لعب جعفر النميري دورادوراً اساسياأساسياً في انقاذإنقاذ حياة [[ياسر عرفات]] <ref>[http://www.ahram.org.eg/Archive/2004/11/12/AMAR21.HTM أبو عمار وداعا ـ من أسرار أيلول الأسود عام1970 إزاحة الستار لأول مرة عن عملية إخراج عرفات من عمان إليإلى القاهرة<!-- عنوان مولد بالبوت -->] {{Webarchive|url=http://web.archive.org/web/20161123164308/http://www.ahram.org.eg:80/Archive/2004/11/12/AMAR21.HTM |date=23 نوفمبر 2016}}</ref> خلال ما عرف باحداثبأحداث [[أيلول الأسود]] في عام 1970 عندما تراسترأس وفد القمة العربية وذهب إلى الأردن وكان معه [[الباهي الأدغم]] رئيس وزراء تونس آنذاك,آنذاك، والشيخوالشيخ [[سعد العبد الله الصباح]], ، وزيروزير الدفاع الكويتي آنذاك بالاضافةبالإضافة إليإلى الفريق [[محمد صادق]] وقد نجح يومها في اخراجإخراج ياسر عرفات من [[الأردن]] بعد انأن تنكرتَنَكَّر بزي امرأة ونقلهونَقَله بطائرته إلى [[القاهرة]] <ref>[https://www.youtube.com/watch?v=gd6FU7B5ezs نميري وعرفات في القاهرة سبتمبر 1970 - YouTube<!-- عنوان مولد بالبوت -->]</ref>