تسلسل زلق
التسلسل الزلق (بالإنجليزية: Slippery sequence) هو تسلسل قصير (عادة UUUAAAC) يتحكم في معدل واحتمال حدوث انزياح الإطار الريبوسومي. يتسبب التسلسل الزلق في انتقالٍ ريبوسوميٍ أسرع والذي يمكن أن يسبب بدوره «انزلاقا» لإطار القراءة الذي يقوم الريبوسوم بقراءته. يسمح هذا للرنا الناقل بالانزياح بقاعدة واحدة (-1) نحو النهاية 5' بعد أن يكون الكودون المضاد الخاص به قد ارتبط مع كودونٍ من الرنا الرسول وهو ما يغير إطار القراءة.[2][3][4][5][6] يُعرف انزياح الإطار -1 الذي يسببه هذا التسلسل بانزياح الإطار الريبوسومي -1 المبرمج. يلي هذا التسلسل الزلق منطقة فاصلة وبنية رنا ثانوية وتواجده شائع لدى الفيروسات التي تشفر عديدات البروتين.[1]
يحدث انزياح الإطار بسبب ترابط ووبل. تعطي طاقة غيبس الحرة الخاصة بالبنى الثانوية التي تلي التسلسل تلميحا وفكرة عن معدل حدوث انزياح الإطار.[7] يلعب التوتر الحاصل في جزيء الرنا الرسول دورا في الانزياح كذلك.[8] قائمة بالتسلسلات الزلقة الموجودة لدى الحيوانات متوفرة في ورقة هوانغ وزملائه.[9]
التسلسلات الزلقة التي تسبب انزياحا بـ -2 قاعدة (انزياح إطار -2) تم إنشاؤها اعتمادا على تسلسل فيروس عوز المناعة البشري UUUUUUA .[8]
مراجع عدل
- ^ أ ب Jacks T، Madhani HD، Masiarz FR، Varmus HE (نوفمبر 1988). "Signals for ribosomal frameshifting in the Rous sarcoma virus gag-pol region". Cell. ج. 55 ع. 3: 447–58. DOI:10.1016/0092-8674(88)90031-1. PMC:7133365. PMID:2846182. S2CID:25672863.
- ^ Green L، Kim CH، Bustamante C، Tinoco I (يناير 2008). "Characterization of the mechanical unfolding of RNA pseudoknots". Journal of Molecular Biology. ج. 375 ع. 2: 511–28. DOI:10.1016/j.jmb.2007.05.058. PMC:7094456. PMID:18021801.
- ^ Yu CH، Noteborn MH، Olsthoorn RC (ديسمبر 2010). "Stimulation of ribosomal frameshifting by antisense LNA". Nucleic Acids Research. ج. 38 ع. 22: 8277–83. DOI:10.1093/nar/gkq650. PMC:3001050. PMID:20693527.
- ^ "Dr Ian Brierley Research description". Department of Pathology, University of Cambridge. مؤرشف من الأصل في 2013-10-02. اطلع عليه بتاريخ 2013-07-28.
- ^ "Molecular Biology: Frameshifting occurs at slippery sequences". Molecularstudy.blogspot.com. 16 أكتوبر 2012. مؤرشف من الأصل في 2021-03-29. اطلع عليه بتاريخ 2013-07-28.
- ^ Farabaugh PJ، Björk GR (مارس 1999). "How translational accuracy influences reading frame maintenance". The EMBO Journal. ج. 18 ع. 6: 1427–34. DOI:10.1093/emboj/18.6.1427. PMC:1171232. PMID:10075915.
- ^ Cao S، Chen SJ (مارس 2008). "Predicting ribosomal frameshifting efficiency". Physical Biology. ج. 5 ع. 1: 016002. Bibcode:2008PhBio...5a6002C. DOI:10.1088/1478-3975/5/1/016002. PMC:2442619. PMID:18367782.
- ^ أ ب Lin Z، Gilbert RJ، Brierley I (سبتمبر 2012). "Spacer-length dependence of programmed -1 or -2 ribosomal frameshifting on a U6A heptamer supports a role for messenger RNA (mRNA) tension in frameshifting". Nucleic Acids Research. ج. 40 ع. 17: 8674–89. DOI:10.1093/nar/gks629. PMC:3458567. PMID:22743270.
- ^ Huang X، Cheng Q، Du Z (2013). "A genome-wide analysis of RNA pseudoknots that stimulate efficient -1 ribosomal frameshifting or readthrough in animal viruses". BioMed Research International. ج. 2013: 984028. DOI:10.1155/2013/984028. PMC:3835772. PMID:24298557.
