[[ملف:Citrobacter freundii.jpg|thumb|left |220px|سيتروباكتير فرويندي ، يعيش في الأمعاء]]
'''النبيت الجرثومي المعوي''' هو مجموعة [[الميكروبات]] الموجودة في [[الجهاز الهضمي]] الخاص بالإنسان والحيوانات الاخرىالأخرى, بما فيها الحشرات.<ref>[https://web.archive.org/web/20040526195616/http://www.gla.ac.uk/departments/humannutrition/students/resources/meden/Infection.pdf The normal gut flora.] Available through web archive. Accessed May 22, 2008</ref><ref>{{cite journal|vauthors=Pandey KR, Naik SR, Vakil BV|titleالعنوان=Probiotics, prebiotics and synbiotics- a review|journal=J Food Sci Technol.|yearالسنة=2015|volume=52|issue=12|pagesالصفحات=7577–87|type=Review|PMID=26604335|doi=10.1007/s13197-015-1921-1}}</ref><ref>{{Cite journal|lastالأخير=Alcock|firstالأول=Joe|yearالسنة=2014|titleالعنوان=Is eating behavior manipulated by the gastrointestinal microbiota? Evolutionary pressures and potential mechanisms|urlالمسار=http://onlinelibrary.wiley.com/store/10.1002/bies.201400071/asset/bies201400071.pdf?v=1&t=ixuo7p13&s=27a58ff52e5783c7fa31a6a095ea8d780ed57cec|journal=BioEssays|volume=|pagesالصفحات=|via=Wiley}}</ref>
في الإنسان, النبيت الجرثومي المعوي تضم أكبر عدد من البكتيريا وأكبر عدد من الأصناف مقارنة بمناطق أخرى في الجسم.(3) وتتكون الجراثيم المعوية في الانسانالإنسان بعد عام إلى عامين بعد ولادته, وفي غضون ذلك الوقت تتطو ركلاً من الأنسجةالمعويةالأنسجة المعوية الطلائية و الطبقةالمخاطيةالمعويةالطبقة المخاطية المعوية التي تفرزها بشكل يمّكنها من تحمّل, وتقدم الدعم للجراثيم المعوية التي أيضاً بدورها تقوم بتوفير حاجر حماية ضد الكائنات الحية الممرضة.(4)(5)
