تماثل كيميائي: الفرق بين النسختين

وتعد نظرية ''التماثل الكيميائي'' (أو ''التماثل الجزيئي'') واحدة من أهم المفاهيم في [[المعلوماتية الكيميائية]].<ref name="johnson_1990">{{مرجع كتاب | المؤلف = A. M. Johnson, G. M. Maggiora | العنوان = Concepts and Applications of Molecular Similarity | الناشر = John Willey &amp; Sons | مكانالمكان = New York | سنةالسنة = 1990 | الرقم المعياري = 0-471-62175-7}}</ref><ref name="nikolova_2003">{{cite journal | doi = 10.1002/qsar.200330831 | authorالمؤلف = N. Nikolova, J. Jaworska | titleالعنوان = Approaches to Measure Chemical Similarity - a Review | journal = QSAR &amp; Combinatorial Science | yearالسنة = 2003 | volume = 22 | issue = 9-10 | pagesالصفحات = 1006–1026}}</ref> وهي تلعب دورًا مهمًا في المناهج الحديثة للتنبؤ بخصائص المركبات الكيميائية وتصنيف المواد الكيميائية ذات الخصائص المحددة مسبقًا وأيضًا في إجراء الدراسات المعنية بتصنيف دواء معين من خلال فحص قواعد البيانات الضخمة التي تتضمن تركيبات المواد الكيميائية المتاحة (أو التي من المحتمل أن تكون متاحة). وتعتمد هذه الدراسات على مبدأ خاصية التماثل لجونسون (Johnson) وماجيورا (Maggiora) الذي ينص على أن: ''المركبات المتماثلة تتميز بخصائص متماثلة''.<ref name="johnson_1990"/>

يفترض الفحص الفعلي القائم على التماثل (نوع من الفحص الفعلي الذي يعتمد على اللجين) <ref name="SMSD09">S. A. Rahman, M. Bashton, G. L. Holliday, R. Schrader and J. M. Thornton, Small Molecule Subgraph Detector (SMSD) toolkit, Journal of Cheminformatics 2009, 1:12. {{doi|10.1186/1758-2946-1-12}}</ref> يفترض أن جميع المركبات في قاعدة البيانات المماثلة للمركب المُستعلم عنه لها نشاط بيولوجي مماثل. على الرغم من أن هذه الفرضية غير صحيحة دائمًا، <ref name="kubinyi_1998">{{cite journal | doi = 10.1023/A:1027221424359 | authorالمؤلف = H. Kubinyi | titleالعنوان = Similarity and Dissimilarity: A Medicinal Chemist’s View | journal = Persp. Drug Discov. Design | yearالسنة = 1998 | volume = 9-11 | pagesالصفحات = 225–252}}</ref> فإن مجموعة المركبات المستردة عادة ما تُخصب إلى حد كبير بعناصر نشطة.<ref name="martin_2002">{{cite journal | doi = 10.1021/jm020155c | authorالمؤلف = Y. C. Martin, J. L. Kofron, L. M. Traphagen | titleالعنوان = Do structurally similar molecules have similar biological activity? | journal = J. Med. Chem. | volume = 45 | issue = 19 | pagesالصفحات = 4350–4358 | pmid = 12213076 | yearالسنة = 2002}}</ref> ولتحقيق فاعلية كبيرة من الفحص القائم على التماثل في قواعد البيانات التي تحتوي على ملايين المركبات، فإن المركبات الجزيئية دائمًا ما يُشار إليها عن طريق ''الفحوصات الجزيئية'' (المفاتيح التركيبية) أو من خلال ''بصمات جزيئية'' ثابتة أو متغيرة الحجم. قد تحتوي الفحوصات والبصمات الجزيئية على معلومات ثنائية أو ثلاثية الأبعاد. ومع ذلك، فالبصمات ثنائية الأبعاد، التي تعتبر نوعًا من أنواع الأوصاف الثنائية المجزأة، تسيطر على هذه المنطقة. وتعتبر المفاتيح التركيبية التي تعتمد على التجزيء، مثل مفاتيح MDL <ref name="durant_2002">{{cite journal | authorالمؤلف = J. L. Durant, B. A. Leland, D. R. Henry, J. G. Nourse | titleالعنوان = Reoptimization of MDL Keys for Use in Drug Discovery | journal = J. Chem. Inf. Comput. Sci. | yearالسنة = 2002 | volume = 42 | issue = 6 | pagesالصفحات = 1273–1280 | pmid = 12444722}}</ref> تعتبر كافية بشكل كبير لمعالجة قواعد البيانات الكيميائية الصغيرة والمتوسطة، بينما يتم معالجة قواعد البيانات الكبيرة من خلال البصمات التي تتميز بكثافة معلوماتية كبيرة. تعد بصمات التجزيء الذي يعتمد على ضوء النهار، <ref name="daylight">{{مرجع ويب | العنوان = Daylight Chemical Information Systems Inc. | المسار = http://www.daylight.com}}</ref> وبصمات BCI,<ref name="bci">{{مرجع ويب | العنوان = Barnard Chemical Information Ltd. | المسار = http://www.bci.gb.com/}}</ref> وبصمات UNITY ثنائية الأبعاد (Tripos<ref name="tripos">{{مرجع ويب | العنوان = Tripos Inc. | المسار = http://www.tripos.com}}</ref>) هي أفضل الأمثلة المعروفة. وأكثر معايير التماثل شيوعًا لمقارنة التراكيب الكيميائية التي تُحدد من خلال البصمات هو معامل تانيموتو (أو جاكارد) ''T''. وفي الغالب يعتبر المركبان متماثلين إذا كان ''T'' > 0.85 (لبصمات ضوء النهار).