في عام 1949 علمعمل ماكارثر على تنحية قوة قوات التحالف وزيادة سيطرة القوة اليابانية على الدولة بالترافق مع توجه انتباهه [[حرب كورية|للحرب الكورية]] مبشرا بانتهاء الاحتلال. وكان توقيع [[معاهدة سلام سان فرانسيسكو]] في [[8 سبتمبر]] [[1951]] هو النهاية الرسمية للاحتلال الذي انتهى تأثيره في [[28 أبريل]] [[1952]] ورجعت معه اليابان كدولة مستقلة من جديد باستثناء أوكيناوا التي بقيت تحت السيطرة الأمريكية حتى 1972، و إيو جيما التي بقيت تحت السيطرة الأمريكية حتى [[1968]]. على الرغم من تواجد حوالي 47000 جندي أمريكي في اليابان اليوم إلا أنها لا تعتبر قوة احتلال بل هي قوات مدعوة رسمياً من الحكومة اليابانية تحت بنود اتفاقية التعاون الأمني المشترك بين اليابان والولايات المتحدة.
