عتائق: الفرق بين النسختين

[نسخة منشورة][نسخة منشورة]
تم حذف المحتوى تمت إضافة المحتوى
Glory20 (نقاش | مساهمات)
لا ملخص تعديل
Glory20 (نقاش | مساهمات)
لا ملخص تعديل
سطر 68:
صنفت البكتيريا القديمة لاول مرة كمجموعة منفصلة من بدائيات النوى، في عام 1977 من قبل كارل ووز وجورج فوكس في أشجار النشوء على اساس تسلسل الحمض النووي للحمض النووي الرسول<ref>Woese C; Fox G (1977). [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC432104 "Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: the primary kingdoms"]. ''Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America'''''74''' (11): 5088–90. <nowiki/>[[بيب كود]]:[http://adsabs.harvard.edu/abs/1977PNAS...74.5088W 1977PNAS...74.5088W].[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد سنترال]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC432104 432104]. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/270744 270744] {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20180510210733/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC432104/ |date=10 مايو 2018}}</ref> و قد سميت هاتان المجموعات بالبكتيريا القديمة و البكتيريا الحقيقية على اساس أنها ممالك. لاحقا قال كارل ووز بان هذه المجموعة من بدائيات النوى هو نوع مختلف اختلافا جوهريا، وللتاكيد على هذا الاختلاف، اقترح كارل ووز في وقت لاحق نظام طبيعي جديد من الكائنات الحية مع ثلاث نطاقات منفصلة (حقيقيات النوى، البكتيريا، والبكتيريا القديمة) وقد سميت هذه الثورة بـ(الثورة الوزيانية)<ref>Woese CR; Kandler O; Wheelis ML (1990). [http://www.pnas.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=2112744 "Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya"]. ''Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America'' '''87''' (12): 4576–9.[[بيب كود]]:[http://adsabs.harvard.edu/abs/1990PNAS...87.4576W 1990PNAS...87.4576W].[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد سنترال]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC54159 54159]. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/2112744 2112744] {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20160411044637/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC54159/ |date=11 أبريل 2016}}</ref>.
 
في اللغة الإنجليزية , كلمة الاشياء القديمة اتية من اللغة اللاتينية القديمة حيث ان الممثلون الاوائل من مجال البكتيريا القديمة هي البكتيريا المنتجة للغاز الميثان حيث افترض العلماء ان عملية الايض لديهم تعكس الغلاف الجوي الارضي البدائي و العصور القديمة للكائنات الحية . لفترة طويلة عرف عن البكتيريا القديمة بانها لا توجد الا في البيئات القاسية مثل الينابيع الساخنة و البحيرات المالحة , لكن مع دراسة مواطن جديدة تم اكتشاف المزيد من البكتيريا القديمة مثل البكتيريا محبات الملوحة  <ref>Magrum LJ; Luehrsen KR; Woese CR (1978). "Are extreme halophiles actually "bacteria"?". ''J Mol Evol'' '''11''' (1): 1–10.[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/660662 660662] {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20161002000727/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/660662/ |date=02 أكتوبر 2016}}</ref> و البكتيريات الشديدة محبات للملوحة , بنهاية القرن العشرين شمل وجود البكتيريا القديمة البيئات الغير قاسية أيضا .
 
اليوم , العتائق معروفة بكونها مجموعة كبيرة و متنوعة من الكائنات الحية التي تم توزيعها على نطاق واسع في الطبيعة و شائعة في جميع البيئات . هذا التقدير و النتشار للبكتيريا القديمة اتى من (تفاعل البلمرة المتسلسل ) لكشف بدائيات النوى عن غيرها من العينات البدائية عن طريق تحليل الجينات الريبوسومية <ref>DeLong EF (1998). "Everything in moderation: archaea as 'non-extremophiles'". ''Current Opinion in Genetics & Development'' '''8''' (6): 649–54. <nowiki/>[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9914204 9914204]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20160306094844/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/9914204 |date=06 مارس 2016}}</ref>. هذا يسمح بالكشف و تحديد الكائنات التي لم يتم زراعتها في المختبر<ref>Theron J; Cloete TE (2000). "Molecular techniques for determining microbial diversity and community structure in natural environments". ''Crit. Rev. Microbiol.'' '''26''' (1): 37–57. <nowiki/>[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10782339 10782339]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20160307161217/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/10782339 |date=07 مارس 2016}}</ref><ref>Schmidt TM (2006). [http://www.im.microbios.org/0903/0903217.pdf "The maturing of microbial ecology"] (PDF). ''Int. Microbiol.'' '''9''' (3): 217–23. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17061212 17061212]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20161119044212/http://www.im.microbios.org/0903/0903217.pdf |date=19 نوفمبر 2016}}</ref>.
 
التصنيف الحالي :
 
تصنيف العتائق و بدائيات النوى بشكل عام , هو حقل مستمر ووراسع . وتهدف نظم التصنيف الحالية لتنظيم العتائق إلى مجموعات من الكائنات الحية التي تتشارك في السمات الهيكلية و الاسلاف المشتركة <ref>Gevers D; Dawyndt P; Vandamme P; et al. (2006). [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1764938 "Stepping stones towards a new prokaryotic taxonomy"].''Philosophical Transactions of the Royal Society B'' '''361''' (1475): 1911–6. <nowiki/>[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد سنترال]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1764938 1764938].[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17062410 17062410]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20160304091015/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17062410/ |date=04 مارس 2016}}</ref>.هذه التصنيفات تعتمد بشكل كبير على تسلسل جينات الحمض النووي الريبي الريباسي للكشف عن العلاقات بين الكائنات الحية ( علم الوراثة العرقي الجزيئي )<ref>Robertson CE; Harris JK; Spear JR; Pace NR (2005). "Phylogenetic diversity and ecology of environmental Archaea".''Current Opinion in Microbiology'' '''8''' (6): 638–42. <nowiki/>[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16236543 16236543]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20170906173924/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16236543 |date=06 سبتمبر 2017}}</ref> . العديد من الانواع من البكتيريا القديمة المزروعة و المتحقق منها تتضمن نوعين من الشعب الرئيسة ( البكتيريا القديمة العريضة )و( البكتيريا القديمة المصدرية ), وهناك مجموعات اخرى انشات مؤقتا , على سبيل المثال الانواع الغريبة مثل البكتيريا الصغروية وضعت في شعبة خاصة اسمها ( البكتيريا القديمة الصغروية )<ref>Huber H; Hohn MJ; Rachel R; Fuchs T; Wimmer VC; Stetter KO (2002). "A new phylum of Archaea represented by a nanosized hyperthermophilic symbiont". ''Nature'' '''417''' (6884): 27–8. <nowiki/>[[بيب كود]]:[http://adsabs.harvard.edu/abs/2002Natur.417...63H 2002Natur.417...63H]. <nowiki/>[[معرف الوثيقة الرقمي]]:.[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11986665 11986665]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20160919084859/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11986665 |date=19 سبتمبر 2016}}</ref> و هناك شعبة اخرى مثل البكتيريا القديمة الشابة التي تحتوي على مجموعة صغيرة من محبات الحرارة التي تتشارك صفات مشتركة من الشعبتين الرئيسيتين ولكنها اقرب للبكتيريا القديمة المصدرية<ref>Barns SM; Delwiche CF; Palmer JD; Pace NR (1996). [http://www.pnas.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=8799176 "Perspectives on archaeal diversity, thermophily and monophyly from environmental rRNA sequences"]. ''Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America''</ref> . اكتشفت انواع اخرى من البكتيريا القديمة التي ترتبط بشكل بعيد لاي من تلك الشعب , مثل (بكتيريا منجم ريتشموند المحبة للحموضة) التي اكتشفت في 2006 و هي من اصغر الكائنات الحية المعروفة<ref>Baker, B.J.; Tyson, G.W.; Webb, R.I.; Flanagan, J.; Hugenholtz, P. & Banfield, J.F. (2006). "Lineages of acidophilic Archaea revealed by community genomic analysis. Science". ''Science'' '''314''' (6884): 1933–1935.</ref> . الشعبة الاعلى من البكتيريا القديمة تتضمن البكتيريا القديمة العجيبة و البكتيريا القديمة الفجرية و البكتيريا القديمة المصدرية و البكتيريا القديمة الشابة , وهذه الشعبة قد تكون لها اصل لحقيقيات النوى.
 
مفهوم تحرير الانواع :
 
تصنيف البكتيريا القديمة امر مثير للجدل , و يعرفويعرف علم الاحياءالأحياء النوع إلى الكائنات الحية ذات الصلة. و هناكوهناك معنى اخرآخر للنوع بانه بأنه: الكائنات التي تستطيع التزاوج مع بعضها البعض و الانجاب , ووالإنجاب، لكنولكن لا يوجد اي فائدة للتعريف هذا لانلأن البكتيريا القديمة تتكاثر لاجنسيا <ref>de Queiroz K (2005). [http://www.pnas.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=15851674 "Ernst Mayr and the modern concept of species"]. ''Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America'' '''102''' (Suppl 1): 6600–7. <nowiki/>[[بيب كود]]:[http://adsabs.harvard.edu/abs/2005PNAS..102.6600D 2005PNAS..102.6600D].[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد سنترال]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1131873 1131873]. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15851674 15851674]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20140823063037/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1131873/ |date=23 أغسطس 2014}}</ref>. 
 
البكتيريا القديمة تظهر مستويات عالية من نقل الجينات العرضي بين الأنساب . و يرى بعض الباحثون انأن الافرادالأفراد يمكن تصنيفها إلى فئات سكانية حيث انأن الانواعالأنواع تكون متشابهة ,متشابهة، نظرا للتشابه للجينوم و نقلونقل الجينات من خلايا اقلأقل شبها ببعضها البعض كما في جنس ''[[Ferroplasma]]'' <ref>Eppley JM; Tyson GW; Getz WM; Banfield JF (2007). [http://www.genetics.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=17603112 "Genetic exchange across a species boundary in the archaeal genus ferroplasma"]. ''Genetics'' '''177''' (1): 407–16. <nowiki/>[[معرف الوثيقة الرقمي]]:. <nowiki/>[[ببمد سنترال]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2013692 2013692]. <nowiki/>[[ببمد]] [https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17603112 17603112]. {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20160306035757/http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17603112/ |date=06 مارس 2016}}</ref>''.''
 
من جهة اخرىأخرى , دراسات في ''[[Halorubrum]] و جدت نقل جيني كبير من و إلى جينومات إلى غير من السكان الاقلاأاقل صلة مما يحد من تطبيق هدا المعيارفيالمعيار في التصنيف , قلق اخرآخر هو انهأنه إلى ايأي حد يمكن ان تكون التسميات ملائمة و ذات معنى .''
 
== الشكل ==