تبلغ مخطوطات الدار حوالي 57 ألف [[مخطوطة|مخطوط]] تعد من أنفس المجموعات وهي مرقمة ومفهرسة وتغطي تشكيلة واسعة من المواضيع، حيث تتميز بتنوع موضوعاتها وخطوطها المنسوبة ومخطوطاتها المؤرخة. كما تضم مجموعة نفيسة من [[أوراق البردي]] العربية من بينها مجموعة عُثر عليها في [[كوم أشقاأشقاو]]و بالصعيد تبلغ مجموعها ثلاث آلاف بردية تتعلق بعقود زواج وبيع وإيجار واستبدال وكشوف وسجلات وحسابات خاصة بالضرائب أو تقسيم مواريث أو دفع صداق وغيرها. وأقدم البرديات يعود لسنة [[87هـ]] ([[705]]م) ولم ينشر منها إلا 444 بردية. كما تحتوي الدار على مجموعة طيبة من الوثائق الرسمية التي تتمثل في حجج الوقف ووثائق الوزارات المختلفة وسجلات المحاكم وغيرها مما يعنى به الباحثون في شتى المباحث الأثرية والتاريخية. كما تمتلك الدار مجموعة طيبة من النقود العربية يعود أقدمها إلى سنة [[77هـ]] ([[696]]م).<ref name="مصر-خالدة"/> وتشمل مجموعاتها تشكيلة كبيرة من مخطوطات [[القرآن]] المكتوبة على الورق والجلد وبعضها في [[الخط الكوفي]] القديم غير المنقط وبعضها لخطاطين مشهورين. وهناك مجموعات من مخطوطات [[البردي]] من مختلف أنحاء [[مصر]] بعضها يعود [[قرن 7|للقرن السابع]] أو قبله. وهي منجم معلومات عن الحياة الاجتماعية والحضارية في مصر في بداية [[الإسلام]]. وفيها مجموعات [[الدولة العثمانية|عثمانية]] و[[فارسية]] قديمة أيضا.
