مستخدم:Ahmed Aboshama/أيض: الفرق بين النسختين
تم حذف المحتوى تمت إضافة المحتوى
أُنشئَت بترجمة الصفحة "Metabolism" |
أُنشئَت بترجمة الصفحة "Metabolism" |
||
سطر 22:
=== Nucleotides ===
The two nucleic acids, DNA and [[حمض نووي ريبوزي|RNA]], are polymers of [[نوكليوتيد|nucleotides]]. Each nucleotide is composed of a phosphate attached to a [[ريبوز|ribose]] or [[ريبوز منقوص الأكسجين|deoxyribose]] sugar group which is attached to a [[قاعدة نيتروجينية|nitrogenous base]]. Nucleic acids are critical for the storage and use of genetic information, and its interpretation through the processes of [[نسخ (وراثة)|transcription]] and [[اصطناع حيوي للبروتين|protein biosynthesis]].<ref name="Nelson" /> This information is protected by [[ترميم الدنا|DNA repair]] mechanisms and propagated through [[تضاعف الحمض النووي الريبوزي منقوص الأكسجين|DNA replication]]. Many [[فيروس|viruses]] have an [[فيروس حمض نووي ريبوزي|RNA genome]], such as [[فيروس العوز المناعي البشري|HIV]], which uses [[منتسخة عكسية|reverse transcription]] to create a DNA template from its viral RNA genome.<ref>{{cite journal|title=Basics of the virology of HIV-1 and its replication|journal=J Clin Virol|issue=4|year=2005|volume=34|pages=233–44|vauthors=Sierra S, Kupfer B, Kaiser R|pmid=16198625|doi=10.1016/j.jcv.2005.09.004}}</ref> RNA in [[إنزيم الحمض النووي الريبوزي|ribozymes]] such as [[جسيم التضفير|spliceosomes]] and [[ريبوسوم|ribosomes]] is similar to enzymes as it can catalyze chemical reactions. Individual [[نيوكليوسيد|nucleosides]] are made by attaching a [[قاعدة نووية|nucleobase]] to a [[ريبوز|ribose]] sugar. These bases are [[مركب حلقي غير متجانس|heterocyclic]] rings containing nitrogen, classified as [[بيورين|purines]] or [[بيريميدين|pyrimidines]]. Nucleotides also act as coenzymes in metabolic-group-transfer reactions.<ref name="Wimmer">{{cite journal|title=Mechanisms of enzyme-catalyzed group transfer reactions|journal=Annu Rev Biochem|issue=|year=1978|volume=47|pages=1031–78|vauthors=Wimmer M, Rose I|pmid=354490|doi=10.1146/annurev.bi.47.070178.005123}}</ref>
{{مرجع ويب
| url = http://www.etymonline.com/index.php?term=metabolism
| title = Metabolism
| publisher = The Online Etymology Dictionary
| accessdate = 2007-02-20
{{مرجع ويب
السطر 31 ⟵ 38:
=== Minerals and cofactors ===
Inorganic elements play critical roles in metabolism; some are abundant (e.g. [[صوديوم|sodium]] and [[بوتاسيوم|potassium]]) while others function at minute concentrations. About 99% of a mammal's mass is made up of the elements [[كربون|carbon]], [[نيتروجين|nitrogen]], [[كالسيوم|calcium]], [[صوديوم|sodium]], [[كلور|chlorine]], [[بوتاسيوم|potassium]], [[هيدروجين|hydrogen]], [[فسفور|phosphorus]], [[أكسجين|oxygen]] and [[كبريت|sulfur]].<ref name="Heymsfield">{{
== التقويض ==
▲|}
=== Digestion ===
[[جزيء ضخم|الجزيئات الضخمة]] مثل [[النشا]]، أو [[السليولوز]]، أو [[البروتينات]] لا يمكن استيعابها بسرعة بواسطة الخلايا ويجب تكسيرها لوحدات أصغر قبل استخدامها في أيض الخلية. العديد من فئنات الإنزيمات المشتركة تهضم تلك [[البوليمرات]]. تلك [[إنزيم هضمي|الإنزيمات الهضمية]] تشمل <nowiki/>[[ببتيداز]] الذي يهضم البروتينات إلى [[أحماض أمينية]]، بالإضافة إلى هيدروليزات الغلايكوسيد التي تهضم [[متعدد السكاريد|متعددات السكاريد]] إلى سكريات بسيطة تعرف باسم <nowiki/>[[سكر أحادي]].
تفرز الميكروبات ببساطة إنزيمات هضمية إلى البيئة المحيطة بها،<ref>{{Cite journal|url=http://mmbr.asm.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=8302217|title=Bacterial extracellular zinc-containing metalloproteases|date=December 1993|journal=Microbiol Rev|issue=4|DOI=10.1074/jbc.R600011200|year=2006|volume=57|pages=823–37|PMID=8302217}}تحقق من التاريخ في: <code style="color:inherit; border:inherit; padding:inherit;">|year= / |date= mismatch</code> ([[مساعدة:CS1 errors#bad date|مساعدة]])</ref><ref>{{Cite journal|title=Bacterial lipases: an overview of production, purification and biochemical properties|journal=Appl Microbiol Biotechnol|issue=6|DOI=10.1007/s00253-004-1568-8|year=2004|volume=64|pages=763–81|PMID=14966663}}</ref> بينما تستطيع الحيوانات إفراز تلك الإنزيمات فقط من خلايا متخصصة في [[قناة هضمية|قناتها الهضمية]] التي تشمل [[الغدد اللعابية]]، و<nowiki/>[[المعدة]]، و<nowiki/>[[البنكرياس]].<ref>{{Cite journal|title=The digestive system: linking theory and practice|journal=Br J Nurs|issue=22|year=1997|volume=6|pages=1285–91|PMID=9470654|last=Hoyle T}}</ref> الأحماض الأمينية، أو السكريات الناتجة عن تلك الإنزيمات يتم ضخها لداخل الخلايا بواسطة بروتينات [[النقل النشط]].<ref>{{Cite journal|title=How amino acids get into cells: mechanisms, models, menus, and mediators|journal=JPEN J Parenter Enteral Nutr|issue=6|DOI=10.1177/0148607192016006569|year=1992|volume=16|pages=569–78|PMID=1494216}}</ref><ref>{{Cite journal|title=Structure and function of facilitative sugar transporters|journal=Curr Opin Cell Biol|issue=4|DOI=10.1016/S0955-0674(99)80072-6|year=1999|volume=11|pages=496–502|PMID=10449337}}</ref>
[[ملف:Catabolism_schematic.svg|يمين|تصغير|مخطط مبسط لتقويض [[البروتينات]]، و<nowiki/>[[السكريات]]، و<nowiki/>[[الدهون]].]]
=== Energy from organic compounds ===
تقويض السكريات هو تكسير السكريات إلى وحدات أصغر. عادة ما يتم استيعاب السكريات لداخل الخلايا بمجرد أن يتم هضمها إلى [[سكريات أحادية]].<ref>{{Cite journal|title=Structure and function of mammalian facilitative sugar transporters|journal=J Biol Chem|issue=26|year=1993|volume=268|pages=19161–4|PMID=8366068}}</ref> بمجرد دخولها، الطريقة الأكبر للتحلل هي <nowiki/>[[تحلل الجلوكوز]]، والتي يتم فيها تحويل سكريات مثل [[الجلوكوز]] و<nowiki/>[[الفركتوز]] إلى <nowiki/>[[حمض البيروفيك]] مع توليد بعض جزيئات<nowiki/>[[ أدينوسين ثلاثي الفوسفات]] (ATP).<ref name="Bouche">{{Cite journal|url=http://edrv.endojournals.org/cgi/content/full/25/5/807|title=The cellular fate of glucose and its relevance in type 2 diabetes|journal=Endocr Rev|issue=5|DOI=10.1210/er.2003-0026|year=2004|volume=25|pages=807–30|PMID=15466941}}</ref> حمض البيروفيك هو مركب وسيط في العديد من المسارات الأيضية، لكن أغلبه يتم تحويله إلى [[أسيتيل مرافق الإنزيم-أ]] عن طريق تحلل الجلوكوز الهوائي ويتم تقديمه [[دورة حمض الستريك|لدورة حمض السيتريك]]. رغم أنه يتم توليد المزيد من ATP في دورة حمض الستريك، فإن المنتج الأهم هو NADH الذي يتم تصنيعه من NAD+ عند أكسدة أسيتيل مرافق الإنزيم-أ. تحرر [[الأكسدة]] ثنائي أكسيد الكربون كمخلف للتفاعل. في الظروف اللاهوائية، يُنتج تحلل الجلوكوز <nowiki/>[[حمض اللبنيك]]، عن طريق قيام <nowiki/>[[إنزيم نازع لهيدروجين اللاكتات]] بإعادة أكسدة NADH إلى NAD+ ليتم استخدامه مجددا في تحلل الجلوكوز. طريق بديل لتكسير الجلوكوز هو <nowiki/>[[مسار فوسفات البنتوز]]، الذي يختزل العامل المرافق <nowiki/>[[فوسفات ثنائي نيوكليوتيد الأدينين وأميد النيكوتين]] NADPH وينتج [[سكر خماسي (بنتوز)|سكريات خماسية]] مثل [[الريبوز]].
يتم تقويض الدهون عن طريق [[التحلل المائي]] إلى [[أحماض دهنية]] حرة و<nowiki/>[[غليسرول]]. يدخل الغليسرول في مسار تحلل الجلوكوز بينما يتم تكسير الأحماض الدهنية بواسطة <nowiki/>[[أكسدة الحمض الدهني]] لتحرير أسيتيل مرافق الإنزيم-أ، الذي يتم تقديمه لدورة حمض الستريك. تطلق الأحماض الدهنية طاقة أكبر من السكريات عند أكسدتها لأن السكريات تحتوي على أكسجين أكثر في تركيبها. يتم تحليل الستيرويدات أيضا في بعض البكتيريا في عملية مشابهة لأكسدة الحمض الدهني، وتشمل عملية التحلل تلك إطلاق كميات كبيرة من أسيتيل مرافق الإنزيم-أ، وبروبيونيل مرافق الإنزيم-أ، وحمض البيروفيك، والذين يمكن استخدامهم جميعا بواسطة الخلية كمصدر للطاقة. بكتيريا [[المتفطرة السلية]] يمكنها أن تنمو اعتمادا على [[الكولسترول]] كمصدر وحيد للكربون، وتم التحقق من صحة أن الجينات المشاركة في مسارات استهلاك الكولسترول مهمة خلال مراحل متنوعة من دورة حياة العدوى لبكتيريا المتفطرة السلية.<ref>{{Cite journal|title=Pathogen roid rage: Cholesterol utilization by ''Mycobacterium tuberculosis''|date=2014|journal=Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol.|issue=4|DOI=10.3109/10409238.2014.895700|volume=49|pages=269–93|PMID=24611808|last=Wipperman|first=Matthew, F.|first2=Suzanne, T.|last2=Thomas|first3=Nicole, S.|last3=Sampson}}</ref>
يتم استخدام [[الأحماض الأمينية]] إما لتصنيع البروتينات والجزيئات الحيوية الأخرى، وإما كمصدر للطاقة عن طريق أكسدتها إلى [[يوريا]] وثنائي أكسيد الكربون.<ref>{{Cite journal|title=Amino acid metabolism|journal=Annu Rev Biochem|DOI=10.1146/annurev.bi.32.070163.002035|year=1963|volume=32|pages=355–98|PMID=14144484}}</ref> يبدأ مسار الأكسدة بنزع مجموعة الأمين عن طريق <nowiki/>[[ناقلة الأمين]]. يتم تقديم مجموعة الأمين [[دورة اليوريا|لدورة اليوريا]]، ما يترك هيكل كربوني منزوع الكربون في صورة [[حمض كيتو]]. العديد من أحماض الكيتو تلك تعد مركبات وسيطة في [[دورة حمض الستريك]]، على سبيل المثال نزع الأمين من <nowiki/>[[حمض الجلوتاميك]] يكوِّن [[حمض ألفا كيتوجلوتاريك]].<ref>{{Cite journal|url=http://jn.nutrition.org/cgi/content/full/130/4/988S|title=Glutamate, at the interface between amino acid and carbohydrate metabolism|journal=J Nutr|issue=4S Suppl|year=2000|volume=130|pages=988S–90S|PMID=10736367|last=Brosnan J}}</ref> يمكن كذلك تحويل [[حمض أميني منتج للغلوكوز|الأحماض الأمينية المنتجة للجلوكوز]] إلى جلوكوز، من خلال <nowiki/>[[استحداث الجلوكوز]].<ref>{{Cite journal|url=http://jn.nutrition.org/cgi/content/full/131/9/2449S|title=Glutamine: the emperor or his clothes?|journal=J Nutr|issue=9 Suppl|year=2001|volume=131|pages=2449S–59S; discussion 2486S–7S|PMID=11533293}}</ref>
== تحويل الطاقة ==
السطر 187 ⟵ 178:
* Stryer, L. and (<span dir="rtl">ردمك <span dir="ltr">0-7167-4955-6</span></span>), ''The Chemistry of Life.'' (Penguin Press Science, 1999), Leroi, Armand Marie (2014). ''The Lagoon: How Aristotle Invented Science''. Bloomsbury. صفحات 400–401. ISBN 978-1-4088-3622-4.{{مرجع كتاب|title=The Lagoon: How Aristotle Invented Science|date=2014|publisher=Bloomsbury|ISBN=978-1-4088-3622-4|pages=400–401|last=Leroi, Armand Marie|author-link=Armand Marie Leroi}}
* Nelson, D. L. and
* {{Cite journal|title=Network analysis of metabolic enzyme evolution in Escherichia coli|journal=BMC Bioinformatics|DOI=10.1186/1471-2105-5-15|year=2004|volume=5|page=15|PMID=15113413}}, ''Oxygen: The Molecule that Made the World.'' (Oxford University Press, USA, 2004), {{Cite journal|title=Evolution of enzymes in metabolism: a network perspective|journal=J Mol Biol|issue=4|DOI=10.1016/S0022-2836(02)00546-6|year=2002|volume=320|pages=751–70|PMID=12095253|last=Rennie M}}
السطر 193 ⟵ 184:
* {{Cite journal|title=MANET: tracing evolution of protein architecture in metabolic networks|journal=BMC Bioinformatics|issue=12|DOI=10.1186/1471-2105-7-351|year=2006|volume=7|page=351|pages=1489–95|PMID=16854231|last=Phair R}}الوسيط <code style="color:inherit; border:inherit; padding:inherit;">|pages=</code> و <code style="color:inherit; border:inherit; padding:inherit;">|page=</code> تكرر أكثر من مرة ([[مساعدة:CS1 errors#redundant parameters|مساعدة]]) and {{Cite journal|title=Small-molecule metabolsim: an enzyme mosaic|journal=Trends Biotechnol|issue=12|DOI=10.1016/S0167-7799(01)01813-3|year=2001|volume=19|pages=482–6|PMID=11711174}}, ''Fundamentals of Enzymology: Cell and Molecular Biology of Catalytic Proteins.'' (Oxford University Press, 1999), {{Cite journal|url=http://www.pnas.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=16731630|title=A metabolic network in the evolutionary context: Multiscale structure and modularity|date=June 2006|journal=Proc Natl Acad Sci USA|issue=23|DOI=10.1073/pnas.0510258103|volume=103|pages=8774–9|bibcode=2006PNAS..103.8774S|PMID=16731630}}
* Williams, R. J. P.
* {{Cite journal|title=Chance and necessity in the evolution of minimal metabolic networks|journal=Nature|issue=7084|DOI=10.1038/nature04568|year=2006|volume=440|pages=667–70|bibcode=2006Natur.440..667P|PMID=16572170}} and {{Cite journal|url=http://orbit.dtu.dk/en/publications/from-genomes-to-in-silico-cells-via-metabolic-networks(9191950b-4f7e-4e4d-bd4d-2950c92ac5fe).html|title=From genomes to in silico cells via metabolic networks|journal=Curr Opin Biotechnol|issue=3|DOI=10.1016/j.copbio.2005.04.008|year=2005|volume=16|pages=350–5|PMID=15961036}}, ''Lehninger Principles of Biochemistry.'' (Palgrave Macmillan, 2004), {{Cite journal|title=Systems analyses characterize integrated functions of biochemical networks|journal=Trends Biochem Sci|issue=5|DOI=10.1016/j.tibs.2006.03.007|year=2006|volume=31|pages=284–91|PMID=16616498}}
* {{Cite journal|url=http://www.pnas.org/cgi/pmidlookup?view=long&pmid=17267599|title=Global reconstruction of the human metabolic network based on genomic and bibliomic data|date=February 2007|journal=Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.|issue=6|DOI=10.1073/pnas.0610772104|volume=104|pages=1777–82|bibcode=2007PNAS..104.1777D|PMID=17267599}} {{Cite journal|title=An introduction to the use of tracers in nutrition and metabolism|date=May 2007|journal=Proc Nutr Soc|issue=4|DOI=10.1017/S002966519900124X|year=1999|volume=58|pages=935–44|bibcode=2007PNAS..104.8685G|PMID=10817161}}تحقق من التاريخ في: <code style="color:inherit; border:inherit; padding:inherit;">|year= / |date= mismatch</code> ([[مساعدة:CS1 errors#bad date|مساعدة]]) {{Cite journal|url=http://www.pnas.org/lookup/pmid?view=long&pmid=18599447|title=Development of kinetic models in the nonlinear world of molecular cell biology|date=July 2008|journal=Metabolism|issue=12|DOI=10.1016/S0026-0495(97)90154-2|year=1997|volume=46|pages=1489–95|bibcode=2008PNAS..105.9880L|PMID=9439549}}تحقق من التاريخ في: <code style="color:inherit; border:inherit; padding:inherit;">|year= / |date= mismatch</code> ([[مساعدة:CS1 errors#bad date|مساعدة]]) and {{Cite journal|title=Santorio Sanctorius (1561–1636) – founding father of metabolic balance studies|journal=Am J Nephrol|issue=2|DOI=10.1159/000013455|year=1999|volume=19|pages=226–33|PMID=10213823|last=Eknoyan G}}, ''Brock's Biology of Microorganisms.'' (Benjamin Cummings, 2002), (<span dir="rtl">ردمك <span dir="ltr">0-13-066271-2</span></span>)
| |||