بالولايات المتحدة.]]
يتم تمثيل الميجالودون في السجل الحفري بواسطة [[سن|الأسنان]] و[[عمود فقري|العمود الفقري]] والبراز المتحجر.<ref name="G" />{{rp|57}} وكما هو الحال مع كل القروش، يتكون [[هيكل (أحياء)|الهيكل العظمي]] للميجالودون من [[غضروف|الغضاريف]] بدلًا من [[عظم|العظام]]؛ وبالتالي فإن معظم العينات الحفرية تُحفظ حِفظًا سيئًا.<ref>{{cite web|url=http://www.fossilguy.com/gallery/vert/fish-shark/carcharocles/carcharocles.htm|title=Megalodon Shark Facts and Information: The Details| publisher=fossilguy.com|accessdate=18 September 2017}}</ref> ومن أجل دعم أسنانه الكبيرة كان فكَّي الميجالودون أكثر ضخامة وقوة وأكثر تطورًا من نظيريهما في القرش الأبيض الكبير، الذي لديه أسنان ناحلة نسبيًا. وكان قحفه الغضروفي،الغضروفي؛ الجمجمة الغضروفية، ربما كان لها مظهرًا أكثر امتلاءً وأكثر قوةً من مظهر الأبيض الكبير، وكان زعانفه متناسبة من حجمه الأكبر.<ref name="G" />{{rp|64–65}}
وقد تم العثور على بعض حفريات [[فقرة (تشريح)|الفقرات]]، المثال الأكثر بروزًا هو العمود الفقري الذي حُفِظ حِفْظًا جيدًا من عينة واحدة، تم استخراجه في حوض [[أنتفيرب (مقاطعة)|أنتفيرپ]] ببلجيكا في سنة 1926.1926، ويشمل 150 جسمًا فقريًا، والتي يتراوح قُطرها من 55 مليمتر (2.2 بوصة) إلى 155 مليمتر (6 بوصات). وربما كانت فقرات القرش أكبر حجمًا من هذا بكثير، وكشفت العينة التي تم فحصها بدقة عن أنه كان لديه عدد من الفقرات أعلى من عينات أي قرش معروف، ربما أكثر من 200 جسمًا فقريًا، فقط الأبيض الكبير هو الذي اقترب من هذا العدد.<ref name="G">{{Cite book|last1=Klimley|first1=Peter|last2=Ainley|first2=David|title=Great White Sharks: The Biology of Carcharodon carcharias|publisher=Academic Press|year=1996|url={{google books|plainurl=yes|id=2My8M5tL-KIC|page=9}}|isbn=978-0-12-415031-7|chapter=Evolution|location=San Diego, California|oclc=212425118}}</ref>{{rp|63–65}} وتم استخراج عمود فقري آخر حُفِظ جزئيًا في تكوين جرام في الدنمارك في سنة 1983، والذي يشمل 20 جسمًا فقريًا، والتيوالذي يتراوح قُطرهاقُطرهم من 100 مليمتر (4 بوصات) إلى 230 مليمتر (9 بوصات).<ref name="Den">{{Cite journal|last=Bendix-Almgreen|first=Svend Erik|title=''Carcharodon megalodon'' from the Upper Miocene of Denmark, with comments on elasmobranch tooth enameloid: coronoïn|journal=Bulletin of the Geological Society of Denmark|volume=32|pages=1–32|year= 1983|url=http://2dgf.dk/xpdf/bull32-01-02-1-32.pdf}}</ref>
[[ملف:Giant white shark coprolite (Miocene; coastal waters of South Carolina, USA).jpg|تصغير|براز متحجر يعود للميجالودون.]]
بقايا البراز المتحجز هي على شكل حلزوني، وهي تشير إلى أن الميجالودون ربما كان لديه صمام حلزوني، وهو جزء من [[قناة هضمية|الأمعاء السُفلية]] يشبه الفتَّاحة اللولبية، وهو مماثل للمنياتلمثيله في لمنيات الشكل المعاصِرة. وقد تم العثور على بقايا براز متحجر من فترة الميوسين في [[مقاطعة بوفورت (كارولينا الجنوبية)|مقاطعة بوفورت بكارولينا الجنوبية]]، مقياس أحدهمأحدها هو {{حول|14|cm|in|abbr=on}}.<ref>{{cite journal|url={{google books|plainurl=yes|id=C_MoCgAAQBAJ|page=301}}|first=G. L.|last=Stringer|first2=L.|last2=King|year=2012|title=Late Eocene Shark Coprolites from the Yazoo Clay in Northeastern Louisiana|journal=New Mexico Museum of Natural History and Science, Bulletin 57|series=Vertebrate Corpolites|page=301}}</ref>
وقد قام جوتفريد وزملاءه بإعادة بناء هيكل عظمي كامل لميجالودون، والذي عُرض لاحقًا في "متحف كاڤرت البحري" بالولايات المتحدة ومتحفو"متحف إيزيكو الجنوب أفريقي".<ref name="G" />{{rp|56}}<ref name="C">{{cite web|last=Andres|first=Lutz|title=''C. megalodon'' — Megatooth Shark, ''Carcharodon'' versus ''Carcharocles''|url=http://www.fossilguy.com/topics/megshark/megshark.htm|year=2002|publisher=fossilguy.com|accessdate=16 January 2008}}</ref> إعادة البناء هذه طولها 11.3 مترًا (37 قدمًا) وتُمثل ذكرًا ناضجًا.<ref name="G" />{{rp|61}} بُنِيَت على أساس تغييرات نشوء الفرد التي يمر بها القرش الأبيض الكبير على مدار حياته.<ref name="G" />{{rp|65}}
