بعد فترةحياة حافلة بالأحداث العظيمة،الجسام، توفي الموفق في [[بغداد]] في القصر الحسني، وله تسع وأربعون سنة في خلافة أخيه المعتمد، وكان مصاباً بداء النقرس حتى إنه لم يكن قادراً على الركوب، فإتُخِذ لهُ سريرٌ عليهِ قبةٌ فكان يقعد عليه، ومعه خادمٌ يبرد رجله بالثلج.<ref>ـ ابن الأثير، الكامل في التاريخ (دار صادر، بيروت 1957م).ـ البلوي، سيرة أحمد بن طولون (مطبعة الترقي، دمشق 1358هـ).ـ ابن تغري، النجوم الزاهرة في ملوك مصر والقاهرة (دار الكتب، القاهرة 1351هـ).ـ الطبري، تاريخ الرسل والملوك (دار المعارف، القاهرة 1966م).ـ شاكر مصطفى، دولة بني العباس (وكالة المطبوعات، الكويت 1970م).</ref> ثم صارت علة رجله داء الفيل وكان يحمل سريره أربعون حمالًا يتناوب عليه عشرونعشرونَ عشرونعشرونَ وربما اشتد به أحيانًا فيأمرهم أن يضعوه فقالحتى قال لهم يومًا: قد ضجرتم وبودي أني واحد منكم أحمل على رأسي وآكل وأني في عافية قد أطبق دفتري على مائة ألف مرتزق أسوأ ما فيهم أقبح حالًا مني .
توفي بالقصر الحسني ليلة الخميس لثمان بقين من صفر عام 278 هجرية وله تسع وأربعون سنة تنقص شهرًا وأيامًا<ref>[http://www.islam-db.com/73880/content/sbsoid84104dio.php المنتظم في تاريخ الملوك والأمم - 4115]</ref>. وقد قال [[عبد الله بن المعتز]] : لما مات الموفق كتب إلي عبيد الله بن عبد الله بن طاهر يعزيني عنه فقال: إني أعزيك بالمنصور الثاني لأني لا أعرف في ولده أشبه به منه<ref>[http://www.islam-db.com/73880/content/sbsoid84104dio.php Islam-db ... / المنتظم في التاريخ ]</ref>.
