عتائق: الفرق بين النسختين
[نسخة منشورة] | [نسخة منشورة] |
تم حذف المحتوى تمت إضافة المحتوى
لا ملخص تعديل |
لا ملخص تعديل |
||
سطر 47:
'''البكتيريا القديمة'''<ref>[https://books.google.jo/books?id=9mBQCgAAQBAJ&pg=PA560&lpg=PA560&dq=بكتيريا+قديمة&source=bl&ots=-UzxXo1s3P&sig=X0uKvdw68Rywb0HciTOgMLpOYPs&hl=ar&sa=X&ved=0ahUKEwiylIH1qvrLAhWJHxoKHbhJAlcQ6AEIcjAU#v=onepage&q=%22%D8%A8%D9%83%D8%AA%D9%8A%D8%B1%D9%8A%D8%A7%20%D9%82%D8%AF%D9%8A%D9%85%D8%A9%22&f=false علم الأحياء بواسطة بيتر هـ. ريفن،جورج ب. جونسون،جوناثان ب. لوسوس،كينيث أ. ماسون،سوزان ر. سنجر، صفحة 560]</ref> أو '''العتائق'''<ref>[http://www.emro.who.int/umd/ القاموس الطبي الموحد]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20120525032413/http://www.emro.who.int:80/umd/ |date=25 مايو 2012}}</ref> أو '''البَدْئِيَات'''<ref>[http://www.oloommagazine.com/Home/Default.aspx مجلة العلوم]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20180104050953/http://www.oloommagazine.com:80/home/Default.aspx |date=04 يناير 2018}}</ref> أو '''الأًصليات''' أو '''فوق مملكة الأثريات''' ('''الجراثيم العتيقة''' أو '''الجراثيم الأصلية''') {{اسم علمي|Archaea}} تشكل مملكة ونطاق من الاحياء الدقيقة وحيدة الخلية. العتائق كائنات وحيدة الخلية لا تحوي نواة خلوية وعضيات ذات أغشية فهي من ضمن بدائيات النوى. تصنف عادة على أنها ضمن مملكة الوحدانات أو البدائيات (مونيرا) في التصنيف الحيوي خماسي الممالك. مع ذلك لا يوجد تأكيد على تقارب وراثي عرقي للمجموعات فيه.
صنفت الأصليات في البداية على
فيما بعد تم تصنيف الأصليات الي شعب عدة اعتمادا على تحليل عينات الأحماض النووية لمعظمها من البيئات التي تعيش فيها عوضا عن دراستها في المختبر، لذلك يعد تصنيف الأصليات ليس بهذا القدر من السهولة.
تتشابه البكتيريا والبكتيريا القديمة في كونهما ذواتا خلية حيوية بدائية وفي الحجم والشكل بالرغم من وجود بعض الاصليات ذات أشكال غريبة مثل الشكل المسطح والمربعي لخلايا (''Haloquadratum walsbyi'') الذي يعتبر نوع من البكتيريا القديمة في الهرم التصنيفي للكائنات الحية. في المقابل تختلف البكتيريا القديمة في الجينات ومساراتها الايضية التي تشابه فيها حقيقيات النوى كما هو الحال في الانزيمات المتعلقة بالترجمة والنسخ الجيني. كما ويختلف الغشاء البلازمي لها عن باقي النطاقات في كونه مكون من الجليسيرول المرتبط بسلاسل هيدروجينية من خلال روابط الايثر المختلفة عن روابط الايستر في النطاقات
تتكاثر البكتيريا القديمة بإحدى الطرق الآتية:
سطر 66:
صنفت البكتيريا القديمة لأول مرة كمجموعة منفصلة من بدائيات النوى، في عام 1977 من قبل كارل ووز وجورج فوكس في أشجار النشوء على أساس تسلسل الحمض النووي للحمض النووي الرسول<ref>Woese C; Fox G (1977). [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC432104 "Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: the primary kingdoms"]. ''Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America'''''74''' (11): 5088–90. <nowiki/>[[بيب كود]]:[http://adsabs.harvard.edu/abs/1977PNAS...74.5088W 1977PNAS...74.5088W].[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد سنترال]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC432104 432104]. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/270744 270744] {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20180510210733/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC432104/ |date=10 مايو 2018}}</ref> وقد سميت هاتان المجموعات بالبكتيريا القديمة والبكتيريا الحقيقية على أساس أنها ممالك. لاحقا قال كارل ووز بأن هذه المجموعة من بدائيات النوى هو نوع مختلف اختلافا جوهريا، وللتاكيد على هذا الاختلاف، اقترح كارل ووز في وقت لاحق نظام طبيعي جديد من الكائنات الحية مع ثلاث نطاقات منفصلة (حقيقيات النوى، البكتيريا، والبكتيريا القديمة) وقد سميت هذه الثورة بـ(الثورة الوزيانية)<ref>Woese CR; Kandler O; Wheelis ML (1990). [http://www.pnas.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=2112744 "Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya"]. ''Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America'' '''87''' (12): 4576–9.[[بيب كود]]:[http://adsabs.harvard.edu/abs/1990PNAS...87.4576W 1990PNAS...87.4576W].[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد سنترال]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC54159 54159]. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/2112744 2112744] {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20160411044637/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC54159/ |date=11 أبريل 2016}}</ref>.
في اللغة الإنجليزية، كلمة الأشياء القديمة اتية من اللغة اللاتينية القديمة حيث ان الممثلون الاوائل من مجال البكتيريا القديمة هي البكتيريا المنتجة للغاز الميثان حيث افترض العلماء ان عملية الايض لديهم تعكس الغلاف الجوي الأرضي البدائي والعصور القديمة للكائنات الحية. لفترة طويلة عرف عن البكتيريا القديمة بانها لا توجد الا في البيئات القاسية مثل الينابيع الساخنة و البحيرات المالحة، لكن مع دراسة مواطن جديدة تم اكتشاف المزيد من البكتيريا القديمة مثل البكتيريا محبات الملوحة
اليوم، العتائق معروفة بكونها مجموعة كبيرة و متنوعة من الكائنات الحية التي تم توزيعها على نطاق واسع في الطبيعة و شائعة في جميع البيئات. هذا التقدير و النتشار للبكتيريا القديمة اتى من (تفاعل البلمرة المتسلسل) لكشف بدائيات النوى عن غيرها من العينات البدائية عن طريق تحليل الجينات الريبوسومية <ref>DeLong EF (1998). "Everything in moderation: archaea as 'non-extremophiles'". ''Current Opinion in Genetics & Development'' '''8''' (6): 649–54. <nowiki/>[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9914204 9914204]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20160306094844/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9914204 |date=06 مارس 2016}}</ref>. هذا يسمح بالكشف و تحديد الكائنات التي لم يتم زراعتها في المختبر<ref>Theron J; Cloete TE (2000). "Molecular techniques for determining microbial diversity and community structure in natural environments". ''Crit. Rev. Microbiol.'' '''26''' (1): 37–57. <nowiki/>[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10782339 10782339]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20160307161217/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10782339 |date=07 مارس 2016}}</ref><ref>Schmidt TM (2006). [http://www.im.microbios.org/0903/0903217.pdf "The maturing of microbial ecology"] (PDF). ''Int. Microbiol.'' '''9''' (3): 217–23. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17061212 17061212]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20161119044212/http://www.im.microbios.org/0903/0903217.pdf |date=19 نوفمبر 2016}}</ref>.
سطر 170:
ومن الميزات الأخرى التي تميز البكتيريا القديمة هي تنظيم الجينات التي تقوم بوظائف مترابطة (ذات صلة ) مثل الإنزيمات التي تحفز الخطوات في المسار الأيضي في قواعد الصمامات الدقيقة وهناك إختلافات كبيرة في جينات الحمض النووي الفعال (tRNA) والأخير أمين للحمض النووي الرايبوزي الفعال الخاص بها <ref name="ReferenceC"/>، النسخ في البكتيريا القديمة يشبه النسخ في حقيقيات النوى أكثر من النسخ في البكتيريا ومع بلمرة الحمض النووي الرايبوزي في البكتيريا القديمة تصبح قريبة جداً من نظيرها في حقيقيات النوى <ref>[121]</ref> بينما الترجمة في البكتيريا القديمة تظهر إشارات مشابهة في البكتيريا وحقيقيات النوى <ref>[135]</ref> على الرغم من أن البكتيريا القديمة لها نوع واحد من بوليمرات الحمض النووي الرايبوزي إلا أن تركيبها ووظائفها في النسخ تبدو قريبة ومشابهة لتلك في حقيقيات النوى ومع ذلك وظيفة النسخ في البكتيريا القديمة هي أقرب إلى تلك في البكتيريا <ref>[137]</ref>، ومعالجة الحمض النووي الرايبوزي هو أبسط كما هو عليه في حقيقيات النوى لأن معظم جينات البكتيريا القديمة تفتقر إلى الأنترونات على الرغم أن هناك العديد من الأنترونات في الحمض النووي الرايبوزي الفعال<ref>[138]</ref> وقد تحدث الأنترونات في ترميز البروتينات في الجينات.<ref>[139] [140]</ref>
نقل الجينات والتبادل الوراثي المحبة للماء البركاني محلول ملحي حاد (archeon ) وتشكل جسور السيتوبلازما بين الخلايا التي تستخدم لنقل الحمض النووي من خلية إلى أخرى <ref>[141]</ref> عندما تتعرض (hyper thermophilic archea salfolobus solfataricus ) <ref name="مولد تلقائيا2">[142]</ref> والبكتيريا التي تنمو على درجات حموضة عالية <ref name="مولد تلقائيا1">[143]</ref> للحمض النووي التالف فإنها تسبب الأشعة فوق البنفسجية بليوميسين وميتوميسين C، ومجموعة أنواع محددة من الخلوية أنتجت وتجمعت في S. سولفاتاريكاس (Solfataricus) لا يمكن أن يكون أنتج بواسطة ضغوطات فيزيائية كدرجة الحموضة وتحول درجة الحرارة <ref name="مولد تلقائيا2" /> مشيراً إلى أن التجميع أنتج بسبب تلف الحمض النووي، والتجميع الخلوي الناجم عن الأشعة فوق البنفسجية بواسطة تبادل الكروموسومات مع إرتفاع وتيرة في بكتيريا عالية الحموضة، تجاوزت معدلات إعادة تركيب تلك البيئات غير المسببة بنسبة تصل إلى ثلاث درجات. يفترض<ref name="مولد تلقائيا2" />(Frols) و <ref name="مولد تلقائيا1" />(Ajon) وآخرون أن التجمع الخلوي يعزز أنواع محددة من ناقلات الحمض النووي بين خلايا
== بيئيا ==
=== مواطن تواجدها ===
تتواجد البكتيريا القديمة على نطاق واسع من المواطن، وكجزء رئيسي من النظم البيئية العالمية،<ref name=":1">DeLong EF (1998). "Everything in moderation: archaea as 'non-extremophiles'". ''Current Opinion in Genetics & Development'' '''8''' (6): 649–54.[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9914204 9914204]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20160306094844/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9914204 |date=06 مارس 2016}}</ref> قد تشكل البكتيريا القديمة 20% من الخلايا الميكروبية في المحيطات،<ref>DeLong EF; Pace NR (2001). "Environmental diversity of bacteria and archaea". ''Syst. Biol.'' '''50''' (4): 470–8. <nowiki/>[[معرف الوثيقة الرقمي]]:.[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12116647 12116647]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20170417071215/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12116647 |date=17 أبريل 2017}}</ref> إن البكتيريا القديمة المحبة للظروف القاسية تعد أول نوع تم اكتشافه من البكتيريا القديمة،<ref name="ncbi.nlm.nih.gov">Valentine DL (2007). "Adaptations to energy stress dictate the ecology and evolution of the Archaea".''Nature Reviews Microbiology'' '''5''' (4): 316–23.[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17334387 17334387]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20160305145307/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17334387 |date=05 مارس 2016}}</ref> وفي الواقع بعض أنواع البكتيريا القديمة تستطيع العيش في درجات حاراة مرتفعة غالبا فوق °100 سلسيوس غالبا توجد في السخانات، والمنافس الحرمائية، وآبار النفط، وتشمل المواطن الأخرى الشائعة المواطن الباردة الباردة جدا وشديدة الملوحة
أعضاء البكتيريا القديمة المحبة للظروف القاسية تنتمي لأربع مجموعات فسيولوجية
البكتيريا القديمة المحبة للملوحة والتي تضم جنس الملحاء، تعيش في البيئات المالحة للغاية مثل البحيرات المالحة، وتفوق عدد نظرئها من البكتيريا التي التي تعيش في الأوساط المعتدلة الملوحة بحوالي أكثر من 20-25 %.<ref name="ncbi.nlm.nih.gov"/> البكتيريا القديمة المحبة للحرارة تنمو أفضل ما يمكن على درجات الحرارة فوق 45° سلسيوس. في الأماكن مثل الينابيع الحارة، البكتيريا القديمة المحبة للحرارة العالية جدا تنمو بشكل مثالي على درجات الحرارة أعلى من 80° سلسيوس.<ref>Madigan MT; Martino JM (2006). ''Brock Biology of Microorganisms'' (11th ed.). Pearson. p. 136. <nowiki/>[[رقم دولي معياري للكتاب]] <nowiki/>[[خاص:BookSources/0-13-196893-9|0-13-196893-9]].</ref> أما سلالة 116 من البكتيريا القديمة Methanopyrus kandleri تستطيع أن تنمو على درجة حرارة 122°سلسيوس وهي أعلى درجة حرارة سجلت لأي كائن حي.<ref>Takai K; Nakamura K; Toki T; Tsunogai U; Miyazaki M; Miyazaki J; Hirayama H; Nakagawa S; Nunoura T; Horikoshi K (2008). [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2490668 "Cell proliferation at 122°C and isotopically heavy CH4 production by a hyperthermophilic methanogen under high-pressure cultivation"]. ''Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America'' '''105''' (31): 10949–54. <nowiki/>[[بيب كود]]:[http://adsabs.harvard.edu/abs/2008PNAS..10510949T 2008PNAS..10510949T].[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد سنترال]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2490668 2490668].[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18664583 18664583]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20160309165925/http://www.ncbi.nlm.nih.gov:80/pubmed/18664583 |date=09 مارس 2016}}</ref>
سطر 185:
هذه المقاومة العالية للبيئات القاسية جعلت البكتيريا القديمة محور التكهنات حول الخصائص الممكن للحياة خارج كوكب الأرض<ref>Javaux EJ (2006). "Extreme life on Earth—past, present and possibly beyond". ''Res. Microbiol.'' '''157'''(1): 37–48. <nowiki/>[[معرف الوثيقة الرقمي]]:.[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16376523 16376523]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20160305065402/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16376523 |date=05 مارس 2016}}</ref> حيث أن بعض المواطن ذات الظروف القاسية لا تختلف عن تللك الموجودة على سطح المريخ <ref>Nealson KH (January 1999). [http://www.kluweronline.com/art.pdf?issn=0169-6149&volume=29&page=73 "Post-Viking microbiology: new approaches, new data, new insights"] (PDF). ''Origins of Life and Evolution of Biospheres'' '''29''' (1): 73–93.[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11536899 11536899]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20180117171438/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11536899 |date=17 يناير 2018}}</ref> الأمر الذي أدى إلى اقتراح وجود ميكروبات حية يمكن نقلها بين الكواكب بواسطة النيازك.<ref>Davies PC (1996). "The transfer of viable microorganisms between planets". ''Ciba Found. Symp.'' '''202''': 304–14; discussion 314–7. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9243022 9243022]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20160306093339/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9243022 |date=06 مارس 2016}}</ref>
في الآوانة الأخيرة، أظهرت العديد من الدراسات أن البكتيريا القديمة موجودة ليس فقط في البيئات الحارة ومتوسطة الحرارة، ولكنها أيضا تتواجد بأعداد كبيرة في البيئات ذات الحرارة المنخفضة، على سبيل المثال البكتيريا القديمة شائعة في المحيطات الباردة مثل البحار القطبية.<ref>López-García P; López-López A; Moreira D; Rodríguez-Valera F (July 2001). "Diversity of free-living prokaryotes from a deep-sea site at the Antarctic Polar Front". ''FEMS Microbiol. Ecol.'' '''36''' (2–3): 193–202.[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11451524 11451524]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20160304055115/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11451524 |date=04 مارس 2016}}</ref> والأهم من ذلك أن هنالك أعداد كبيرة من البكتيريا القديمة موجودة في جميع محيطات العالم في المواطن غير القاسية بين العوالق (كجزء من picoplankton).<ref>Karner MB; DeLong EF; Karl DM (2001). "Archaeal dominance in the mesopelagic zone of the Pacific Ocean". ''Nature'' '''409''' (6819): 507–10.[[بيب كود]]:[http://adsabs.harvard.edu/abs/2001Natur.409..507K 2001Natur.409..507K]. <nowiki/>[[معرف الوثيقة الرقمي]]:.[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11206545 11206545]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20170909060011/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11206545 |date=09 سبتمبر 2017}}</ref> وعلى الرغم من
=== دورها في الدورات الكيميائية ===
سطر 208:
== الأهمية في التكنولوجيا والصناعة ==
DNA Polymerase في البكتيريا القديمة بايروكوكس فيوريوسس (''Pyrococcus'' ''furiosus'')، وأصبح بالمكان استخدام تفاعل البلمرة المتسلسل PCR في عمل الأبحاث كطريقة سهلة وسريعة لاستنساخ الحمض النووي الريبوزي منقوص
تدخل البكتيريا القديمة التي تعيش على درجة حرارة 100 سلسيوس في عالم الصناعة، مثل: الاميليز والجلاكتوسايدايز وبيولولنايز في انواع البكتيريا القديمة المنتمية لجنس البايروكوكس (Pyrococcus) التي لها دور في تصنيع الأغذية كإنتاج الحليب قليل اللاكتوز ومصل اللبن.
كما
بالرغم من تعدد الاستخدامات المستغلة للإنزيمات المتواجدة في البكتيريا القديمة
مجموعة جديدة من البكتيريا القديمة (archaeocins) تم اكتشافها مؤخرا لها فوائد محتملة كمضادات حيوية، وتنتمي هذه المجموعة إلى طائفة الهالواركيا (haloarchaea) التي تتحمل العيش في البيئات المالحة وإلى جنس السلفولوبس (Sulfolobus). تختلف الاركياسن في البنية، والتركيب عن المضادات الحيوية البكتيرية مما يجعل هناك احتمالية لقيامها بعمليات ايضية جديدة وإنتاج طرق جينية جديدة في التربية الانتقائية المستخدمة في علم الأحياء الجزيئية.
|